MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae INCA 402 chromosome

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016783	AGCGA	2	10	2153	2162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016783	CCGCA	2	10	35315	35324	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_016783	TTTTG	2	10	56551	56560	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016783	GAAAA	2	10	58685	58694	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016783	GCCTA	2	10	72708	72717	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016783	CCGCA	2	10	85283	85292	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_016783	GGCCA	2	10	92184	92193	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016783	TCCAC	2	10	92354	92363	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
9	NC_016783	TGCAC	2	10	100192	100201	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016783	CGCAA	2	10	106697	106706	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016783	ACTGA	2	10	114378	114387	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016783	TAATT	2	10	135818	135827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016783	TTAGC	2	10	137871	137880	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016783	CACTG	2	10	165322	165331	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016783	TCCCG	2	10	194078	194087	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
16	NC_016783	GACGG	2	10	210081	210090	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016783	TTTGG	2	10	210826	210835	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016783	TAAAT	2	10	210938	210947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016783	CACGA	2	10	245627	245636	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016783	ATAAC	2	10	247791	247800	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016783	GAAAA	2	10	271187	271196	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016783	GCTTC	2	10	281340	281349	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016783	CCAGT	2	10	281509	281518	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016783	GATTT	2	10	281647	281656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016783	TTTGG	2	10	281965	281974	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016783	ATGTT	2	10	282049	282058	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016783	TCCTT	2	10	300151	300160	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016783	TGATG	2	10	301734	301743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016783	GTGCT	2	10	362300	362309	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016783	CACAC	2	10	364781	364790	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016783	TGAGA	2	10	389189	389198	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016783	TCTGC	2	10	392097	392106	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016783	GGAAA	2	10	417362	417371	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016783	GGACG	2	10	441704	441713	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016783	TTTCC	2	10	450685	450694	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016783	CCATT	2	10	450815	450824	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016783	GGGGT	2	10	455476	455485	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016783	CAGTG	2	10	463694	463703	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016783	AGGAA	2	10	478900	478909	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016783	ACGAT	2	10	522786	522795	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016783	TGATG	2	10	540480	540489	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016783	CACAA	2	10	547610	547619	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016783	TTTTG	2	10	552103	552112	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016783	TGTCT	2	10	552122	552131	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016783	CAGTT	2	10	562625	562634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016783	GTTTT	2	10	567825	567834	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016783	CTTTC	2	10	578045	578054	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016783	TGAGC	2	10	589347	589356	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016783	AGCCA	2	10	596915	596924	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016783	GCTGC	2	10	609875	609884	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016783	GGGAA	2	10	641261	641270	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016783	GCACC	2	10	647968	647977	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016783	GCGCT	2	10	697094	697103	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016783	CAACT	2	10	698578	698587	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016783	TCGTG	2	10	706973	706982	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016783	CGTCA	2	10	707309	707318	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016783	TGTTT	2	10	707485	707494	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016783	TGTGG	2	10	707544	707553	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016783	GGGAG	2	10	708380	708389	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016783	TGGCA	2	10	711000	711009	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016783	GGGGT	2	10	711358	711367	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016783	TAGTT	2	10	717389	717398	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016783	ATGCG	2	10	718535	718544	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016783	TAGTG	2	10	745308	745317	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016783	CCTGT	2	10	755587	755596	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_016783	CTTTC	2	10	768313	768322	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016783	TGGGG	2	10	770803	770812	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016783	TGCTG	2	10	792777	792786	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016783	TTTCC	2	10	806538	806547	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016783	GGAGG	2	10	808549	808558	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016783	GAAAG	2	10	840883	840892	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016783	GGAGT	2	10	847328	847337	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016783	TGGCG	2	10	849126	849135	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016783	TGCGG	2	10	923418	923427	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016783	GAGAA	2	10	969539	969548	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016783	GCACT	2	10	1005632	1005641	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016783	GCCTC	2	10	1029778	1029787	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
78	NC_016783	TGTGC	2	10	1038320	1038329	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016783	GATCG	2	10	1049637	1049646	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016783	AACCT	2	10	1050378	1050387	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016783	GATTC	2	10	1056087	1056096	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016783	CACTA	2	10	1064275	1064284	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016783	GTGCA	2	10	1086482	1086491	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016783	ACACT	2	10	1104442	1104451	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016783	CTTGG	2	10	1117781	1117790	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016783	CATTT	2	10	1127069	1127078	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016783	TCGTG	2	10	1133671	1133680	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016783	CGTCA	2	10	1134007	1134016	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016783	TGTTT	2	10	1134183	1134192	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016783	TGTGG	2	10	1134242	1134251	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016783	GGGAG	2	10	1135078	1135087	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016783	TGGCA	2	10	1137698	1137707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016783	GGCAT	2	10	1145246	1145255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016783	CTGGC	2	10	1172931	1172940	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016783	TGGCA	2	10	1173397	1173406	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016783	TTTTC	2	10	1173601	1173610	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016783	TTCGT	2	10	1224576	1224585	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016783	CCTAC	2	10	1228254	1228263	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_016783	CCTTA	2	10	1252178	1252187	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_016783	GCGCT	2	10	1274753	1274762	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016783	TCAAG	2	10	1288115	1288124	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016783	AAAAG	2	10	1296717	1296726	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016783	GCCAT	2	10	1309325	1309334	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016783	ACCGT	2	10	1309426	1309435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016783	CGACG	2	10	1330515	1330524	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016783	CAAAT	2	10	1333510	1333519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016783	AAAAT	2	10	1358095	1358104	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016783	GCTCA	2	10	1379144	1379153	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_016783	TTTAT	2	10	1392870	1392879	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016783	AATGT	2	10	1404338	1404347	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016783	AATTC	2	10	1407148	1407157	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016783	AGCAA	2	10	1418744	1418753	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016783	GAACG	2	10	1418852	1418861	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016783	TCTCT	2	10	1418942	1418951	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_016783	TGTTT	2	10	1431679	1431688	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016783	GCATT	2	10	1434389	1434398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016783	AGAAT	2	10	1463376	1463385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016783	CGTAA	2	10	1463496	1463505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016783	AGTGG	2	10	1472990	1472999	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016783	AATTG	2	10	1473054	1473063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016783	GCGCC	2	10	1473077	1473086	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_016783	CAGTA	2	10	1480314	1480323	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016783	CAAAA	2	10	1484855	1484864	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016783	CACAA	2	10	1517788	1517797	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016783	AAGTT	2	10	1541604	1541613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016783	GCAGC	2	10	1555915	1555924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016783	AGACA	2	10	1565323	1565332	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016783	AGCAC	2	10	1608317	1608326	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_016783	TTCGT	2	10	1611767	1611776	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016783	CTTTA	2	10	1633426	1633435	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016783	ACCAA	2	10	1648913	1648922	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016783	GCAAG	2	10	1651521	1651530	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016783	TTTAT	2	10	1680650	1680659	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016783	CGTTT	2	10	1682852	1682861	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016783	CATCT	2	10	1695175	1695184	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016783	TTAGG	2	10	1697098	1697107	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016783	AGCCA	2	10	1705806	1705815	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016783	AGAAA	2	10	1715143	1715152	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016783	TTCAA	2	10	1740190	1740199	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016783	AGCTG	2	10	1782864	1782873	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016783	GTGTG	2	10	1797632	1797641	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016783	GAACT	2	10	1797752	1797761	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_016783	CAACG	2	10	1803641	1803650	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_016783	CAACG	2	10	1820662	1820671	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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163	NC_016783	TCTGA	2	10	1956407	1956416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_016783	CCACC	2	10	2190832	2190841	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
185	NC_016783	GCGGG	2	10	2195586	2195595	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_016783	TACCC	2	10	2214538	2214547	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
188	NC_016783	TTCTA	2	10	2231480	2231489	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_016783	CACAT	2	10	2256556	2256565	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
190	NC_016783	TGGTG	2	10	2259370	2259379	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
191	NC_016783	GTTTG	2	10	2260245	2260254	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_016783	TGCCA	2	10	2315702	2315711	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
194	NC_016783	CTCCC	2	10	2318322	2318331	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
195	NC_016783	TGACG	2	10	2319393	2319402	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
196	NC_016783	CACGA	2	10	2319729	2319738	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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206	NC_016783	AGCCA	2	10	2401466	2401475	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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208	NC_016783	GCTTT	2	10	2408262	2408271	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
209	NC_016783	GGGTG	2	10	2416420	2416429	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
210	NC_016783	AAGGA	2	10	2442065	2442074	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
211	NC_016783	ACCGC	2	10	2447557	2447566	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
212	NC_016783	AAAAT	2	10	2448789	2448798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.