MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae 241 chromosome

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016782	TGTGA	2	10	19427	19436	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016782	GGTGG	2	10	40337	40346	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016782	GACCC	2	10	54627	54636	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_016782	CCCAA	2	10	54816	54825	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_016782	TCGTG	2	10	75804	75813	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016782	GAGCT	2	10	101721	101730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016782	TCCAC	2	10	108652	108661	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_016782	TGCAC	2	10	116513	116522	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016782	ACTGA	2	10	122997	123006	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016782	GTTTC	2	10	124659	124668	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016782	TAATT	2	10	144114	144123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016782	TTAGC	2	10	146167	146176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016782	TTGGT	2	10	178517	178526	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016782	CCGCC	2	10	198427	198436	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_016782	GCAGG	2	10	233317	233326	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016782	GCGGT	2	10	233327	233336	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016782	CACGA	2	10	242722	242731	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016782	ATAAC	2	10	244886	244895	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016782	GCGGT	2	10	265734	265743	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016782	GAAAA	2	10	268164	268173	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016782	GTCTC	2	10	280167	280176	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016782	TCCTT	2	10	290995	291004	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016782	TGATG	2	10	292580	292589	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016782	TTTTC	2	10	340788	340797	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016782	GTGCT	2	10	353117	353126	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016782	CACAC	2	10	355599	355608	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_016782	TCTGC	2	10	386483	386492	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016782	TATAA	2	10	418008	418017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016782	TGATG	2	10	436550	436559	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016782	TTTCC	2	10	444089	444098	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016782	CCATT	2	10	444218	444227	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016782	GGGGT	2	10	452128	452137	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016782	CAGTG	2	10	460346	460355	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016782	ATTTT	2	10	470794	470803	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016782	CGCTA	2	10	470917	470926	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016782	AGGAA	2	10	475609	475618	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016782	TGATG	2	10	536329	536338	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016782	TTTTG	2	10	547952	547961	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016782	TGTCT	2	10	547971	547980	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016782	GCCTT	2	10	556186	556195	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016782	GTTTT	2	10	563924	563933	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016782	CTTTC	2	10	572765	572774	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016782	TGAGC	2	10	584075	584084	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016782	AGCCA	2	10	591645	591654	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016782	GCTGC	2	10	604605	604614	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_016782	GGGAA	2	10	636010	636019	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016782	GCGCT	2	10	685166	685175	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016782	TCGTG	2	10	691166	691175	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016782	CGTCA	2	10	691502	691511	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016782	GGGAG	2	10	692569	692578	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016782	TGGCA	2	10	695191	695200	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016782	TGTGG	2	10	695374	695383	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016782	GGGGT	2	10	697571	697580	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016782	TAGTT	2	10	703591	703600	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016782	ATGCG	2	10	704713	704722	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016782	GTCCA	2	10	725597	725606	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016782	GGGGC	2	10	727998	728007	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016782	ATCCT	2	10	728162	728171	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016782	GTGAA	2	10	735489	735498	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016782	TTCAA	3	15	735520	735534	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016782	AATTT	2	10	735876	735885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016782	CCGGG	2	10	741112	741121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016782	TAGTG	2	10	748374	748383	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016782	CCTGT	2	10	758653	758662	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016782	TGTGG	2	10	768666	768675	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016782	CTTTC	2	10	771924	771933	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016782	TGGGG	2	10	774415	774424	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016782	TGCTG	2	10	796389	796398	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016782	TTTCC	2	10	810152	810161	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016782	GGAGG	2	10	812163	812172	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016782	TGCAA	2	10	843091	843100	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016782	AGTCG	2	10	843213	843222	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016782	ATTCG	2	10	843243	843252	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016782	GAAAG	2	10	844496	844505	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016782	AGCTG	2	10	880135	880144	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016782	TGATC	2	10	880489	880498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016782	CGGAA	2	10	909881	909890	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016782	GAGAA	2	10	973144	973153	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016782	GCACT	2	10	1009254	1009263	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016782	GCCTC	2	10	1033400	1033409	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_016782	GATCG	2	10	1053613	1053622	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016782	AACCT	2	10	1054354	1054363	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016782	GATTC	2	10	1060063	1060072	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016782	CACTA	2	10	1068251	1068260	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016782	CTGAC	2	10	1092293	1092302	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016782	ACACT	2	10	1114144	1114153	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016782	CTTGG	2	10	1127484	1127493	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016782	CATTT	2	10	1136772	1136781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016782	TCGTG	2	10	1143373	1143382	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016782	CGTCA	2	10	1143709	1143718	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016782	GGGAG	2	10	1144776	1144785	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016782	TGGCA	2	10	1147400	1147409	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016782	TTTTC	2	10	1147601	1147610	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016782	TTCGT	2	10	1198706	1198715	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016782	CCTAC	2	10	1202384	1202393	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_016782	CCTTA	2	10	1226309	1226318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_016782	TCAAG	2	10	1263816	1263825	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016782	AAGCC	2	10	1264143	1264152	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016782	AAAAG	2	10	1272420	1272429	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016782	GCCAT	2	10	1285025	1285034	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016782	ACCGT	2	10	1285126	1285135	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016782	CGACG	2	10	1306216	1306225	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016782	CAAAT	2	10	1309211	1309220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016782	AAAAT	2	10	1333795	1333804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016782	CGAGG	2	10	1351086	1351095	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016782	AATGG	2	10	1351582	1351591	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016782	AACGC	2	10	1351983	1351992	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016782	GCTCA	2	10	1354842	1354851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_016782	AAACA	2	10	1369694	1369703	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016782	TTTAT	2	10	1370691	1370700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016782	AATGT	2	10	1382258	1382267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016782	AGCAA	2	10	1398158	1398167	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016782	TGTTT	2	10	1411087	1411096	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016782	AGAAT	2	10	1442783	1442792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016782	CGTAA	2	10	1442903	1442912	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016782	AGTGG	2	10	1452405	1452414	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016782	AATTG	2	10	1452469	1452478	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016782	GCGCC	2	10	1452492	1452501	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
119	NC_016782	CAGTA	2	10	1459737	1459746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016782	AAGTT	2	10	1521142	1521151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016782	AAACC	2	10	1529901	1529910	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016782	TAACC	2	10	1532464	1532473	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_016782	GCAGC	2	10	1541040	1541049	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016782	AGACA	2	10	1549626	1549635	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016782	CATGG	2	10	1565535	1565544	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016782	AGCAC	2	10	1585382	1585391	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016782	CTTTA	2	10	1610495	1610504	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016782	ACCAA	2	10	1625982	1625991	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_016782	TTTAT	2	10	1657720	1657729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016782	CGTTT	2	10	1659937	1659946	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016782	ACAAG	2	10	1668391	1668400	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016782	TTTCA	2	10	1678979	1678988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016782	GAGTT	2	10	1680088	1680097	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016782	CATCT	2	10	1687632	1687641	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016782	TTAGG	2	10	1689555	1689564	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016782	ATCAC	2	10	1698765	1698774	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_016782	AGAAA	2	10	1707444	1707453	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016782	TTCAA	2	10	1732478	1732487	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016782	TGGCT	2	10	1789094	1789103	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016782	GTGTG	2	10	1790099	1790108	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016782	ATCTC	2	10	1790270	1790279	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_016782	CAACG	2	10	1809460	1809469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_016782	GAATC	2	10	1823864	1823873	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016782	TTTCT	2	10	1826588	1826597	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_016782	TTAAA	2	10	1997908	1997917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_016782	CTCCC	2	10	2141273	2141282	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
177	NC_016782	CACAC	2	10	2142106	2142115	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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179	NC_016782	CACGA	2	10	2142676	2142685	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
180	NC_016782	GGTCG	2	10	2148657	2148666	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
181	NC_016782	GTGCG	2	10	2167822	2167831	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
182	NC_016782	GACGA	2	10	2175614	2175623	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_016782	AATCG	2	10	2192489	2192498	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NC_016782	TACCC	2	10	2199223	2199232	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
187	NC_016782	TTCTA	2	10	2216375	2216384	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_016782	CACAT	2	10	2238796	2238805	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
189	NC_016782	CAAAC	2	10	2292302	2292311	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
190	NC_016782	TGCCA	2	10	2313459	2313468	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
191	NC_016782	CTCCC	2	10	2316083	2316092	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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193	NC_016782	TGACG	2	10	2317150	2317159	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
194	NC_016782	CACGA	2	10	2317486	2317495	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
195	NC_016782	AAAAG	2	10	2321446	2321455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_016782	TGGGT	2	10	2323828	2323837	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016782	GTACA	2	10	2323935	2323944	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
198	NC_016782	GCAGC	2	10	2349269	2349278	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
199	NC_016782	TCTAA	2	10	2350287	2350296	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
200	NC_016782	TCCTT	2	10	2367753	2367762	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
201	NC_016782	AAAAC	2	10	2377646	2377655	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
202	NC_016782	TGGTC	2	10	2379052	2379061	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
203	NC_016782	GCTTT	2	10	2385674	2385683	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
204	NC_016782	AAGGA	2	10	2419548	2419557	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
205	NC_016782	GCACA	2	10	2420758	2420767	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
206	NC_016782	ACCGC	2	10	2425037	2425046	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
207	NC_016782	AATGA	2	10	2426013	2426022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
208	NC_016782	AAAAT	2	10	2426269	2426278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.