MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 1303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016781	ACCAC	2	10	1693	1702	40 %	0 %	0 %	60 %	375287587
2	NC_016781	CACGC	2	10	5733	5742	20 %	0 %	20 %	60 %	375287591
3	NC_016781	TTATC	2	10	14084	14093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016781	ACGTA	2	10	14247	14256	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016781	CAGTA	2	10	14630	14639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016781	CAGTG	2	10	15501	15510	20 %	20 %	40 %	20 %	375287600
7	NC_016781	AAAAT	2	10	16761	16770	80 %	20 %	0 %	0 %	375287601
8	NC_016781	TAGCG	2	10	18329	18338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016781	CTTTT	2	10	19236	19245	0 %	80 %	0 %	20 %	375287605
10	NC_016781	GCTCT	2	10	19273	19282	0 %	40 %	20 %	40 %	375287605
11	NC_016781	TGGAT	2	10	23215	23224	20 %	40 %	40 %	0 %	375287611
12	NC_016781	TGCGT	2	10	24499	24508	0 %	40 %	40 %	20 %	375287612
13	NC_016781	CTGAT	2	10	28530	28539	20 %	40 %	20 %	20 %	375287616
14	NC_016781	GGAGC	2	10	29483	29492	20 %	0 %	60 %	20 %	375287617
15	NC_016781	TTGCT	2	10	30571	30580	0 %	60 %	20 %	20 %	375287618
16	NC_016781	TGAGG	2	10	37404	37413	20 %	20 %	60 %	0 %	375287622
17	NC_016781	CACAT	2	10	39588	39597	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016781	TGCGG	2	10	40521	40530	0 %	20 %	60 %	20 %	375287626
19	NC_016781	GCCTC	2	10	47299	47308	0 %	20 %	20 %	60 %	375287633
20	NC_016781	GAAGG	2	10	47313	47322	40 %	0 %	60 %	0 %	375287633
21	NC_016781	CAGTG	2	10	49244	49253	20 %	20 %	40 %	20 %	375287635
22	NC_016781	TGAGA	2	10	49586	49595	40 %	20 %	40 %	0 %	375287635
23	NC_016781	AGTGA	2	10	49636	49645	40 %	20 %	40 %	0 %	375287635
24	NC_016781	TTGGA	2	10	52672	52681	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016781	TTGAT	2	10	52707	52716	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016781	TGCAC	2	10	52801	52810	20 %	20 %	20 %	40 %	375287640
27	NC_016781	CTGGC	2	10	53060	53069	0 %	20 %	40 %	40 %	375287641
28	NC_016781	GCAGC	2	10	53559	53568	20 %	0 %	40 %	40 %	375287641
29	NC_016781	GACTG	2	10	53575	53584	20 %	20 %	40 %	20 %	375287641
30	NC_016781	AAGGC	2	10	55816	55825	40 %	0 %	40 %	20 %	375287643
31	NC_016781	ATGGC	2	10	58676	58685	20 %	20 %	40 %	20 %	375287647
32	NC_016781	ATGTG	2	10	62845	62854	20 %	40 %	40 %	0 %	375287651
33	NC_016781	TCTGT	2	10	64665	64674	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016781	GCTGG	2	10	65006	65015	0 %	20 %	60 %	20 %	375287653
35	NC_016781	AGGGA	2	10	67614	67623	40 %	0 %	60 %	0 %	375287656
36	NC_016781	AAGAT	2	10	69421	69430	60 %	20 %	20 %	0 %	375287658
37	NC_016781	GGAGC	2	10	69528	69537	20 %	0 %	60 %	20 %	375287658
38	NC_016781	GGTCT	2	10	71242	71251	0 %	40 %	40 %	20 %	375287660
39	NC_016781	CATGT	2	10	71818	71827	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016781	CAGCG	2	10	72698	72707	20 %	0 %	40 %	40 %	375287661
41	NC_016781	CAGGC	2	10	73104	73113	20 %	0 %	40 %	40 %	375287661
42	NC_016781	ATGGC	2	10	73949	73958	20 %	20 %	40 %	20 %	375287662
43	NC_016781	AGGCA	2	10	75269	75278	40 %	0 %	40 %	20 %	375287663
44	NC_016781	TAATT	2	10	76515	76524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016781	GCTTT	2	10	81110	81119	0 %	60 %	20 %	20 %	375287670
46	NC_016781	TGACC	2	10	81366	81375	20 %	20 %	20 %	40 %	375287670
47	NC_016781	CGTTA	2	10	82108	82117	20 %	40 %	20 %	20 %	375287671
48	NC_016781	TGCTG	2	10	82742	82751	0 %	40 %	40 %	20 %	375287671
49	NC_016781	TGGCC	2	10	84733	84742	0 %	20 %	40 %	40 %	375287672
50	NC_016781	GCGAC	2	10	85537	85546	20 %	0 %	40 %	40 %	375287672
51	NC_016781	TGGGA	2	10	88952	88961	20 %	20 %	60 %	0 %	375287678
52	NC_016781	GATCG	2	10	90051	90060	20 %	20 %	40 %	20 %	375287680
53	NC_016781	CAAAA	2	10	90783	90792	80 %	0 %	0 %	20 %	375287681
54	NC_016781	AACAA	2	10	93624	93633	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016781	TGCAA	2	10	96631	96640	40 %	20 %	20 %	20 %	375287686
56	NC_016781	TGCAG	2	10	96851	96860	20 %	20 %	40 %	20 %	375287686
57	NC_016781	AGGTC	2	10	99287	99296	20 %	20 %	40 %	20 %	375287689
58	NC_016781	ACCAA	2	10	101146	101155	60 %	0 %	0 %	40 %	375287689
59	NC_016781	TCATC	2	10	102409	102418	20 %	40 %	0 %	40 %	375287690
60	NC_016781	TGCAC	2	10	104224	104233	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016781	ACCTG	2	10	104439	104448	20 %	20 %	20 %	40 %	375287691
62	NC_016781	CGGTG	2	10	104648	104657	0 %	20 %	60 %	20 %	375287691
63	NC_016781	CGGCG	2	10	107267	107276	0 %	0 %	60 %	40 %	375287694
64	NC_016781	CGCGG	2	10	107327	107336	0 %	0 %	60 %	40 %	375287695
65	NC_016781	CAGCG	2	10	107863	107872	20 %	0 %	40 %	40 %	375287696
66	NC_016781	GGATC	2	10	118429	118438	20 %	20 %	40 %	20 %	375287706
67	NC_016781	TGTTT	2	10	120902	120911	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016781	CGGGA	2	10	125546	125555	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016781	GACTG	2	10	127807	127816	20 %	20 %	40 %	20 %	375287712
70	NC_016781	TTGGT	2	10	129116	129125	0 %	60 %	40 %	0 %	375287712
71	NC_016781	TTAAG	2	10	130900	130909	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016781	GTGCG	2	10	131440	131449	0 %	20 %	60 %	20 %	375287714
73	NC_016781	GTGGC	2	10	133177	133186	0 %	20 %	60 %	20 %	375287715
74	NC_016781	CGCGT	2	10	133497	133506	0 %	20 %	40 %	40 %	375287716
75	NC_016781	GGGGC	2	10	133625	133634	0 %	0 %	80 %	20 %	375287716
76	NC_016781	AGACG	2	10	135430	135439	40 %	0 %	40 %	20 %	375287718
77	NC_016781	GGGGC	2	10	135648	135657	0 %	0 %	80 %	20 %	375287719
78	NC_016781	ACGGT	2	10	136803	136812	20 %	20 %	40 %	20 %	375287720
79	NC_016781	CGATC	2	10	137076	137085	20 %	20 %	20 %	40 %	375287720
80	NC_016781	TGGCC	2	10	137283	137292	0 %	20 %	40 %	40 %	375287720
81	NC_016781	TGGTG	2	10	137661	137670	0 %	40 %	60 %	0 %	375287720
82	NC_016781	GGAGT	2	10	138133	138142	20 %	20 %	60 %	0 %	375287720
83	NC_016781	ATTGC	2	10	142067	142076	20 %	40 %	20 %	20 %	375287723
84	NC_016781	AAAAC	2	10	144893	144902	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016781	TCACT	2	10	145938	145947	20 %	40 %	0 %	40 %	375287728
86	NC_016781	ATTTC	2	10	146555	146564	20 %	60 %	0 %	20 %	375287728
87	NC_016781	AATGG	2	10	150255	150264	40 %	20 %	40 %	0 %	375287731
88	NC_016781	GTGAG	2	10	151238	151247	20 %	20 %	60 %	0 %	375287733
89	NC_016781	CTGAA	2	10	152036	152045	40 %	20 %	20 %	20 %	375287733
90	NC_016781	CCAGC	2	10	153328	153337	20 %	0 %	20 %	60 %	375287734
91	NC_016781	TTGCC	2	10	153838	153847	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016781	GTACC	2	10	155797	155806	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016781	TACGC	2	10	156354	156363	20 %	20 %	20 %	40 %	375287736
94	NC_016781	GCGAC	2	10	159848	159857	20 %	0 %	40 %	40 %	375287741
95	NC_016781	GGTTG	2	10	161124	161133	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016781	CCTTG	2	10	161500	161509	0 %	40 %	20 %	40 %	375287742
97	NC_016781	GCATA	2	10	163224	163233	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016781	TGTGC	2	10	164447	164456	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016781	CGGTG	2	10	165472	165481	0 %	20 %	60 %	20 %	375287745
100	NC_016781	CATGG	2	10	167605	167614	20 %	20 %	40 %	20 %	375287747
101	NC_016781	CAGAT	2	10	167961	167970	40 %	20 %	20 %	20 %	375287747
102	NC_016781	GGATG	2	10	168859	168868	20 %	20 %	60 %	0 %	375287747
103	NC_016781	GGGAC	2	10	171485	171494	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016781	CACTT	2	10	171665	171674	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016781	AAACT	2	10	172543	172552	60 %	20 %	0 %	20 %	375287750
106	NC_016781	ACCGG	2	10	172938	172947	20 %	0 %	40 %	40 %	375287750
107	NC_016781	ATTGA	2	10	178748	178757	40 %	40 %	20 %	0 %	375287754
108	NC_016781	GTGGA	2	10	181157	181166	20 %	20 %	60 %	0 %	375287756
109	NC_016781	TTAAG	2	10	184489	184498	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016781	TGACC	2	10	185407	185416	20 %	20 %	20 %	40 %	375287759
111	NC_016781	AGGTG	2	10	186360	186369	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016781	TTGCA	2	10	186693	186702	20 %	40 %	20 %	20 %	375287760
113	NC_016781	GTTTG	2	10	188632	188641	0 %	60 %	40 %	0 %	375287763
114	NC_016781	CGGAT	2	10	189572	189581	20 %	20 %	40 %	20 %	375287764
115	NC_016781	AGCGC	2	10	190730	190739	20 %	0 %	40 %	40 %	375287765
116	NC_016781	GCAGT	2	10	192217	192226	20 %	20 %	40 %	20 %	375287766
117	NC_016781	CAATG	2	10	192488	192497	40 %	20 %	20 %	20 %	375287766
118	NC_016781	TAACG	2	10	193463	193472	40 %	20 %	20 %	20 %	375287767
119	NC_016781	AAGCC	2	10	194790	194799	40 %	0 %	20 %	40 %	375287768
120	NC_016781	GGCCC	2	10	196862	196871	0 %	0 %	40 %	60 %	375287771
121	NC_016781	GAATT	2	10	200427	200436	40 %	40 %	20 %	0 %	375287776
122	NC_016781	CAAGG	2	10	201316	201325	40 %	0 %	40 %	20 %	375287776
123	NC_016781	GATGG	2	10	203765	203774	20 %	20 %	60 %	0 %	375287777
124	NC_016781	TGGCG	2	10	204499	204508	0 %	20 %	60 %	20 %	375287778
125	NC_016781	TGCCA	2	10	206522	206531	20 %	20 %	20 %	40 %	375287779
126	NC_016781	AAATA	2	10	206624	206633	80 %	20 %	0 %	0 %	375287779
127	NC_016781	ATTCT	2	10	207220	207229	20 %	60 %	0 %	20 %	375287780
128	NC_016781	CAGGC	2	10	212037	212046	20 %	0 %	40 %	40 %	375287782
129	NC_016781	TTGTA	2	10	212447	212456	20 %	60 %	20 %	0 %	375287783
130	NC_016781	GCGAC	2	10	216963	216972	20 %	0 %	40 %	40 %	375287788
131	NC_016781	AGATC	2	10	216988	216997	40 %	20 %	20 %	20 %	375287788
132	NC_016781	CAAGG	2	10	217902	217911	40 %	0 %	40 %	20 %	375287789
133	NC_016781	AGAAA	2	10	218631	218640	80 %	0 %	20 %	0 %	375287790
134	NC_016781	CGGGG	2	10	224665	224674	0 %	0 %	80 %	20 %	375287797
135	NC_016781	GAAAA	2	10	224804	224813	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016781	CGAGA	2	10	225444	225453	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_016781	GGTGG	2	10	451436	451445	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_016781	CGCAA	2	10	452899	452908	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_016781	GCTGT	2	10	453666	453675	0 %	40 %	40 %	20 %	375288023
269	NC_016781	CGATC	2	10	453794	453803	20 %	20 %	20 %	40 %	375288024
270	NC_016781	TGCGC	2	10	453937	453946	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
271	NC_016781	GACCT	2	10	455894	455903	20 %	20 %	20 %	40 %	375288026
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287	NC_016781	CTTTG	2	10	475160	475169	0 %	60 %	20 %	20 %	375288043
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305	NC_016781	CTTCT	2	10	511930	511939	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
306	NC_016781	GCGTC	2	10	512173	512182	0 %	20 %	40 %	40 %	375288076
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499	NC_016781	GCCTA	2	10	851280	851289	20 %	20 %	20 %	40 %	375288387
500	NC_016781	GTTAA	2	10	853725	853734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

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