MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 4947

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016781	TTCC	2	8	709	716	0 %	50 %	0 %	50 %	375287587
2	NC_016781	AGCC	2	8	856	863	25 %	0 %	25 %	50 %	375287587
3	NC_016781	ATGC	2	8	921	928	25 %	25 %	25 %	25 %	375287587
4	NC_016781	CAGG	2	8	1028	1035	25 %	0 %	50 %	25 %	375287587
5	NC_016781	TACG	2	8	1222	1229	25 %	25 %	25 %	25 %	375287587
6	NC_016781	GATG	2	8	1559	1566	25 %	25 %	50 %	0 %	375287587
7	NC_016781	TAAA	2	8	1828	1835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016781	GAAG	2	8	2427	2434	50 %	0 %	50 %	0 %	375287588
9	NC_016781	CCCA	2	8	2482	2489	25 %	0 %	0 %	75 %	375287588
10	NC_016781	CTGC	2	8	2767	2774	0 %	25 %	25 %	50 %	375287588
11	NC_016781	GAAA	2	8	3253	3260	75 %	0 %	25 %	0 %	375287588
12	NC_016781	TTAC	2	8	3396	3403	25 %	50 %	0 %	25 %	375287588
13	NC_016781	TCGT	2	8	3681	3688	0 %	50 %	25 %	25 %	375287589
14	NC_016781	AAGG	2	8	4837	4844	50 %	0 %	50 %	0 %	375287589
15	NC_016781	ATAC	2	8	5412	5419	50 %	25 %	0 %	25 %	375287590
16	NC_016781	ATGC	2	8	5814	5821	25 %	25 %	25 %	25 %	375287591
17	NC_016781	TCGC	2	8	8248	8255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016781	GAAA	2	8	8468	8475	75 %	0 %	25 %	0 %	375287593
19	NC_016781	ACTC	2	8	9475	9482	25 %	25 %	0 %	50 %	375287595
20	NC_016781	CAAC	2	8	9633	9640	50 %	0 %	0 %	50 %	375287595
21	NC_016781	GCAT	2	8	9728	9735	25 %	25 %	25 %	25 %	375287595
22	NC_016781	CACG	2	8	10759	10766	25 %	0 %	25 %	50 %	375287595
23	NC_016781	TTAG	2	8	11985	11992	25 %	50 %	25 %	0 %	375287596
24	NC_016781	TCGC	2	8	12463	12470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016781	GGAT	2	8	12473	12480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016781	TTCC	2	8	12740	12747	0 %	50 %	0 %	50 %	375287597
27	NC_016781	GCTA	2	8	12808	12815	25 %	25 %	25 %	25 %	375287597
28	NC_016781	GCCT	2	8	12827	12834	0 %	25 %	25 %	50 %	375287597
29	NC_016781	TTGT	2	8	13534	13541	0 %	75 %	25 %	0 %	375287598
30	NC_016781	GCCC	2	8	13684	13691	0 %	0 %	25 %	75 %	375287598
31	NC_016781	AGTG	2	8	13933	13940	25 %	25 %	50 %	0 %	375287598
32	NC_016781	TGGG	2	8	14427	14434	0 %	25 %	75 %	0 %	375287599
33	NC_016781	AATC	2	8	14957	14964	50 %	25 %	0 %	25 %	375287600
34	NC_016781	AAAG	2	8	15049	15056	75 %	0 %	25 %	0 %	375287600
35	NC_016781	AGCT	2	8	15348	15355	25 %	25 %	25 %	25 %	375287600
36	NC_016781	AAGG	2	8	15668	15675	50 %	0 %	50 %	0 %	375287600
37	NC_016781	TTTA	2	8	16065	16072	25 %	75 %	0 %	0 %	375287601
38	NC_016781	GCCA	2	8	16974	16981	25 %	0 %	25 %	50 %	375287602
39	NC_016781	GCTT	2	8	17831	17838	0 %	50 %	25 %	25 %	375287603
40	NC_016781	ACCG	2	8	18833	18840	25 %	0 %	25 %	50 %	375287604
41	NC_016781	CAAT	2	8	19219	19226	50 %	25 %	0 %	25 %	375287605
42	NC_016781	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016781	CGTG	2	8	20896	20903	0 %	25 %	50 %	25 %	375287606
44	NC_016781	TCCC	2	8	21083	21090	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_016781	TTCC	2	8	21948	21955	0 %	50 %	0 %	50 %	375287608
46	NC_016781	TACC	2	8	22256	22263	25 %	25 %	0 %	50 %	375287610
47	NC_016781	AGCG	2	8	23047	23054	25 %	0 %	50 %	25 %	375287611
48	NC_016781	TTGA	2	8	23236	23243	25 %	50 %	25 %	0 %	375287611
49	NC_016781	TCAT	2	8	23817	23824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016781	TGAT	2	8	23835	23842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016781	CCTG	2	8	24581	24588	0 %	25 %	25 %	50 %	375287612
52	NC_016781	GGTG	2	8	24975	24982	0 %	25 %	75 %	0 %	375287612
53	NC_016781	TGAG	2	8	25492	25499	25 %	25 %	50 %	0 %	375287613
54	NC_016781	GGTG	2	8	25685	25692	0 %	25 %	75 %	0 %	375287613
55	NC_016781	AATT	2	8	27657	27664	50 %	50 %	0 %	0 %	375287615
56	NC_016781	TGGA	2	8	27814	27821	25 %	25 %	50 %	0 %	375287615
57	NC_016781	GAAG	2	8	27969	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016781	GAAA	2	8	28630	28637	75 %	0 %	25 %	0 %	375287616
59	NC_016781	CTTC	2	8	28639	28646	0 %	50 %	0 %	50 %	375287616
60	NC_016781	AGAA	2	8	28671	28678	75 %	0 %	25 %	0 %	375287616
61	NC_016781	GCTA	2	8	29130	29137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016781	TGAG	2	8	29778	29785	25 %	25 %	50 %	0 %	375287618
63	NC_016781	GTAC	2	8	29979	29986	25 %	25 %	25 %	25 %	375287618
64	NC_016781	GATC	2	8	30588	30595	25 %	25 %	25 %	25 %	375287618
65	NC_016781	GGAA	2	8	31726	31733	50 %	0 %	50 %	0 %	375287619
66	NC_016781	TGGC	2	8	31988	31995	0 %	25 %	50 %	25 %	375287619
67	NC_016781	GGTT	2	8	32233	32240	0 %	50 %	50 %	0 %	375287619
68	NC_016781	CTGA	2	8	32265	32272	25 %	25 %	25 %	25 %	375287619
69	NC_016781	GGAC	2	8	33589	33596	25 %	0 %	50 %	25 %	375287620
70	NC_016781	GATA	2	8	34335	34342	50 %	25 %	25 %	0 %	375287620
71	NC_016781	TAAC	2	8	35724	35731	50 %	25 %	0 %	25 %	375287621
72	NC_016781	CAAG	2	8	35928	35935	50 %	0 %	25 %	25 %	375287621
73	NC_016781	CAGG	2	8	36343	36350	25 %	0 %	50 %	25 %	375287622
74	NC_016781	GCCC	2	8	36532	36539	0 %	0 %	25 %	75 %	375287622
75	NC_016781	TGGC	2	8	36652	36659	0 %	25 %	50 %	25 %	375287622
76	NC_016781	TGGT	2	8	37554	37561	0 %	50 %	50 %	0 %	375287623
77	NC_016781	GCTT	2	8	37802	37809	0 %	50 %	25 %	25 %	375287623
78	NC_016781	TACT	2	8	39037	39044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016781	AAGA	2	8	39119	39126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016781	TGCG	2	8	39569	39576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016781	AAAG	2	8	39902	39909	75 %	0 %	25 %	0 %	375287625
82	NC_016781	TAGA	2	8	40148	40155	50 %	25 %	25 %	0 %	375287625
83	NC_016781	TAAG	2	8	40288	40295	50 %	25 %	25 %	0 %	375287625
84	NC_016781	CAAG	2	8	40509	40516	50 %	0 %	25 %	25 %	375287626
85	NC_016781	GCTG	2	8	41457	41464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016781	GCTG	2	8	41557	41564	0 %	25 %	50 %	25 %	375287628
87	NC_016781	ATCA	2	8	41969	41976	50 %	25 %	0 %	25 %	375287628
88	NC_016781	ATGC	2	8	42353	42360	25 %	25 %	25 %	25 %	375287628
89	NC_016781	CCGG	2	8	43268	43275	0 %	0 %	50 %	50 %	375287629
90	NC_016781	CGCC	2	8	43866	43873	0 %	0 %	25 %	75 %	375287630
91	NC_016781	ATGC	2	8	43931	43938	25 %	25 %	25 %	25 %	375287630
92	NC_016781	AATG	2	8	44453	44460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016781	GGAA	3	12	44631	44642	50 %	0 %	50 %	0 %	375287631
94	NC_016781	AGCC	2	8	45560	45567	25 %	0 %	25 %	50 %	375287631
95	NC_016781	AAAT	2	8	46097	46104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016781	TTGC	2	8	47826	47833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016781	ATTA	2	8	47901	47908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016781	ATAC	2	8	48804	48811	50 %	25 %	0 %	25 %	375287635
99	NC_016781	TGCG	2	8	48916	48923	0 %	25 %	50 %	25 %	375287635
100	NC_016781	GTTT	2	8	50903	50910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016781	TCAT	2	8	51229	51236	25 %	50 %	0 %	25 %	375287637
102	NC_016781	ATCG	2	8	51465	51472	25 %	25 %	25 %	25 %	375287637
103	NC_016781	CGAT	2	8	51942	51949	25 %	25 %	25 %	25 %	375287638
104	NC_016781	ATGA	2	8	52076	52083	50 %	25 %	25 %	0 %	375287638
105	NC_016781	CTGG	2	8	52477	52484	0 %	25 %	50 %	25 %	375287639
106	NC_016781	ATGC	2	8	53798	53805	25 %	25 %	25 %	25 %	375287641
107	NC_016781	TGAT	2	8	54032	54039	25 %	50 %	25 %	0 %	375287641
108	NC_016781	CAAG	2	8	54117	54124	50 %	0 %	25 %	25 %	375287641
109	NC_016781	ACTT	2	8	54208	54215	25 %	50 %	0 %	25 %	375287641
110	NC_016781	CCGT	2	8	55312	55319	0 %	25 %	25 %	50 %	375287642
111	NC_016781	AGCA	2	8	55500	55507	50 %	0 %	25 %	25 %	375287643
112	NC_016781	GCGG	2	8	56579	56586	0 %	0 %	75 %	25 %	375287644
113	NC_016781	CGAC	2	8	56720	56727	25 %	0 %	25 %	50 %	375287645
114	NC_016781	CATC	2	8	57039	57046	25 %	25 %	0 %	50 %	375287645
115	NC_016781	GAGG	2	8	57252	57259	25 %	0 %	75 %	0 %	375287645
116	NC_016781	ATTG	2	8	57587	57594	25 %	50 %	25 %	0 %	375287645
117	NC_016781	TTGG	2	8	57812	57819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016781	AGGG	2	8	58576	58583	25 %	0 %	75 %	0 %	375287647
119	NC_016781	GCAC	2	8	59684	59691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016781	TGAC	2	8	59731	59738	25 %	25 %	25 %	25 %	375287648
121	NC_016781	CGTT	2	8	59978	59985	0 %	50 %	25 %	25 %	375287648
122	NC_016781	AAAC	2	8	60024	60031	75 %	0 %	0 %	25 %	375287648
123	NC_016781	TCAT	2	8	60272	60279	25 %	50 %	0 %	25 %	375287648
124	NC_016781	TGCT	2	8	60765	60772	0 %	50 %	25 %	25 %	375287649
125	NC_016781	GTGC	2	8	61176	61183	0 %	25 %	50 %	25 %	375287650
126	NC_016781	CGTA	2	8	61308	61315	25 %	25 %	25 %	25 %	375287650
127	NC_016781	CTTT	2	8	61446	61453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016781	ACCT	2	8	61937	61944	25 %	25 %	0 %	50 %	375287651
129	NC_016781	ATAC	2	8	62096	62103	50 %	25 %	0 %	25 %	375287651
130	NC_016781	CATG	2	8	62120	62127	25 %	25 %	25 %	25 %	375287651
131	NC_016781	GCGG	2	8	63097	63104	0 %	0 %	75 %	25 %	375287652
132	NC_016781	AACA	2	8	63128	63135	75 %	0 %	0 %	25 %	375287652
133	NC_016781	GATT	2	8	65399	65406	25 %	50 %	25 %	0 %	375287653
134	NC_016781	CCAG	2	8	66251	66258	25 %	0 %	25 %	50 %	375287654
135	NC_016781	GGTG	2	8	66467	66474	0 %	25 %	75 %	0 %	375287654
136	NC_016781	ATCC	2	8	66758	66765	25 %	25 %	0 %	50 %	375287654
137	NC_016781	GGCT	2	8	67995	68002	0 %	25 %	50 %	25 %	375287656
138	NC_016781	GCTG	2	8	68537	68544	0 %	25 %	50 %	25 %	375287657
139	NC_016781	CTTG	2	8	68862	68869	0 %	50 %	25 %	25 %	375287657
140	NC_016781	TCCA	2	8	69005	69012	25 %	25 %	0 %	50 %	375287657
141	NC_016781	AGTG	2	8	69224	69231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016781	GGTT	2	8	69742	69749	0 %	50 %	50 %	0 %	375287658
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