MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 3/99-5 chromosome

Total Repeats: 860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016781	TAAA	2	8	1828	1835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016781	TCGC	2	8	8248	8255	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016781	TCGC	2	8	12463	12470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016781	GGAT	2	8	12473	12480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016781	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016781	TCCC	2	8	21083	21090	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_016781	TCAT	2	8	23817	23824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016781	TGAT	2	8	23835	23842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016781	GAAG	2	8	27969	27976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016781	GCTA	2	8	29130	29137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016781	TACT	2	8	39037	39044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016781	AAGA	2	8	39119	39126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016781	TGCG	2	8	39569	39576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016781	GCTG	2	8	41457	41464	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016781	AATG	2	8	44453	44460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016781	AAAT	2	8	46097	46104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016781	TTGC	2	8	47826	47833	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016781	ATTA	2	8	47901	47908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016781	GTTT	2	8	50903	50910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016781	TTGG	2	8	57812	57819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016781	GCAC	2	8	59684	59691	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016781	CTTT	2	8	61446	61453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016781	AGTG	2	8	69224	69231	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016781	ATGA	2	8	71840	71847	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016781	GGAA	2	8	74787	74794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016781	TAAT	2	8	76535	76542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016781	TCCT	2	8	79262	79269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016781	TGGG	2	8	85983	85990	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016781	CTTT	2	8	86067	86074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016781	TCTT	2	8	90268	90275	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016781	TCTT	2	8	105019	105026	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016781	GAGG	2	8	113684	113691	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016781	TACC	2	8	117323	117330	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016781	GAAT	2	8	117350	117357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016781	GGCA	2	8	117360	117367	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016781	TCCT	2	8	121311	121318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016781	TCTT	2	8	121515	121522	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016781	TTGG	2	8	124469	124476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016781	GCCG	2	8	124905	124912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016781	GGCA	2	8	124914	124921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016781	ATTT	2	8	127501	127508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016781	TGTT	2	8	129848	129855	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016781	ACGC	2	8	132049	132056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016781	TAAG	2	8	132106	132113	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016781	GGTG	2	8	132414	132421	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016781	TGGA	2	8	132516	132523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016781	TGCG	2	8	141066	141073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016781	CAAA	2	8	150088	150095	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016781	GCCC	2	8	154010	154017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_016781	CTGC	2	8	154147	154154	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016781	TTCC	2	8	155768	155775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016781	ATGC	2	8	157262	157269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016781	ATCA	2	8	160750	160757	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016781	ATAC	2	8	160823	160830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016781	CAGG	2	8	160843	160850	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016781	GTAG	2	8	160957	160964	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016781	CGGC	2	8	163124	163131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016781	TTTG	2	8	164289	164296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016781	ATGC	2	8	164315	164322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016781	GATG	2	8	169205	169212	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016781	TGTT	2	8	169279	169286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016781	GAGG	2	8	171223	171230	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016781	TGCT	2	8	171237	171244	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016781	AAAT	2	8	171516	171523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016781	GGAC	2	8	171778	171785	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016781	ATAG	2	8	175244	175251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016781	AGCC	2	8	184510	184517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016781	ATCT	2	8	186385	186392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016781	CAGT	2	8	195187	195194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016781	ATGG	2	8	196773	196780	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016781	TCAC	2	8	202810	202817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016781	CTTT	2	8	208076	208083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016781	TCAC	2	8	208254	208261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016781	ATCT	2	8	208439	208446	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016781	ACGA	2	8	208546	208553	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016781	TGAT	2	8	209159	209166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016781	ATTG	2	8	209350	209357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016781	CAAA	2	8	210507	210514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016781	CGAA	2	8	210602	210609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016781	GTTC	2	8	214648	214655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016781	GTCC	2	8	215882	215889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016781	TAGA	2	8	223078	223085	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016781	GCCC	2	8	224908	224915	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_016781	GTCT	2	8	225265	225272	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016781	TTCA	2	8	236050	236057	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016781	TCCT	2	8	238056	238063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016781	GATA	2	8	238171	238178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016781	GTAG	2	8	238185	238192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016781	CCTA	2	8	238214	238221	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016781	AGCC	2	8	241132	241139	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016781	TTTA	2	8	243414	243421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016781	CGCC	2	8	251252	251259	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_016781	AGTT	2	8	252415	252422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016781	TAAA	2	8	252549	252556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016781	TGCT	2	8	253005	253012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016781	GGGA	2	8	253084	253091	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016781	ACTC	2	8	260154	260161	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016781	ATGA	2	8	260626	260633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016781	ATTA	2	8	260689	260696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016781	GAAT	2	8	265304	265311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016781	TATT	2	8	267856	267863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016781	AAAT	2	8	280802	280809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016781	GTTC	2	8	280868	280875	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016781	GCGG	2	8	281328	281335	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016781	TCCC	2	8	287130	287137	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_016781	ATCA	2	8	293377	293384	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016781	GCTT	2	8	293420	293427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016781	CTCG	2	8	294514	294521	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016781	AAGG	2	8	294560	294567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016781	CTGA	2	8	305479	305486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016781	GCTG	2	8	310683	310690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016781	ATCG	2	8	312290	312297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016781	TGCC	2	8	313515	313522	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016781	CGGT	2	8	315256	315263	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016781	CCTT	2	8	319852	319859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016781	GCTT	2	8	322057	322064	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016781	GACC	2	8	325273	325280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016781	TGCT	2	8	325859	325866	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016781	TTAT	2	8	327857	327864	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016781	AGGA	2	8	329278	329285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016781	AGCG	2	8	333234	333241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016781	TGCC	2	8	333318	333325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016781	GTAT	2	8	339065	339072	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016781	AGTA	2	8	348997	349004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016781	CAGT	2	8	353679	353686	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016781	GAAT	2	8	355796	355803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016781	GCTT	2	8	356330	356337	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016781	TGGT	2	8	356407	356414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016781	AGTG	2	8	357679	357686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016781	TCCT	2	8	359910	359917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016781	GCCG	2	8	359991	359998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016781	ATTA	2	8	376793	376800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016781	ATTA	2	8	379091	379098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016781	AAGA	2	8	382308	382315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016781	TTAA	2	8	383492	383499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016781	CTTT	2	8	383924	383931	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016781	AGCG	2	8	385282	385289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016781	TCGC	2	8	397307	397314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016781	ACTA	2	8	397317	397324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016781	CTTG	2	8	397504	397511	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016781	TTTA	2	8	397811	397818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016781	TGAA	2	8	400174	400181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016781	ATTG	2	8	400242	400249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016781	CATG	2	8	400502	400509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016781	GCTG	2	8	400809	400816	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016781	CATC	2	8	401094	401101	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016781	TCCG	2	8	404754	404761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016781	GGGA	2	8	418789	418796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016781	AGGC	2	8	419475	419482	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016781	CTGG	2	8	419718	419725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016781	AGAC	2	8	419733	419740	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_016781	CGCC	2	8	1473472	1473479	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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