MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brucella canis HSK A52141 chromosome 1

Total Repeats: 1598

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016778	AGGGC	2	10	986	995	20 %	0 %	60 %	20 %	376274178
2	NC_016778	CACAG	2	10	999	1008	40 %	0 %	20 %	40 %	376274178
3	NC_016778	GGCGG	2	10	1080	1089	0 %	0 %	80 %	20 %	376274178
4	NC_016778	GGGGC	2	10	1687	1696	0 %	0 %	80 %	20 %	376274179
5	NC_016778	TTGCG	2	10	2588	2597	0 %	40 %	40 %	20 %	376274179
6	NC_016778	GCGTC	2	10	3731	3740	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016778	TTTCT	2	10	4448	4457	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016778	ATGAG	2	10	4640	4649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016778	CCATG	2	10	5447	5456	20 %	20 %	20 %	40 %	376274181
10	NC_016778	GGGGA	2	10	5850	5859	20 %	0 %	80 %	0 %	376274181
11	NC_016778	GGGCA	2	10	7449	7458	20 %	0 %	60 %	20 %	376274183
12	NC_016778	TTCGT	2	10	7971	7980	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016778	TGGTG	2	10	9668	9677	0 %	40 %	60 %	0 %	376274186
14	NC_016778	CGGCA	2	10	10062	10071	20 %	0 %	40 %	40 %	376274187
15	NC_016778	ATCTT	2	10	13120	13129	20 %	60 %	0 %	20 %	376274189
16	NC_016778	TGCCG	2	10	14262	14271	0 %	20 %	40 %	40 %	376274190
17	NC_016778	CGACA	2	10	14277	14286	40 %	0 %	20 %	40 %	376274190
18	NC_016778	AAAAT	2	10	15658	15667	80 %	20 %	0 %	0 %	376274191
19	NC_016778	TAGAA	2	10	15727	15736	60 %	20 %	20 %	0 %	376274191
20	NC_016778	CTTCG	2	10	16412	16421	0 %	40 %	20 %	40 %	376274193
21	NC_016778	ATGAA	2	10	16494	16503	60 %	20 %	20 %	0 %	376274193
22	NC_016778	CCGCG	2	10	17519	17528	0 %	0 %	40 %	60 %	376274194
23	NC_016778	GCGCC	2	10	18224	18233	0 %	0 %	40 %	60 %	376274194
24	NC_016778	TGCGG	2	10	19728	19737	0 %	20 %	60 %	20 %	376274197
25	NC_016778	GCGGT	2	10	19754	19763	0 %	20 %	60 %	20 %	376274197
26	NC_016778	TGGGC	2	10	21600	21609	0 %	20 %	60 %	20 %	376274198
27	NC_016778	GGCCC	2	10	22756	22765	0 %	0 %	40 %	60 %	376274199
28	NC_016778	CGGCG	2	10	23392	23401	0 %	0 %	60 %	40 %	376274200
29	NC_016778	CGGCA	2	10	24621	24630	20 %	0 %	40 %	40 %	376274201
30	NC_016778	TCGAC	2	10	25016	25025	20 %	20 %	20 %	40 %	376274201
31	NC_016778	TTCTG	2	10	25233	25242	0 %	60 %	20 %	20 %	376274201
32	NC_016778	TCAAC	2	10	27230	27239	40 %	20 %	0 %	40 %	376274202
33	NC_016778	ATTTT	2	10	27706	27715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016778	CTTTT	2	10	27889	27898	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016778	CCCTG	2	10	29195	29204	0 %	20 %	20 %	60 %	376274204
36	NC_016778	GCCCG	2	10	31316	31325	0 %	0 %	40 %	60 %	376274207
37	NC_016778	GCGCC	2	10	31561	31570	0 %	0 %	40 %	60 %	376274207
38	NC_016778	GTTCC	2	10	31604	31613	0 %	40 %	20 %	40 %	376274207
39	NC_016778	GCCCT	2	10	32243	32252	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016778	GCGAT	2	10	33135	33144	20 %	20 %	40 %	20 %	376274208
41	NC_016778	TCAAT	2	10	33735	33744	40 %	40 %	0 %	20 %	376274208
42	NC_016778	CGTTG	2	10	35220	35229	0 %	40 %	40 %	20 %	376274209
43	NC_016778	TCGCT	2	10	37093	37102	0 %	40 %	20 %	40 %	376274211
44	NC_016778	TAAAA	2	10	37169	37178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016778	GATCG	2	10	37670	37679	20 %	20 %	40 %	20 %	376274212
46	NC_016778	TGGGG	2	10	37846	37855	0 %	20 %	80 %	0 %	376274212
47	NC_016778	TAAAA	2	10	39132	39141	80 %	20 %	0 %	0 %	376274214
48	NC_016778	ATCAT	2	10	39199	39208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016778	CCGCG	2	10	41220	41229	0 %	0 %	40 %	60 %	376274217
50	NC_016778	ACCGA	2	10	45029	45038	40 %	0 %	20 %	40 %	376274218
51	NC_016778	TCGTG	2	10	46613	46622	0 %	40 %	40 %	20 %	376274220
52	NC_016778	GCCCC	2	10	47201	47210	0 %	0 %	20 %	80 %	376274221
53	NC_016778	CAGCC	2	10	48042	48051	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_016778	CGCTG	2	10	50444	50453	0 %	20 %	40 %	40 %	376274222
55	NC_016778	CTGAA	2	10	50455	50464	40 %	20 %	20 %	20 %	376274222
56	NC_016778	GCCGC	2	10	51783	51792	0 %	0 %	40 %	60 %	376274223
57	NC_016778	TTTGT	2	10	52476	52485	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016778	TGGCT	2	10	55762	55771	0 %	40 %	40 %	20 %	376274227
59	NC_016778	GGTCC	2	10	56902	56911	0 %	20 %	40 %	40 %	376274228
60	NC_016778	TCCGA	2	10	57201	57210	20 %	20 %	20 %	40 %	376274228
61	NC_016778	TTTGT	2	10	57379	57388	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016778	TGCCC	2	10	57630	57639	0 %	20 %	20 %	60 %	376274229
63	NC_016778	TTCAT	2	10	59243	59252	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016778	GCCGC	3	15	62037	62051	0 %	0 %	40 %	60 %	376274237
65	NC_016778	GCTCA	2	10	63579	63588	20 %	20 %	20 %	40 %	376274237
66	NC_016778	GCGCG	2	10	68430	68439	0 %	0 %	60 %	40 %	376274240
67	NC_016778	TATTT	2	10	69069	69078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016778	CTATC	2	10	70425	70434	20 %	40 %	0 %	40 %	376274242
69	NC_016778	AAGGC	2	10	71892	71901	40 %	0 %	40 %	20 %	376274244
70	NC_016778	TCGCT	2	10	72666	72675	0 %	40 %	20 %	40 %	376274244
71	NC_016778	GCGCG	2	10	73387	73396	0 %	0 %	60 %	40 %	376274244
72	NC_016778	CTGCA	2	10	74442	74451	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_016778	CGCAA	2	10	74462	74471	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016778	TCACC	2	10	76416	76425	20 %	20 %	0 %	60 %	376274246
75	NC_016778	CCGGG	2	10	77364	77373	0 %	0 %	60 %	40 %	376274246
76	NC_016778	CGGGC	2	10	77377	77386	0 %	0 %	60 %	40 %	376274246
77	NC_016778	TGCGC	2	10	79085	79094	0 %	20 %	40 %	40 %	376274248
78	NC_016778	CGGCG	2	10	81711	81720	0 %	0 %	60 %	40 %	376274250
79	NC_016778	TTGCC	2	10	83156	83165	0 %	40 %	20 %	40 %	376274253
80	NC_016778	GGTGA	2	10	84716	84725	20 %	20 %	60 %	0 %	376274255
81	NC_016778	TGAAG	2	10	85921	85930	40 %	20 %	40 %	0 %	376274256
82	NC_016778	CATTC	2	10	87400	87409	20 %	40 %	0 %	40 %	376274257
83	NC_016778	GGCCA	2	10	87533	87542	20 %	0 %	40 %	40 %	376274257
84	NC_016778	GGTGC	2	10	89736	89745	0 %	20 %	60 %	20 %	376274260
85	NC_016778	CCTGT	2	10	91720	91729	0 %	40 %	20 %	40 %	376274262
86	NC_016778	CGCAT	2	10	92242	92251	20 %	20 %	20 %	40 %	376274262
87	NC_016778	CGCCT	2	10	94789	94798	0 %	20 %	20 %	60 %	376274264
88	NC_016778	TGATC	2	10	97103	97112	20 %	40 %	20 %	20 %	376274267
89	NC_016778	TGCGG	2	10	97512	97521	0 %	20 %	60 %	20 %	376274267
90	NC_016778	TTGCC	2	10	97694	97703	0 %	40 %	20 %	40 %	376274267
91	NC_016778	GTCAT	2	10	100771	100780	20 %	40 %	20 %	20 %	376274270
92	NC_016778	TGCGG	2	10	102051	102060	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016778	GCGTG	2	10	103340	103349	0 %	20 %	60 %	20 %	376274274
94	NC_016778	TAGAC	2	10	104023	104032	40 %	20 %	20 %	20 %	376274275
95	NC_016778	CCAAA	2	10	104061	104070	60 %	0 %	0 %	40 %	376274275
96	NC_016778	GATGG	2	10	105944	105953	20 %	20 %	60 %	0 %	376274276
97	NC_016778	TGGAC	2	10	109130	109139	20 %	20 %	40 %	20 %	376274278
98	NC_016778	ATTGA	2	10	109368	109377	40 %	40 %	20 %	0 %	376274278
99	NC_016778	TCGCA	2	10	109678	109687	20 %	20 %	20 %	40 %	376274279
100	NC_016778	CAGCG	2	10	111066	111075	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016778	AAGGA	2	10	111440	111449	60 %	0 %	40 %	0 %	376274282
102	NC_016778	GCTTG	2	10	114133	114142	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016778	TGCGC	2	10	114208	114217	0 %	20 %	40 %	40 %	376274288
104	NC_016778	TCTTT	2	10	115200	115209	0 %	80 %	0 %	20 %	376274290
105	NC_016778	GCCGC	2	10	115847	115856	0 %	0 %	40 %	60 %	376274290
106	NC_016778	AAGCA	2	10	116059	116068	60 %	0 %	20 %	20 %	376274291
107	NC_016778	TGGCG	2	10	116134	116143	0 %	20 %	60 %	20 %	376274292
108	NC_016778	GCTTC	2	10	116185	116194	0 %	40 %	20 %	40 %	376274292
109	NC_016778	CCCTG	2	10	117879	117888	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_016778	ATAGC	2	10	119894	119903	40 %	20 %	20 %	20 %	376274294
111	NC_016778	AGCCA	2	10	125568	125577	40 %	0 %	20 %	40 %	376274298
112	NC_016778	GGCAA	2	10	125736	125745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016778	AACGG	2	10	126575	126584	40 %	0 %	40 %	20 %	376274300
114	NC_016778	AGATG	2	10	127161	127170	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016778	TTTCA	2	10	131132	131141	20 %	60 %	0 %	20 %	376274305
116	NC_016778	GTTGG	2	10	131792	131801	0 %	40 %	60 %	0 %	376274306
117	NC_016778	GCCCC	2	10	132241	132250	0 %	0 %	20 %	80 %	376274306
118	NC_016778	CGCTG	2	10	133454	133463	0 %	20 %	40 %	40 %	376274308
119	NC_016778	ATGAA	2	10	134549	134558	60 %	20 %	20 %	0 %	376274308
120	NC_016778	CATGG	2	10	135823	135832	20 %	20 %	40 %	20 %	376274308
121	NC_016778	GCACC	2	10	136418	136427	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_016778	CGGCG	2	10	136567	136576	0 %	0 %	60 %	40 %	376274309
123	NC_016778	GGGCC	2	10	139409	139418	0 %	0 %	60 %	40 %	376274311
124	NC_016778	CGATG	2	10	142079	142088	20 %	20 %	40 %	20 %	376274316
125	NC_016778	CCGCG	2	10	142712	142721	0 %	0 %	40 %	60 %	376274316
126	NC_016778	CCTGT	2	10	143119	143128	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016778	CATCA	2	10	143285	143294	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016778	GGAAC	2	10	145055	145064	40 %	0 %	40 %	20 %	376274318
129	NC_016778	GATTC	2	10	145183	145192	20 %	40 %	20 %	20 %	376274318
130	NC_016778	TGCAC	2	10	146634	146643	20 %	20 %	20 %	40 %	376274320
131	NC_016778	ATCGT	2	10	148227	148236	20 %	40 %	20 %	20 %	376274321
132	NC_016778	TGCGG	2	10	150191	150200	0 %	20 %	60 %	20 %	376274323
133	NC_016778	CTGCA	2	10	150982	150991	20 %	20 %	20 %	40 %	376274323
134	NC_016778	TAATT	2	10	151777	151786	40 %	60 %	0 %	0 %	376274324
135	NC_016778	GGCGG	2	10	156031	156040	0 %	0 %	80 %	20 %	376274328
136	NC_016778	GCCGG	2	10	157504	157513	0 %	0 %	60 %	40 %	376274329
137	NC_016778	GTCAG	2	10	158677	158686	20 %	20 %	40 %	20 %	376274329
138	NC_016778	GATAC	2	10	159574	159583	40 %	20 %	20 %	20 %	376274329
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243	NC_016778	GCCCG	2	10	306074	306083	0 %	0 %	40 %	60 %	376274489
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248	NC_016778	TTTGT	2	10	311297	311306	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
249	NC_016778	GCGCC	2	10	312914	312923	0 %	0 %	40 %	60 %	376274496
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251	NC_016778	CTTCA	2	10	316953	316962	20 %	40 %	0 %	40 %	376274499
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254	NC_016778	GCAGC	2	10	319410	319419	20 %	0 %	40 %	40 %	376274501
255	NC_016778	TTGCC	2	10	320590	320599	0 %	40 %	20 %	40 %	376274502
256	NC_016778	GGCAT	2	10	322690	322699	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
257	NC_016778	ATGCG	2	10	323216	323225	20 %	20 %	40 %	20 %	376274504
258	NC_016778	AAGGA	2	10	325758	325767	60 %	0 %	40 %	0 %	376274506
259	NC_016778	GCCTG	2	10	326417	326426	0 %	20 %	40 %	40 %	376274507
260	NC_016778	ATTTT	2	10	328997	329006	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_016778	TACGG	2	10	329798	329807	20 %	20 %	40 %	20 %	376274509
262	NC_016778	AAGCG	2	10	330460	330469	40 %	0 %	40 %	20 %	376274510
263	NC_016778	TCGAT	2	10	330591	330600	20 %	40 %	20 %	20 %	376274510
264	NC_016778	TGAAG	2	10	331306	331315	40 %	20 %	40 %	0 %	376274510
265	NC_016778	GCCGG	2	10	331349	331358	0 %	0 %	60 %	40 %	376274510
266	NC_016778	GATTT	2	10	331981	331990	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
267	NC_016778	AGCGC	2	10	332139	332148	20 %	0 %	40 %	40 %	376274513
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