MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella abortus A13334 chromosome 2

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016777	CTGCCG	2	12	53300	53311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016777	AAATCG	2	12	100789	100800	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016777	GAGGAA	2	12	150213	150224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016777	GCGCTG	2	12	279456	279467	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016777	GGGGGC	3	18	306031	306048	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016777	GCGGTG	2	12	306051	306062	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016777	CTGGTC	2	12	306141	306152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016777	CCTCAC	2	12	306487	306498	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016777	CCATAA	2	12	475547	475558	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016777	ACAGTC	2	12	504753	504764	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016777	TCCTTT	2	12	619761	619772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016777	ATTACT	2	12	642062	642073	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016777	AGGAGA	2	12	644570	644581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016777	CCTTTT	2	12	660159	660170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016777	TTGTGA	2	12	681865	681876	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016777	GGCTGC	2	12	753504	753515	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016777	ATATCG	2	12	761959	761970	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016777	CATACG	2	12	810056	810067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016777	TTTTGA	2	12	828067	828078	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016777	TAGCTC	2	12	828309	828320	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016777	GCGCCG	2	12	829233	829244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016777	GGGAAA	2	12	843499	843510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016777	TAAGAA	2	12	864766	864777	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016777	ATCAAA	2	12	897856	897867	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016777	TTTATT	2	12	941810	941821	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016777	CAAGGC	2	12	999222	999233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016777	TCCTTC	2	12	999692	999703	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016777	TTAAAA	2	12	1019784	1019795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016777	CGGAAA	2	12	1133028	1133039	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.