MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella abortus A13334 chromosome 2

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016777	AACCG	2	10	52	61	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016777	CCGCA	2	10	5823	5832	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_016777	TTTTC	2	10	9990	9999	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016777	CTATT	2	10	38394	38403	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016777	TCGAC	2	10	42807	42816	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016777	TTCTG	2	10	42879	42888	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016777	GAAAG	2	10	44852	44861	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016777	TTCAA	2	10	48610	48619	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016777	CCTCT	2	10	48628	48637	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016777	GCTGT	2	10	50239	50248	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016777	CGAAG	2	10	51052	51061	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016777	AGCCC	2	10	51606	51615	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_016777	CACGA	2	10	51751	51760	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016777	TTATT	2	10	57549	57558	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016777	TTCTG	2	10	93757	93766	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016777	CAGGC	2	10	96977	96986	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016777	GGAAG	2	10	125622	125631	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016777	AAAGC	2	10	137210	137219	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016777	GCTTT	2	10	137225	137234	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016777	ACGGC	2	10	137496	137505	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016777	ATTTC	2	10	151812	151821	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016777	AAAAG	2	10	153279	153288	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016777	GCCGA	2	10	165218	165227	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016777	AGCGG	2	10	172226	172235	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016777	GGCCT	2	10	187573	187582	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016777	ATGAA	2	10	190144	190153	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016777	TTTGT	2	10	191305	191314	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016777	CGCTC	2	10	193514	193523	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_016777	TGAAA	2	10	194370	194379	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016777	TGCGG	2	10	210880	210889	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016777	TATCT	2	10	223125	223134	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016777	TCGGT	2	10	231826	231835	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016777	TTCTC	2	10	231855	231864	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016777	ACTTG	2	10	237384	237393	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016777	CGGTA	2	10	247250	247259	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016777	CCAAG	2	10	247425	247434	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016777	TGCTG	2	10	250599	250608	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016777	CTTGC	2	10	258083	258092	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016777	GCCCG	2	10	265950	265959	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016777	GCACA	2	10	266965	266974	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016777	GTTCG	2	10	266986	266995	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016777	AATCA	2	10	278846	278855	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016777	AGATA	2	10	284266	284275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016777	CCGGG	2	10	302056	302065	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016777	CGGAT	2	10	312647	312656	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016777	TGTTT	2	10	313231	313240	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016777	CCCGT	2	10	313956	313965	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_016777	GGATA	2	10	341065	341074	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016777	TGACG	2	10	344811	344820	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016777	AGCAG	2	10	356609	356618	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016777	TTTTG	2	10	362192	362201	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016777	ATCAA	2	10	362360	362369	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016777	TGAAA	2	10	362370	362379	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016777	TAAGT	2	10	367487	367496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016777	CGGGG	2	10	378123	378132	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016777	ATTGT	2	10	390120	390129	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016777	AAGGG	2	10	393847	393856	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016777	TAGGG	2	10	397610	397619	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016777	GGCCT	2	10	398436	398445	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016777	GTTCC	2	10	403607	403616	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016777	GGCAT	2	10	405022	405031	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016777	CTGAA	2	10	405034	405043	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016777	CAGGC	2	10	412621	412630	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016777	CCGGC	4	20	413158	413177	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
65	NC_016777	TTTGT	2	10	445379	445388	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016777	TATCA	2	10	478723	478732	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016777	AAACC	2	10	485689	485698	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_016777	CTTTT	2	10	493637	493646	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016777	AATTG	2	10	498823	498832	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016777	TGATC	2	10	504792	504801	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016777	CGCCC	2	10	509401	509410	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
72	NC_016777	ATGAA	2	10	560816	560825	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016777	GAATG	2	10	562790	562799	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016777	TCCTC	2	10	568511	568520	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_016777	AGGGG	2	10	576838	576847	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016777	TTTGT	2	10	585631	585640	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016777	ATGCC	2	10	586972	586981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016777	TTTGA	2	10	589106	589115	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016777	TGCGC	2	10	614409	614418	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016777	CACGG	2	10	628923	628932	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016777	CCTGA	2	10	647408	647417	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016777	CGTAA	2	10	658660	658669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016777	GATTA	2	10	663970	663979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016777	CCCCG	2	10	693319	693328	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
85	NC_016777	TTTGT	2	10	695449	695458	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016777	AGCGA	2	10	731028	731037	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016777	TTTGT	2	10	737545	737554	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016777	CAAAA	2	10	749704	749713	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016777	AAGGC	2	10	760100	760109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016777	TGCTC	2	10	761546	761555	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016777	ATGAA	2	10	765442	765451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016777	GCAAA	2	10	768276	768285	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016777	TTTGT	2	10	768737	768746	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016777	TTTGT	2	10	792209	792218	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016777	CCGCT	2	10	794515	794524	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
96	NC_016777	AATGA	2	10	827904	827913	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016777	TGCGA	2	10	832640	832649	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016777	TGAAT	2	10	842087	842096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016777	CGAAT	2	10	843403	843412	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016777	GGCCG	2	10	854064	854073	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016777	AAGAC	2	10	858233	858242	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016777	AGCAA	2	10	858577	858586	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016777	CCAGT	2	10	863070	863079	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016777	GCCTG	2	10	864618	864627	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016777	TCTCA	2	10	864844	864853	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016777	GGCTT	2	10	889921	889930	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016777	GGGAT	2	10	909768	909777	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016777	ATCAG	2	10	917196	917205	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016777	CGGCG	2	10	917274	917283	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016777	GCTGG	2	10	922164	922173	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016777	TTCCG	2	10	922327	922336	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016777	TTTCA	2	10	955345	955354	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016777	CGGCC	2	10	970821	970830	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_016777	ACAAA	2	10	974837	974846	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016777	ACAAA	2	10	999005	999014	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016777	AAAGC	2	10	1016994	1017003	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016777	TTGAC	2	10	1086005	1086014	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016777	TCCCC	2	10	1115106	1115115	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
119	NC_016777	CATTG	2	10	1117795	1117804	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016777	AGCGA	2	10	1129876	1129885	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016777	CGCTT	2	10	1139717	1139726	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016777	TGCGC	2	10	1143428	1143437	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_016777	TGTCA	2	10	1146983	1146992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016777	CGCCT	2	10	1159074	1159083	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_016777	ATTAA	2	10	1160482	1160491	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.