MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella abortus A13334 chromosome 2

Total Repeats: 379

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016777	GGTG	2	8	122	129	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016777	AATT	2	8	156	163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016777	GAAA	2	8	17515	17522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016777	TATT	2	8	17624	17631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016777	CCAT	2	8	17721	17728	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016777	CTTC	2	8	22782	22789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016777	TCGT	2	8	24709	24716	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016777	ACCA	2	8	28222	28229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016777	TCGA	2	8	39780	39787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016777	CAGG	2	8	42549	42556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016777	GATC	2	8	42709	42716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016777	GGCG	2	8	43968	43975	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016777	ACCG	2	8	44274	44281	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016777	ATCG	2	8	44383	44390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016777	CAAT	2	8	44702	44709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016777	ATTG	2	8	47076	47083	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016777	TTTG	2	8	47265	47272	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016777	TCGA	2	8	47621	47628	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016777	CAGG	2	8	48155	48162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016777	CTTT	2	8	49281	49288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016777	TCGC	2	8	50109	50116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016777	TTAT	2	8	50219	50226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016777	ATCA	2	8	50672	50679	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016777	TTTC	2	8	50796	50803	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016777	GCCT	2	8	51368	51375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016777	CGTT	2	8	52739	52746	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016777	TCTT	2	8	52993	53000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016777	AACC	2	8	53139	53146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016777	TTTC	2	8	53391	53398	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016777	CGGG	2	8	54418	54425	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016777	TTGT	2	8	54525	54532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016777	TGAA	2	8	55083	55090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016777	TGCC	2	8	56461	56468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016777	GCAG	2	8	57702	57709	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016777	CAGA	2	8	59921	59928	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016777	GAGG	2	8	61360	61367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016777	TGCC	2	8	61409	61416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016777	GGAA	2	8	71213	71220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016777	ATGA	2	8	72272	72279	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016777	TGCG	2	8	72388	72395	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016777	AAAC	2	8	91086	91093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016777	AAAT	2	8	92469	92476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016777	TGCT	2	8	92496	92503	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016777	TATT	2	8	97199	97206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016777	TTCC	2	8	102665	102672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016777	TGCC	2	8	112737	112744	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016777	AACA	2	8	116136	116143	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016777	ATGG	2	8	124510	124517	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016777	CAGC	2	8	129607	129614	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016777	CTGC	2	8	131279	131286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016777	TATT	2	8	134957	134964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016777	TAAA	2	8	134978	134985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016777	GGGA	2	8	137394	137401	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016777	CATC	2	8	138475	138482	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016777	TTTC	2	8	138523	138530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016777	CTGA	2	8	145203	145210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016777	AGAA	2	8	147700	147707	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016777	GAAA	2	8	150376	150383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016777	CGAT	2	8	159107	159114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016777	TGAT	2	8	170778	170785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016777	ACCG	2	8	177411	177418	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016777	AAAC	2	8	178010	178017	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016777	CCTT	2	8	178034	178041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016777	GACA	2	8	180281	180288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016777	ATCT	2	8	181575	181582	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016777	ACCC	2	8	186198	186205	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_016777	GCCT	2	8	189310	189317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016777	GTTC	2	8	193268	193275	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016777	CATA	2	8	196484	196491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016777	CTGT	2	8	196664	196671	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016777	GAAT	2	8	196769	196776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016777	AAAC	2	8	204792	204799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016777	ATGG	2	8	206162	206169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016777	TTGA	2	8	206335	206342	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016777	TGTT	2	8	206533	206540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016777	GGCC	2	8	210801	210808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016777	AAGG	2	8	210828	210835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016777	CCAG	2	8	212130	212137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016777	TGGC	2	8	215742	215749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016777	TGCT	2	8	216209	216216	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016777	CAAA	2	8	216414	216421	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016777	CCGC	2	8	216510	216517	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_016777	GCCG	2	8	219229	219236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016777	ATGA	2	8	219428	219435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016777	GGGC	2	8	233834	233841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016777	TTAA	2	8	242549	242556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016777	ATAA	2	8	247026	247033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016777	GATA	2	8	253552	253559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016777	CGTT	2	8	258061	258068	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016777	ATTT	2	8	279026	279033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016777	ATTT	2	8	279582	279589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016777	CGTC	2	8	279694	279701	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016777	TTAA	2	8	284214	284221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016777	ACGA	2	8	284312	284319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016777	ATTG	2	8	284763	284770	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016777	TGAA	2	8	284884	284891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016777	ATAC	2	8	291734	291741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016777	TAGG	2	8	305205	305212	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016777	GAAA	2	8	305604	305611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016777	GCGG	2	8	305697	305704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016777	GGCG	2	8	306653	306660	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016777	TTTC	2	8	312623	312630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016777	GTTC	2	8	314058	314065	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016777	TGAA	2	8	314258	314265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016777	GCTT	2	8	315098	315105	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016777	ACGG	2	8	316289	316296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016777	GGGC	2	8	316484	316491	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016777	CACG	2	8	323576	323583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016777	TTCC	2	8	324331	324338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016777	CAGG	2	8	324365	324372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016777	TCAA	2	8	327727	327734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016777	GGCT	2	8	331220	331227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016777	TTGA	2	8	331334	331341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016777	AGGC	2	8	331758	331765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016777	GCCT	2	8	331770	331777	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016777	CGGG	2	8	332076	332083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016777	ATTC	2	8	337093	337100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016777	GGCT	2	8	340194	340201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016777	TCGC	2	8	342388	342395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016777	GAAA	2	8	352879	352886	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016777	ATAG	2	8	364825	364832	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016777	TGCC	2	8	370129	370136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016777	GCCT	2	8	370668	370675	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016777	CGGG	2	8	370697	370704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016777	AAAT	2	8	374464	374471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016777	CGCT	2	8	377518	377525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016777	GCCA	2	8	378056	378063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016777	GATG	2	8	378636	378643	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016777	TCAT	2	8	399739	399746	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016777	TGGG	2	8	403798	403805	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016777	AACA	2	8	429652	429659	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016777	GGAT	2	8	435563	435570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016777	GGCA	2	8	441292	441299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016777	GAAA	2	8	454586	454593	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016777	TAGG	2	8	455994	456001	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016777	TCGG	2	8	460933	460940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016777	CAAA	2	8	465327	465334	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016777	TAAA	2	8	475611	475618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016777	CATG	2	8	478699	478706	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016777	TTTG	2	8	481166	481173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016777	GGCG	2	8	481880	481887	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016777	GGTT	2	8	485716	485723	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016777	TGCT	2	8	488718	488725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016777	TCTG	2	8	489056	489063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016777	CAGG	2	8	490005	490012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016777	TCGC	2	8	492156	492163	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016777	TTCC	2	8	492405	492412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016777	TCCA	2	8	496956	496963	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016777	CGAA	2	8	496985	496992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016777	CCAA	2	8	498975	498982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_016777	GAAG	2	8	501883	501890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.