MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacteroides fragilis 638R

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016776	TAAACC	2	12	719	730	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016776	ATTTTA	2	12	40199	40210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016776	AACGGT	2	12	79798	79809	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016776	TTTTTG	2	12	108173	108184	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016776	CAAAGA	2	12	113099	113110	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016776	TTTCCT	2	12	162572	162583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016776	TGGTTA	2	12	166485	166496	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016776	TATGAA	2	12	239617	239628	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016776	TATTTT	2	12	243622	243633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016776	TCGTTT	2	12	271552	271563	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016776	CGTTTT	2	12	289393	289404	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016776	TAATAT	2	12	295734	295745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016776	CTTTTT	2	12	391488	391499	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016776	TAAAGA	2	12	412866	412877	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016776	CTTCCT	2	12	413028	413039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016776	AAGGTA	2	12	486737	486748	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016776	AGGAAG	2	12	488678	488689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016776	TTCTTT	2	12	489061	489072	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016776	AATTTG	2	12	501573	501584	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016776	AGGTAA	2	12	535178	535189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016776	GTTTCC	2	12	558112	558123	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016776	AAATGT	2	12	630595	630606	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016776	TTCTAT	2	12	696004	696015	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016776	AGAAAC	2	12	719805	719816	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016776	TATAAA	2	12	769777	769788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016776	TTAGTA	2	12	795279	795290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016776	TTTATA	2	12	822656	822667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016776	AAGTAA	2	12	822758	822769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016776	TTAATT	2	12	848067	848078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016776	ATGAAT	2	12	877299	877310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016776	GCTACT	2	12	938443	938454	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016776	TATGCT	2	12	938494	938505	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016776	GTATCA	2	12	977242	977253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016776	ATTGTA	2	12	1052294	1052305	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016776	TAAATC	2	12	1055294	1055305	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016776	TTTCTT	2	12	1080889	1080900	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016776	TTTTTA	2	12	1098579	1098590	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016776	AATTTA	2	12	1138135	1138146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016776	TAAAAG	2	12	1205753	1205764	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016776	AAATCA	2	12	1265186	1265197	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016776	GAAACG	2	12	1311510	1311521	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016776	TGTTAA	2	12	1312459	1312470	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016776	GATAAG	2	12	1351799	1351810	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016776	GAATAT	2	12	1403002	1403013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016776	TCGTTT	2	12	1425044	1425055	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016776	CTTTTT	2	12	1505011	1505022	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016776	GATATT	2	12	1515646	1515657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016776	GATAGT	2	12	1520332	1520343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016776	AAAAGT	2	12	1542072	1542083	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016776	TATTCT	2	12	1585368	1585379	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016776	AAACGA	2	12	1607858	1607869	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016776	CGTGTA	2	12	1619473	1619484	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016776	ATCAAA	2	12	1650568	1650579	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016776	TTTTGT	2	12	1656322	1656333	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016776	TTCTAT	2	12	1752719	1752730	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016776	ATGATT	2	12	1890319	1890330	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016776	TTTTAT	2	12	1908736	1908747	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016776	CTTATT	2	12	1921710	1921721	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016776	TCTTTT	2	12	1925389	1925400	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016776	CGTTCG	2	12	1930918	1930929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016776	GCTTTA	2	12	1982000	1982011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016776	ATACAT	2	12	1982820	1982831	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016776	AGAACA	2	12	1992302	1992313	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016776	GTAATA	2	12	1992359	1992370	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016776	TATTTA	2	12	2021680	2021691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016776	CATTAC	2	12	2086828	2086839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016776	GAAAAA	2	12	2087085	2087096	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016776	CCTTGC	2	12	2087894	2087905	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016776	TTTGTT	2	12	2103076	2103087	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016776	CATTTA	2	12	2181790	2181801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016776	TATAAA	2	12	2202959	2202970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016776	TAGTTA	2	12	2233313	2233324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016776	AATTAT	2	12	2233875	2233886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016776	TTTGTT	2	12	2244082	2244093	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016776	TTTTAT	2	12	2334110	2334121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016776	TTTTAT	2	12	2343432	2343443	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016776	GGATCG	2	12	2368786	2368797	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016776	CAAGGA	2	12	2369201	2369212	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016776	GAAAAT	2	12	2370497	2370508	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016776	ATAAAA	2	12	2392544	2392555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016776	TGTTTT	2	12	2398450	2398461	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016776	TGATGC	2	12	2401268	2401279	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016776	ATTAAA	2	12	2437870	2437881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016776	ACAGGA	2	12	2443448	2443459	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016776	AGTGGA	2	12	2458115	2458126	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016776	GTTCCG	2	12	2467800	2467811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016776	TGTTTG	2	12	2486290	2486301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016776	AATACT	2	12	2524229	2524240	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016776	GCATAA	2	12	2556223	2556234	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016776	TGAATA	2	12	2556419	2556430	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016776	TATTCA	2	12	2645196	2645207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016776	GTCTTT	2	12	2650965	2650976	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016776	TAAACC	2	12	2723062	2723073	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016776	TTTGTT	2	12	2726327	2726338	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016776	AAAACA	2	12	2769912	2769923	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016776	ATTTTT	2	12	2781714	2781725	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016776	CTAATA	2	12	2791470	2791481	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016776	TGCGCA	2	12	2832428	2832439	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016776	AATATT	2	12	2867630	2867641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016776	ATTTTT	2	12	2867664	2867675	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016776	ACGAAT	2	12	2868256	2868267	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016776	GAAATT	2	12	2874150	2874161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016776	TTGTTT	2	12	2876628	2876639	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016776	TTTGTA	2	12	2898785	2898796	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016776	TTTGTA	2	12	2926029	2926040	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016776	TAAACC	2	12	2926811	2926822	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016776	GGTATA	2	12	2953609	2953620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016776	TAAAAA	2	12	2987223	2987234	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016776	ATTATC	2	12	2994872	2994883	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016776	ATTTTT	2	12	3011866	3011877	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016776	AGGAAT	2	12	3011961	3011972	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016776	TACAAT	2	12	3016043	3016054	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016776	AATGAA	2	12	3057821	3057832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016776	CACATA	2	12	3066806	3066817	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016776	TGGCAC	2	12	3103034	3103045	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016776	ATTCCT	2	12	3112754	3112765	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016776	ACAGGA	2	12	3115798	3115809	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016776	ACAATT	2	12	3123901	3123912	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016776	ATGTGT	2	12	3135832	3135843	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016776	CAAATA	2	12	3149314	3149325	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016776	ATAAAA	2	12	3155441	3155452	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016776	AGTGAG	2	12	3175120	3175131	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016776	AAATAA	2	12	3186690	3186701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016776	ATAAAA	2	12	3219684	3219695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016776	TCGCTT	2	12	3241874	3241885	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016776	TAAAAA	2	12	3250222	3250233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016776	TAAGAA	2	12	3260219	3260230	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.