MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella suis VBI22 chromosome II

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016775	GATGCC	2	12	145132	145143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016775	GAAAAG	2	12	168776	168787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016775	TGTCAG	2	12	175587	175598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016775	CGCAAG	2	12	193405	193416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016775	GGGATT	2	12	217521	217532	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016775	TTCACA	2	12	254970	254981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016775	TGGCGC	2	12	318473	318484	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016775	GATATC	2	12	318767	318778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016775	TGGCTG	2	12	318904	318915	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016775	GAAGGA	2	12	322192	322203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016775	ACGGCA	2	12	375955	375966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016775	GGGTGA	2	12	396492	396503	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016775	AAATAA	2	12	398367	398378	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016775	GCGCAG	2	12	456151	456162	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016775	TGAAAA	2	12	528272	528283	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016775	GAGCTA	2	12	539036	539047	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016775	TCAAAA	2	12	539278	539289	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016775	GCAGCC	2	12	613870	613881	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016775	CCGATC	2	12	645753	645764	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016775	GCCAAG	2	12	648092	648103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016775	CCTCGC	2	12	669381	669392	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016775	CGCTGG	2	12	669749	669760	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016775	TCACAA	2	12	685597	685608	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016775	ACGGCG	2	12	693103	693114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016775	AAAAGG	2	12	707269	707280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016775	CTCCTT	3	18	722864	722881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016775	GCCTTT	2	12	742671	742682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016775	AAAGGA	2	12	747697	747708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016775	GCTGAT	2	12	755716	755727	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016775	GAATCG	2	12	760765	760776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016775	GCACCT	2	12	760796	760807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016775	CCAGCG	2	12	764812	764823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016775	TGACCG	2	12	801092	801103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016775	TTGTCG	2	12	801337	801348	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016775	ATATGC	2	12	802518	802529	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016775	CGCTTG	2	12	840275	840286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016775	TTATGG	2	12	891972	891983	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016775	ATAGCC	2	12	964224	964235	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016775	CGGAAA	2	12	1027411	1027422	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016775	CCGGAG	2	12	1087308	1087319	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016775	CCGGAA	2	12	1094225	1094236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016775	CTGCCG	2	12	1110221	1110232	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016775	AAATCG	2	12	1157726	1157737	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016775	GCTGAT	2	12	1194848	1194859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016775	TCGCCA	2	12	1198415	1198426	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016775	GAGGAA	2	12	1207435	1207446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.