MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus cereus NC7401 plasmid pNC1

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016772	CTT	2	6	73	78	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016772	TGT	2	6	161	166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016772	CAC	2	6	221	226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016772	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016772	TCT	2	6	346	351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016772	GGT	2	6	360	365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016772	TCT	2	6	862	867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016772	TCA	2	6	939	944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016772	CCT	2	6	987	992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016772	ACA	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016772	GGA	2	6	1139	1144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016772	AAG	2	6	1213	1218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016772	TCT	2	6	1242	1247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016772	TTG	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016772	GGA	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016772	GGA	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016772	TTA	2	6	1334	1339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016772	AAT	2	6	1381	1386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016772	AAT	2	6	1399	1404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016772	GAA	2	6	2677	2682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016772	CTA	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016772	ATG	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016772	GAA	2	6	2770	2775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016772	TAA	2	6	2821	2826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016772	CCT	2	6	2850	2855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_016772	CAG	2	6	2871	2876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016772	GGA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016772	GTC	2	6	3881	3886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016772	GCC	2	6	4211	4216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016772	TTG	2	6	5792	5797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016772	TCT	2	6	5850	5855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016772	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016772	TCA	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016772	AAT	2	6	5959	5964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016772	TCC	2	6	6495	6500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016772	CCT	2	6	12927	12932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016772	CTT	2	6	17624	17629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016772	ATT	2	6	17640	17645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016772	AGT	2	6	17648	17653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016772	AAG	2	6	17725	17730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016772	TTC	2	6	17784	17789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016772	CTT	2	6	17828	17833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016772	CCT	2	6	18500	18505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016772	AGC	2	6	20039	20044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016772	TAA	2	6	20170	20175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016772	CTT	2	6	20182	20187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016772	TCA	2	6	20235	20240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016772	CAT	2	6	20291	20296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016772	TAT	2	6	21257	21262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016772	CTC	3	9	26773	26781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016772	ATT	3	9	26795	26803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016772	ACT	2	6	27451	27456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016772	TAA	2	6	27464	27469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016772	CAA	2	6	27485	27490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016772	TCA	2	6	27712	27717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016772	TTA	2	6	28089	28094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016772	GAT	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016772	CAG	3	9	28208	28216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016772	CTT	2	6	28217	28222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016772	CAA	2	6	28287	28292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016772	AAC	2	6	28339	28344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016772	TAT	2	6	28389	28394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016772	TTC	2	6	28731	28736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016772	CAT	2	6	28788	28793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016772	TCC	2	6	28797	28802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016772	TCC	2	6	29105	29110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016772	ACC	2	6	29217	29222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_016772	ACC	2	6	29249	29254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016772	ATA	2	6	29271	29276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016772	CAA	2	6	29299	29304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016772	CTA	2	6	29345	29350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016772	AGT	2	6	29452	29457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016772	TCT	2	6	29538	29543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016772	TTC	2	6	29636	29641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016772	GTC	2	6	29770	29775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016772	ACC	2	6	29851	29856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016772	ATA	2	6	29946	29951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016772	TCT	2	6	30048	30053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016772	ACC	2	6	30068	30073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016772	CCG	2	6	30092	30097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016772	TTG	2	6	30118	30123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016772	TGA	2	6	30230	30235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016772	TTC	2	6	30285	30290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016772	CAC	2	6	30817	30822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016772	ACT	2	6	30879	30884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016772	CAT	2	6	30896	30901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016772	AAC	2	6	30985	30990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016772	AGA	2	6	31480	31485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016772	ATA	2	6	31546	31551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016772	CTT	2	6	31572	31577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016772	TCT	2	6	31610	31615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016772	ATT	2	6	31829	31834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016772	ATT	2	6	31908	31913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016772	ATA	2	6	32006	32011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016772	GAA	2	6	32067	32072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016772	TAT	2	6	32077	32082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016772	GCT	2	6	32255	32260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016772	TTC	2	6	32488	32493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016772	TGT	2	6	32547	32552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016772	CAT	2	6	32616	32621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016772	TCT	2	6	32627	32632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016772	TCC	2	6	32666	32671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016772	AAT	2	6	33287	33292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016772	TAA	2	6	33784	33789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016772	AGC	2	6	33812	33817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016772	ACT	2	6	34689	34694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016772	TCT	2	6	34785	34790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016772	TCA	2	6	34842	34847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016772	CTT	2	6	34855	34860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016772	CTT	2	6	34891	34896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016772	CCA	2	6	34933	34938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016772	TTA	2	6	34959	34964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016772	TCC	2	6	35723	35728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_016772	TCT	2	6	35776	35781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016772	ATG	2	6	35813	35818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016772	TTC	2	6	35895	35900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016772	ATT	2	6	35949	35954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016772	CTG	2	6	38686	38691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016772	CTT	2	6	38745	38750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016772	CTT	2	6	40845	40850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016772	ATC	2	6	40852	40857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016772	TAA	2	6	41019	41024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016772	TTA	2	6	41059	41064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016772	AGA	2	6	41286	41291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016772	ATA	2	6	41304	41309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016772	ATA	2	6	41317	41322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016772	TGT	2	6	41326	41331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016772	CAT	3	9	41392	41400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016772	ATG	2	6	41444	41449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016772	CAT	2	6	41715	41720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016772	TCC	2	6	42389	42394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016772	ATT	2	6	42802	42807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016772	ACG	2	6	45247	45252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016772	AAC	2	6	45330	45335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016772	TAA	2	6	45343	45348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016772	TAA	2	6	45354	45359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016772	AAC	2	6	45360	45365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016772	TTA	2	6	45366	45371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016772	TAG	2	6	45372	45377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016772	AGA	2	6	45769	45774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016772	GGA	2	6	45935	45940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016772	ATA	2	6	46622	46627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016772	ATT	2	6	46649	46654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016772	GAA	2	6	46677	46682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016772	TCC	2	6	46935	46940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016772	ATA	2	6	46982	46987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016772	TAA	2	6	47277	47282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016772	AAT	2	6	47384	47389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016772	TTC	2	6	47788	47793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016772	TTC	2	6	47884	47889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.