MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016768	ACCGCG	2	12	31190	31201	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016768	CGTCGG	2	12	66838	66849	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016768	CAACGG	2	12	76360	76371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016768	TCACCT	2	12	80526	80537	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016768	GCGGTG	2	12	104874	104885	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016768	CTCGGT	2	12	149506	149517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016768	GCCGCG	2	12	180870	180881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016768	ACAGCC	2	12	218418	218429	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016768	CCCCGA	2	12	293571	293582	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016768	AGATTC	2	12	330303	330314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016768	GGTCGC	2	12	344927	344938	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016768	ATAGTC	2	12	543231	543242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016768	ACCAGT	2	12	591234	591245	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016768	CGCCGT	2	12	720235	720246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016768	CGCGGG	2	12	830826	830837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016768	CCGGCG	2	12	864361	864372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016768	ACCGGG	2	12	871082	871093	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016768	GCGGCC	2	12	907973	907984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016768	ACAGCA	2	12	909346	909357	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016768	CTGGGT	2	12	924185	924196	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016768	CTGGTG	2	12	936759	936770	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016768	CAACGG	2	12	956367	956378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016768	GTTGGT	2	12	978065	978076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016768	TGTACA	2	12	983414	983425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016768	CGGCAT	2	12	998672	998683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016768	CGGTCA	2	12	1020860	1020871	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016768	CCTACG	2	12	1032612	1032623	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016768	TTCGGA	2	12	1087535	1087546	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016768	CCGGCC	2	12	1100384	1100395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016768	GTGGCG	2	12	1106083	1106094	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016768	CGGCGA	2	12	1122103	1122114	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016768	CGGCGA	2	12	1122160	1122171	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016768	CGACGT	2	12	1185176	1185187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016768	GTGATG	2	12	1229032	1229043	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016768	GTCGAT	2	12	1291786	1291797	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016768	GCAACG	2	12	1313420	1313431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016768	TGCCGG	2	12	1335793	1335804	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016768	AATATG	2	12	1399870	1399881	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016768	CACACC	2	12	1451119	1451130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016768	CCCGAA	2	12	1453694	1453705	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016768	CTTCCG	2	12	1460448	1460459	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016768	GGCGCC	2	12	1467917	1467928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016768	CAACGG	2	12	1487605	1487616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016768	CAATAC	2	12	1497541	1497552	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016768	TCGGGC	2	12	1535977	1535988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016768	CCGTCG	2	12	1543072	1543083	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016768	GGGTGC	2	12	1591353	1591364	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016768	GTTTGA	2	12	1620649	1620660	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016768	GTGGCG	2	12	1622402	1622413	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016768	TGCCGG	2	12	1680588	1680599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016768	CACGTG	2	12	1698251	1698262	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016768	TGCGGT	2	12	1784262	1784273	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016768	TGGGCG	2	12	1819569	1819580	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016768	GTCGTG	2	12	1905928	1905939	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016768	CCGACG	2	12	1924097	1924108	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016768	GGTTGG	2	12	1959642	1959653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016768	CAGCGG	2	12	1984869	1984880	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016768	GGTTGA	2	12	2005471	2005482	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016768	ACTCGT	2	12	2016527	2016538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016768	AGTGCA	2	12	2076193	2076204	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016768	CGGAGC	2	12	2156628	2156639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016768	CTGCGG	2	12	2185942	2185953	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016768	CAACCG	2	12	2188848	2188859	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016768	GCTCGC	2	12	2243263	2243274	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016768	CCCAGC	2	12	2274709	2274720	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016768	CCCTCT	2	12	2343812	2343823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016768	AGCCGA	2	12	2363936	2363947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016768	GACGGC	2	12	2366183	2366194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016768	ATCACC	2	12	2379204	2379215	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016768	GGTTGT	2	12	2422281	2422292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016768	TGCGGT	2	12	2490332	2490343	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016768	ACCGCT	2	12	2492268	2492279	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016768	TCGGCG	2	12	2501600	2501611	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016768	CTCGTC	2	12	2508667	2508678	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016768	CCGCGG	2	12	2519374	2519385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016768	GTGCTG	2	12	2571050	2571061	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016768	GGCGCC	2	12	2583042	2583053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016768	GCACTC	2	12	2629266	2629277	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016768	AGGGGC	2	12	2771934	2771945	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016768	AGGGGC	2	12	2775524	2775535	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016768	TGAATA	2	12	2848975	2848986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016768	GCGCGT	2	12	2884004	2884015	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016768	ACCCAC	2	12	2934044	2934055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_016768	ACTCGG	2	12	2989131	2989142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016768	GCACCG	2	12	3025796	3025807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016768	TGGCCT	2	12	3067659	3067670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016768	CTCGTC	2	12	3126017	3126028	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016768	GTAACT	2	12	3186955	3186966	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016768	ATGGCT	2	12	3212441	3212452	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016768	ACGGAA	2	12	3246211	3246222	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016768	CACCAA	2	12	3256904	3256915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016768	GGCATT	2	12	3285039	3285050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016768	TGCGCC	2	12	3314227	3314238	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016768	CGGCGC	2	12	3356023	3356034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016768	GCAGTC	2	12	3374886	3374897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016768	CCGTTG	2	12	3379341	3379352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016768	AACCCG	2	12	3443130	3443141	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016768	GCTCCT	2	12	3485335	3485346	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016768	GTCGAC	2	12	3500598	3500609	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016768	TCCGCT	2	12	3544568	3544579	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016768	GCCTCC	2	12	3635098	3635109	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016768	TGTCGA	2	12	3695281	3695292	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016768	TGCCGC	2	12	3730742	3730753	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016768	GCGCAG	2	12	3771012	3771023	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016768	TGTACA	2	12	3790359	3790370	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016768	TCCTCT	2	12	3866400	3866411	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016768	TCGGAG	2	12	3890679	3890690	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_016768	CCGCTC	2	12	3894708	3894719	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_016768	CGTTGG	2	12	3907348	3907359	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016768	CGGCCG	2	12	3911488	3911499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016768	GGCGAG	2	12	4094106	4094117	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016768	GCGCCG	2	12	4134566	4134577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016768	TGGCGG	2	12	4182677	4182688	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016768	CTCATC	2	12	4250219	4250230	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016768	GGGTTG	2	12	4307484	4307495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.