MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 4207 chromosome

Total Repeats: 3517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016768	TCATC	2	10	1003	1012	20 %	40 %	0 %	40 %	375294202
2	NC_016768	CGTTT	2	10	2193	2202	0 %	60 %	20 %	20 %	375294203
3	NC_016768	CGGTT	2	10	3342	3351	0 %	40 %	40 %	20 %	375294203
4	NC_016768	GTCGG	2	10	4690	4699	0 %	20 %	60 %	20 %	375294205
5	NC_016768	GCAGC	2	10	7474	7483	20 %	0 %	40 %	40 %	375294207
6	NC_016768	CGGTG	2	10	9382	9391	0 %	20 %	60 %	20 %	375294207
7	NC_016768	CAGAC	2	10	9900	9909	40 %	0 %	20 %	40 %	375294207
8	NC_016768	CGCAA	2	10	10424	10433	40 %	0 %	20 %	40 %	375294208
9	NC_016768	CGGCG	2	10	10550	10559	0 %	0 %	60 %	40 %	375294208
10	NC_016768	ACCCG	2	10	11380	11389	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_016768	CGACC	2	10	13773	13782	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_016768	GGCGT	2	10	14255	14264	0 %	20 %	60 %	20 %	375294213
13	NC_016768	GGGCC	2	10	14538	14547	0 %	0 %	60 %	40 %	375294213
14	NC_016768	GCGTT	2	10	15283	15292	0 %	40 %	40 %	20 %	375294214
15	NC_016768	CCAGC	2	10	15823	15832	20 %	0 %	20 %	60 %	375294215
16	NC_016768	ACCGA	2	10	16586	16595	40 %	0 %	20 %	40 %	375294215
17	NC_016768	ATCGG	2	10	16978	16987	20 %	20 %	40 %	20 %	375294215
18	NC_016768	CGGCC	2	10	17987	17996	0 %	0 %	40 %	60 %	375294216
19	NC_016768	TTAGC	2	10	19138	19147	20 %	40 %	20 %	20 %	375294217
20	NC_016768	GGTCC	2	10	19210	19219	0 %	20 %	40 %	40 %	375294217
21	NC_016768	GTCGT	2	10	21729	21738	0 %	40 %	40 %	20 %	375294218
22	NC_016768	ATCAC	2	10	24002	24011	40 %	20 %	0 %	40 %	375294221
23	NC_016768	GCCGG	2	10	24689	24698	0 %	0 %	60 %	40 %	375294221
24	NC_016768	CGAGC	2	10	27069	27078	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016768	GGCAA	2	10	29402	29411	40 %	0 %	40 %	20 %	375294226
26	NC_016768	CGATC	2	10	30228	30237	20 %	20 %	20 %	40 %	375294227
27	NC_016768	CGACG	2	10	32411	32420	20 %	0 %	40 %	40 %	375294230
28	NC_016768	GCGTC	2	10	32466	32475	0 %	20 %	40 %	40 %	375294230
29	NC_016768	GACAC	2	10	32563	32572	40 %	0 %	20 %	40 %	375294230
30	NC_016768	CCGCC	2	10	33909	33918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_016768	TCCTG	2	10	37569	37578	0 %	40 %	20 %	40 %	375294235
32	NC_016768	CTCGG	2	10	37662	37671	0 %	20 %	40 %	40 %	375294235
33	NC_016768	GGCGC	2	10	38205	38214	0 %	0 %	60 %	40 %	375294235
34	NC_016768	TGGCC	2	10	38353	38362	0 %	20 %	40 %	40 %	375294235
35	NC_016768	CGGCG	2	10	38885	38894	0 %	0 %	60 %	40 %	375294235
36	NC_016768	GTCCA	2	10	39497	39506	20 %	20 %	20 %	40 %	375294236
37	NC_016768	GCCAA	2	10	41631	41640	40 %	0 %	20 %	40 %	375294238
38	NC_016768	GCGTC	2	10	42046	42055	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
39	NC_016768	GCACA	2	10	42430	42439	40 %	0 %	20 %	40 %	375294239
40	NC_016768	GGTAC	2	10	44964	44973	20 %	20 %	40 %	20 %	375294241
41	NC_016768	TCGAA	2	10	45196	45205	40 %	20 %	20 %	20 %	375294241
42	NC_016768	GCACC	2	10	46126	46135	20 %	0 %	20 %	60 %	375294241
43	NC_016768	CGGTG	2	10	47160	47169	0 %	20 %	60 %	20 %	375294242
44	NC_016768	TCATG	2	10	47306	47315	20 %	40 %	20 %	20 %	375294242
45	NC_016768	ATCGG	2	10	47453	47462	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016768	GCAGC	2	10	48700	48709	20 %	0 %	40 %	40 %	375294244
47	NC_016768	CCCGA	2	10	48783	48792	20 %	0 %	20 %	60 %	375294244
48	NC_016768	CAGCG	2	10	49908	49917	20 %	0 %	40 %	40 %	375294245
49	NC_016768	CTCCC	2	10	56342	56351	0 %	20 %	0 %	80 %	375294251
50	NC_016768	CGGCG	2	10	56791	56800	0 %	0 %	60 %	40 %	375294251
51	NC_016768	CGACC	2	10	58323	58332	20 %	0 %	20 %	60 %	375294253
52	NC_016768	CTTCG	2	10	59010	59019	0 %	40 %	20 %	40 %	375294254
53	NC_016768	CGGTG	2	10	60066	60075	0 %	20 %	60 %	20 %	375294257
54	NC_016768	TCAGG	2	10	62552	62561	20 %	20 %	40 %	20 %	375294258
55	NC_016768	TGCCG	2	10	65583	65592	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016768	GGCGA	2	10	66515	66524	20 %	0 %	60 %	20 %	375294262
57	NC_016768	GGTGT	2	10	69091	69100	0 %	40 %	60 %	0 %	375294264
58	NC_016768	ATCGG	2	10	69728	69737	20 %	20 %	40 %	20 %	375294264
59	NC_016768	CCGCG	2	10	70265	70274	0 %	0 %	40 %	60 %	375294264
60	NC_016768	GGCAA	2	10	70616	70625	40 %	0 %	40 %	20 %	375294264
61	NC_016768	CGACC	2	10	70905	70914	20 %	0 %	20 %	60 %	375294264
62	NC_016768	CGGGT	2	10	71359	71368	0 %	20 %	60 %	20 %	375294264
63	NC_016768	GGTCG	2	10	71419	71428	0 %	20 %	60 %	20 %	375294264
64	NC_016768	TGCCT	2	10	72160	72169	0 %	40 %	20 %	40 %	375294266
65	NC_016768	GTCCA	2	10	73031	73040	20 %	20 %	20 %	40 %	375294267
66	NC_016768	TGACC	2	10	75655	75664	20 %	20 %	20 %	40 %	375294269
67	NC_016768	GCCAA	2	10	75969	75978	40 %	0 %	20 %	40 %	375294269
68	NC_016768	GTCGC	2	10	76046	76055	0 %	20 %	40 %	40 %	375294269
69	NC_016768	GCGCG	2	10	77134	77143	0 %	0 %	60 %	40 %	375294270
70	NC_016768	CACGA	2	10	79982	79991	40 %	0 %	20 %	40 %	375294272
71	NC_016768	GCACC	2	10	80422	80431	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_016768	CCACC	2	10	80615	80624	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_016768	GAGCA	2	10	82520	82529	40 %	0 %	40 %	20 %	375294274
74	NC_016768	GCCGG	2	10	82619	82628	0 %	0 %	60 %	40 %	375294274
75	NC_016768	GCGAC	2	10	82695	82704	20 %	0 %	40 %	40 %	375294274
76	NC_016768	ATCCG	2	10	83465	83474	20 %	20 %	20 %	40 %	375294275
77	NC_016768	CACCG	2	10	84245	84254	20 %	0 %	20 %	60 %	375294276
78	NC_016768	TGGTC	2	10	86380	86389	0 %	40 %	40 %	20 %	375294278
79	NC_016768	GCTGG	2	10	87017	87026	0 %	20 %	60 %	20 %	375294279
80	NC_016768	TGGGT	2	10	90055	90064	0 %	40 %	60 %	0 %	375294284
81	NC_016768	TCGCC	2	10	90262	90271	0 %	20 %	20 %	60 %	375294284
82	NC_016768	GGGCC	2	10	91235	91244	0 %	0 %	60 %	40 %	375294285
83	NC_016768	GGCCG	2	10	92554	92563	0 %	0 %	60 %	40 %	375294286
84	NC_016768	GCGCC	2	10	93206	93215	0 %	0 %	40 %	60 %	375294286
85	NC_016768	GCTTG	2	10	95238	95247	0 %	40 %	40 %	20 %	375294288
86	NC_016768	CGTGT	2	10	95670	95679	0 %	40 %	40 %	20 %	375294289
87	NC_016768	AGATC	2	10	95749	95758	40 %	20 %	20 %	20 %	375294289
88	NC_016768	CGGCG	2	10	99330	99339	0 %	0 %	60 %	40 %	375294292
89	NC_016768	CGGCG	2	10	99457	99466	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_016768	GCGGT	2	10	100406	100415	0 %	20 %	60 %	20 %	375294293
91	NC_016768	GGTGA	2	10	100624	100633	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016768	GCGCC	2	10	103238	103247	0 %	0 %	40 %	60 %	375294295
93	NC_016768	GGTGG	2	10	103926	103935	0 %	20 %	80 %	0 %	375294296
94	NC_016768	GGCTT	2	10	104939	104948	0 %	40 %	40 %	20 %	375294297
95	NC_016768	CTGGC	2	10	105661	105670	0 %	20 %	40 %	40 %	375294298
96	NC_016768	GCACA	2	10	106782	106791	40 %	0 %	20 %	40 %	375294298
97	NC_016768	CTGAA	2	10	109112	109121	40 %	20 %	20 %	20 %	375294301
98	NC_016768	ATCGC	2	10	109607	109616	20 %	20 %	20 %	40 %	375294301
99	NC_016768	TCTGA	2	10	110941	110950	20 %	40 %	20 %	20 %	375294303
100	NC_016768	CGGTC	2	10	111216	111225	0 %	20 %	40 %	40 %	375294303
101	NC_016768	GACCA	2	10	112354	112363	40 %	0 %	20 %	40 %	375294303
102	NC_016768	GGCTG	2	10	114918	114927	0 %	20 %	60 %	20 %	375294303
103	NC_016768	CCGCG	2	10	118838	118847	0 %	0 %	40 %	60 %	375294304
104	NC_016768	TCGTG	2	10	122791	122800	0 %	40 %	40 %	20 %	375294306
105	NC_016768	GCACG	2	10	124446	124455	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016768	CCGGA	2	10	124572	124581	20 %	0 %	40 %	40 %	375294308
107	NC_016768	TGCGC	2	10	127045	127054	0 %	20 %	40 %	40 %	375294309
108	NC_016768	GCGAG	2	10	127556	127565	20 %	0 %	60 %	20 %	375294309
109	NC_016768	GGGGT	2	10	128565	128574	0 %	20 %	80 %	0 %	375294309
110	NC_016768	CCCAC	2	10	129127	129136	20 %	0 %	0 %	80 %	375294309
111	NC_016768	CCGGC	2	10	129637	129646	0 %	0 %	40 %	60 %	375294309
112	NC_016768	TGCGG	2	10	130047	130056	0 %	20 %	60 %	20 %	375294309
113	NC_016768	ATCAC	2	10	131526	131535	40 %	20 %	0 %	40 %	375294311
114	NC_016768	ATCGG	2	10	131574	131583	20 %	20 %	40 %	20 %	375294311
115	NC_016768	CGGGC	2	10	132665	132674	0 %	0 %	60 %	40 %	375294311
116	NC_016768	GCGAT	2	10	134470	134479	20 %	20 %	40 %	20 %	375294313
117	NC_016768	GTTCG	2	10	134691	134700	0 %	40 %	40 %	20 %	375294313
118	NC_016768	CCTGG	2	10	135083	135092	0 %	20 %	40 %	40 %	375294313
119	NC_016768	GGCCC	2	10	135189	135198	0 %	0 %	40 %	60 %	375294313
120	NC_016768	CGTTG	2	10	135701	135710	0 %	40 %	40 %	20 %	375294313
121	NC_016768	CGACC	2	10	135773	135782	20 %	0 %	20 %	60 %	375294313
122	NC_016768	GAGAT	2	10	138793	138802	40 %	20 %	40 %	0 %	375294317
123	NC_016768	CGGCG	2	10	140947	140956	0 %	0 %	60 %	40 %	375294318
124	NC_016768	TGCGG	2	10	141580	141589	0 %	20 %	60 %	20 %	375294319
125	NC_016768	CGCTG	2	10	142287	142296	0 %	20 %	40 %	40 %	375294320
126	NC_016768	GTTGC	2	10	142833	142842	0 %	40 %	40 %	20 %	375294320
127	NC_016768	CCGAT	2	10	143581	143590	20 %	20 %	20 %	40 %	375294320
128	NC_016768	ATCGC	2	10	144272	144281	20 %	20 %	20 %	40 %	375294321
129	NC_016768	AACCG	2	10	145011	145020	40 %	0 %	20 %	40 %	375294321
130	NC_016768	CCGCC	2	10	145598	145607	0 %	0 %	20 %	80 %	375294321
131	NC_016768	CCGCC	2	10	146241	146250	0 %	0 %	20 %	80 %	375294322
132	NC_016768	GGGTC	2	10	147995	148004	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016768	ATCGG	2	10	149725	149734	20 %	20 %	40 %	20 %	375294326
134	NC_016768	ATTGG	2	10	152561	152570	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016768	AGCGA	2	10	154464	154473	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016768	TCGTC	2	10	154811	154820	0 %	40 %	20 %	40 %	375294330
137	NC_016768	CACGC	2	10	155275	155284	20 %	0 %	20 %	60 %	375294330
138	NC_016768	ATTCT	2	10	156119	156128	20 %	60 %	0 %	20 %	375294331
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146	NC_016768	GTCGC	2	10	161813	161822	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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197	NC_016768	GCCGC	2	10	222475	222484	0 %	0 %	40 %	60 %	375294395
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243	NC_016768	CGAAC	2	10	289881	289890	40 %	0 %	20 %	40 %	375294447
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246	NC_016768	ACGCC	2	10	294166	294175	20 %	0 %	20 %	60 %	375294450
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248	NC_016768	TGCGC	2	10	302130	302139	0 %	20 %	40 %	40 %	375294457
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258	NC_016768	AGCGG	2	10	314238	314247	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
259	NC_016768	CGCAG	2	10	314560	314569	20 %	0 %	40 %	40 %	375294469
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262	NC_016768	TCGGC	2	10	316401	316410	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
263	NC_016768	CCTGG	2	10	316949	316958	0 %	20 %	40 %	40 %	375294472
264	NC_016768	GGCCG	2	10	320054	320063	0 %	0 %	60 %	40 %	375294473
265	NC_016768	TGCGC	2	10	320551	320560	0 %	20 %	40 %	40 %	375294473
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