MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Marinitoga piezophila KA3 chromosome

Total Repeats: 1354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016751	ATTTTG	2	12	3426	3437	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374339027
2	NC_016751	AATCTA	2	12	3807	3818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374339027
3	NC_016751	TTATAT	2	12	4674	4685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339029
4	NC_016751	ATTTTC	2	12	5320	5331	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374339029
5	NC_016751	AAAATA	2	12	6092	6103	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374339030
6	NC_016751	TTGAAA	2	12	6258	6269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374339030
7	NC_016751	GAAATA	2	12	7560	7571	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374339033
8	NC_016751	ATGGGA	2	12	7756	7767	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374339033
9	NC_016751	TTAGCT	2	12	7794	7805	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374339033
10	NC_016751	ATGAAA	2	12	8142	8153	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374339033
11	NC_016751	AATAAA	2	12	9626	9637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374339035
12	NC_016751	TGGAAT	2	12	13219	13230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339038
13	NC_016751	TAAAAA	2	12	13494	13505	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374339038
14	NC_016751	AAAAAT	2	12	14106	14117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016751	ATATAG	2	12	16118	16129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374339043
16	NC_016751	AAAAGA	2	12	18329	18340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374339046
17	NC_016751	ACATCC	2	12	18563	18574	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	374339046
18	NC_016751	TTTATC	2	12	18817	18828	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374339047
19	NC_016751	CAAAAT	2	12	19035	19046	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374339047
20	NC_016751	GAAAAT	2	12	20203	20214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374339049
21	NC_016751	GCATTT	2	12	23028	23039	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374339053
22	NC_016751	TTTTCA	2	12	25066	25077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374339056
23	NC_016751	TCAACA	2	12	27761	27772	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374339058
24	NC_016751	CTTTTT	2	12	30056	30067	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374339060
25	NC_016751	TCAAAA	2	12	33714	33725	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374339063
26	NC_016751	ATTTGG	2	12	35468	35479	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374339064
27	NC_016751	TTTAAA	2	12	36968	36979	50 %	50 %	0 %	0 %	374339067
28	NC_016751	AGGTAT	2	12	39973	39984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339070
29	NC_016751	AAATAA	2	12	41661	41672	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374339072
30	NC_016751	GAATTA	2	12	43361	43372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374339073
31	NC_016751	TGAAAA	2	12	43506	43517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374339073
32	NC_016751	ATTAAA	2	12	45499	45510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339075
33	NC_016751	TTGAAA	2	12	46224	46235	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374339075
34	NC_016751	GAAATA	2	12	46688	46699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374339075
35	NC_016751	TTTATC	2	12	47910	47921	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374339076
36	NC_016751	ATCAAA	2	12	48306	48317	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374339076
37	NC_016751	ATTTTT	2	12	48849	48860	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374339076
38	NC_016751	TTTTCT	2	12	49159	49170	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374339076
39	NC_016751	ATATAA	2	12	49970	49981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339077
40	NC_016751	ATTATA	2	12	50946	50957	50 %	50 %	0 %	0 %	374339079
41	NC_016751	TGGAAA	2	12	53331	53342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374339081
42	NC_016751	AATTGA	2	12	57442	57453	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374339085
43	NC_016751	GATATT	2	12	61061	61072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374339088
44	NC_016751	AAATCC	2	12	61309	61320	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374339088
45	NC_016751	GGAATA	2	12	61598	61609	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374339088
46	NC_016751	AGAAAT	2	12	62755	62766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374339089
47	NC_016751	TTTTTA	2	12	63926	63937	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016751	AGAAAA	2	12	64571	64582	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374339090
49	NC_016751	TGAAAA	2	12	66697	66708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374339091
50	NC_016751	ATTATA	2	12	67353	67364	50 %	50 %	0 %	0 %	374339091
51	NC_016751	TCCTGA	2	12	69113	69124	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374339093
52	NC_016751	AATAGT	2	12	69609	69620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374339094
53	NC_016751	GGTGAA	2	12	71620	71631	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374339095
54	NC_016751	ATTTGA	2	12	71718	71729	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374339095
55	NC_016751	TCAATT	2	12	79748	79759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374339104
56	NC_016751	AATTAA	2	12	79926	79937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339104
57	NC_016751	AAAATT	2	12	84649	84660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339108
58	NC_016751	CAAAAT	2	12	85355	85366	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374339109
59	NC_016751	AGGAGT	2	12	87518	87529	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374339110
60	NC_016751	AGGTAT	2	12	87623	87634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339110
61	NC_016751	TGAATT	2	12	89456	89467	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374339113
62	NC_016751	ATGGAT	2	12	92446	92457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339115
63	NC_016751	AAAGAA	2	12	94659	94670	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374339117
64	NC_016751	ATACAC	2	12	96736	96747	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374339118
65	NC_016751	AAAGAA	2	12	97815	97826	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374339118
66	NC_016751	TGAAGA	2	12	100769	100780	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374339123
67	NC_016751	TTGGAA	2	12	101161	101172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339123
68	NC_016751	AATAGA	2	12	103506	103517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374339125
69	NC_016751	AATTTC	2	12	103548	103559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374339125
70	NC_016751	TATAAA	2	12	104082	104093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339125
71	NC_016751	TTTATC	2	12	111510	111521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374339132
72	NC_016751	ATTTAT	2	12	111725	111736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339132
73	NC_016751	AAATAA	2	12	112743	112754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016751	AAATTT	2	12	113120	113131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016751	AGAAAA	2	12	113817	113828	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374339135
76	NC_016751	ATGACC	2	12	113915	113926	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374339135
77	NC_016751	GTTTTT	2	12	115357	115368	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	374339137
78	NC_016751	AGCTGT	2	12	115446	115457	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374339137
79	NC_016751	TATCAT	2	12	115827	115838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374339138
80	NC_016751	ATCTTT	2	12	118958	118969	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374339142
81	NC_016751	TTTAAT	2	12	119367	119378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339142
82	NC_016751	ATATAA	2	12	120786	120797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339144
83	NC_016751	TCTAAT	2	12	123477	123488	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374339145
84	NC_016751	AACTTT	2	12	124815	124826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374339146
85	NC_016751	AAATAA	2	12	125436	125447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016751	ATTTGC	2	12	125865	125876	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374339148
87	NC_016751	TTAAAA	2	12	126890	126901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016751	TTTTTA	2	12	129546	129557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374339150
89	NC_016751	AAAAAT	2	12	133751	133762	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016751	ATAAAA	2	12	135013	135024	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374339157
91	NC_016751	TTCTGT	2	12	135245	135256	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	374339158
92	NC_016751	CTTCTA	2	12	138229	138240	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374339160
93	NC_016751	TAATTG	2	12	140077	140088	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374339163
94	NC_016751	TCCAAC	2	12	142600	142611	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	374339165
95	NC_016751	CCAGAA	2	12	143120	143131	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	374339165
96	NC_016751	CCAGAA	2	12	144950	144961	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	374339165
97	NC_016751	CATCTT	2	12	146472	146483	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	374339167
98	NC_016751	ATACTA	2	12	147710	147721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016751	TCCAGA	2	12	147994	148005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	374339168
100	NC_016751	AAAAGG	2	12	151858	151869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339171
101	NC_016751	GAAAAA	2	12	158031	158042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374339180
102	NC_016751	AAAAGA	2	12	159048	159059	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374339181
103	NC_016751	TAATTT	2	12	159525	159536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339182
104	NC_016751	AATAAA	2	12	159555	159566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374339182
105	NC_016751	TTTCAA	2	12	160142	160153	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374339182
106	NC_016751	ATACAT	2	12	160466	160477	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374339182
107	NC_016751	CTTGAT	2	12	161320	161331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374339182
108	NC_016751	ACATAT	2	12	161838	161849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374339183
109	NC_016751	GAAGTA	2	12	162840	162851	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374339183
110	NC_016751	AATAAA	2	12	164336	164347	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374339183
111	NC_016751	TAGAGG	2	12	166702	166713	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374339185
112	NC_016751	GAAAAA	2	12	169252	169263	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374339187
113	NC_016751	TTGAAA	2	12	169847	169858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374339187
114	NC_016751	ATAATT	2	12	171083	171094	50 %	50 %	0 %	0 %	374339187
115	NC_016751	AAATTC	2	12	171906	171917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374339187
116	NC_016751	TCAATT	2	12	173032	173043	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374339188
117	NC_016751	TAAATT	2	12	174405	174416	50 %	50 %	0 %	0 %	374339188
118	NC_016751	AAATCA	2	12	177744	177755	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374339191
119	NC_016751	TAATTT	2	12	179948	179959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339194
120	NC_016751	ATATTA	2	12	180209	180220	50 %	50 %	0 %	0 %	374339195
121	NC_016751	TAAGGT	2	12	180430	180441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339195
122	NC_016751	CATTGG	2	12	181587	181598	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374339197
123	NC_016751	GTTATT	2	12	182092	182103	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374339198
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