MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 chromosome

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016751	AAAAAT	2	12	14106	14117	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016751	TTTTTA	2	12	63926	63937	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016751	AAATAA	2	12	112743	112754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016751	AAATTT	2	12	113120	113131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016751	AAATAA	2	12	125436	125447	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016751	TTAAAA	2	12	126890	126901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016751	AAAAAT	2	12	133751	133762	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016751	ATACTA	2	12	147710	147721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016751	TAAAGA	2	12	188915	188926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016751	TGTTAT	2	12	203436	203447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016751	AAAAAT	2	12	217377	217388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016751	TAAAAA	2	12	294151	294162	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016751	TTATTT	2	12	305140	305151	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016751	ATATTT	2	12	309417	309428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016751	AGTTTT	2	12	314174	314185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016751	GATTTA	2	12	338154	338165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016751	TATTTT	2	12	353221	353232	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016751	TTATAA	2	12	421836	421847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016751	CTCTTT	2	12	426064	426075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016751	TATTTT	2	12	435831	435842	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016751	TATAAT	2	12	435888	435899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016751	TTTTTA	2	12	441800	441811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016751	TAAAAT	2	12	452875	452886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016751	AGTTTT	2	12	453479	453490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016751	TTAATT	2	12	467480	467491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016751	TTGAAA	2	12	492919	492930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016751	AATTTA	2	12	560570	560581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016751	ATTTTT	2	12	593566	593577	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016751	GTTTTT	2	12	593767	593778	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016751	TTTAAA	2	12	697819	697830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016751	ATTTTC	2	12	713581	713592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016751	TTTGTA	2	12	717636	717647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016751	GCTCCT	2	12	741916	741927	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016751	TAATTT	2	12	752108	752119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016751	TAGTAA	2	12	769428	769439	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016751	GCTCCT	2	12	830961	830972	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016751	CTTTTT	2	12	848088	848099	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016751	TCATAT	2	12	881607	881618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016751	TTTTTA	2	12	894006	894017	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016751	TTTTAT	2	12	909910	909921	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016751	GAATAG	2	12	910450	910461	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016751	TTAGAA	2	12	928635	928646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016751	TTTTAT	2	12	931248	931259	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016751	CTCTCC	2	12	935961	935972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016751	AAAAAG	2	12	962746	962757	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016751	TATAAT	2	12	964771	964782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016751	ATAAAA	2	12	969734	969745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016751	TGTAAT	2	12	983811	983822	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016751	TTAATT	2	12	989970	989981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016751	TAAAAA	2	12	991486	991497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016751	AGAAAA	2	12	1054812	1054823	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016751	TATATT	2	12	1074202	1074213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016751	ATCCCC	2	12	1093034	1093045	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016751	CATATA	2	12	1093052	1093063	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016751	GAAAAA	2	12	1131472	1131483	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016751	TAATTA	2	12	1163977	1163988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016751	TCCTAT	2	12	1215769	1215780	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016751	CATTAT	2	12	1218298	1218309	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016751	CAAAAG	2	12	1218405	1218416	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016751	GTAAGT	2	12	1262900	1262911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016751	TTAATT	2	12	1262941	1262952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016751	TAATTT	2	12	1278226	1278237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016751	TATAAT	2	12	1278257	1278268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016751	TATAAT	2	12	1303881	1303892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016751	ATTAAC	2	12	1358032	1358043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016751	ATAAAA	2	12	1444487	1444498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016751	CAGGAG	2	12	1477419	1477430	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016751	ATATTT	2	12	1495029	1495040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016751	TTATAA	2	12	1500043	1500054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016751	ATTTTT	2	12	1504768	1504779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016751	TATTTT	2	12	1506032	1506043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016751	AAAAAT	2	12	1514010	1514021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016751	AAAAAT	2	12	1576230	1576241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016751	TAATTT	2	12	1576584	1576595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016751	AATTTT	2	12	1649969	1649980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016751	TAATTA	2	12	1655891	1655902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016751	TCTATT	2	12	1682856	1682867	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016751	AAGAAA	2	12	1724813	1724824	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016751	ATGGAA	2	12	1725814	1725825	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016751	GTATAT	2	12	1768175	1768186	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016751	TGATAA	2	12	1768241	1768252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016751	GTTTTT	2	12	1841406	1841417	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016751	TTAATT	2	12	1846368	1846379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016751	ATTTTT	2	12	1861412	1861423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016751	TTTTAA	2	12	1879510	1879521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016751	CTTTTT	2	12	1885483	1885494	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016751	TATTAA	2	12	1913483	1913494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016751	AAATTA	2	12	1944683	1944694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016751	ATATTT	2	12	1978937	1978948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016751	TTTATT	2	12	1979125	1979136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016751	TAATTA	2	12	1979156	1979167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016751	TCATTT	2	12	1995973	1995984	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016751	AAAAGC	2	12	2015511	2015522	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016751	TTCATT	2	12	2097356	2097367	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016751	AATATA	2	12	2114315	2114326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016751	TTATAA	2	12	2168403	2168414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016751	TTTTTA	2	12	2183363	2183374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016751	ATTTTT	2	12	2195671	2195682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016751	AATTGG	2	12	2199218	2199229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016751	ATATTT	2	12	2200729	2200740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016751	CAAAAT	2	12	2205391	2205402	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016751	ATTTTT	2	12	2221555	2221566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.