MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Marinitoga piezophila KA3 chromosome

Total Repeats: 2307

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016751	ATATA	2	10	2097	2106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016751	ATTTC	2	10	2310	2319	20 %	60 %	0 %	20 %	374339025
3	NC_016751	AAGAG	2	10	2581	2590	60 %	0 %	40 %	0 %	374339025
4	NC_016751	GTTTT	2	10	3315	3324	0 %	80 %	20 %	0 %	374339027
5	NC_016751	TATTT	2	10	5605	5614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016751	AAAAG	2	10	7724	7733	80 %	0 %	20 %	0 %	374339033
7	NC_016751	TTCAT	2	10	8357	8366	20 %	60 %	0 %	20 %	374339033
8	NC_016751	AGGAT	2	10	9241	9250	40 %	20 %	40 %	0 %	374339034
9	NC_016751	CTTTT	2	10	9817	9826	0 %	80 %	0 %	20 %	374339035
10	NC_016751	ATAAA	2	10	10335	10344	80 %	20 %	0 %	0 %	374339035
11	NC_016751	AATTT	2	10	12776	12785	40 %	60 %	0 %	0 %	374339038
12	NC_016751	TAAAA	2	10	13966	13975	80 %	20 %	0 %	0 %	374339039
13	NC_016751	AACAA	2	10	15238	15247	80 %	0 %	0 %	20 %	374339041
14	NC_016751	ATAAA	2	10	16283	16292	80 %	20 %	0 %	0 %	374339043
15	NC_016751	AAGTA	2	10	17140	17149	60 %	20 %	20 %	0 %	374339045
16	NC_016751	ATTTA	2	10	18913	18922	40 %	60 %	0 %	0 %	374339047
17	NC_016751	TTTGA	2	10	19203	19212	20 %	60 %	20 %	0 %	374339047
18	NC_016751	TTTCT	2	10	19314	19323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016751	AAGTA	2	10	19734	19743	60 %	20 %	20 %	0 %	374339048
20	NC_016751	AATAT	2	10	23839	23848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016751	AAGAA	2	10	24621	24630	80 %	0 %	20 %	0 %	374339055
22	NC_016751	TATAT	2	10	24674	24683	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016751	TCATA	2	10	25799	25808	40 %	40 %	0 %	20 %	374339056
24	NC_016751	TATAA	2	10	26618	26627	60 %	40 %	0 %	0 %	374339057
25	NC_016751	AAAAT	2	10	27227	27236	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016751	TAAGC	2	10	27697	27706	40 %	20 %	20 %	20 %	374339058
27	NC_016751	TATTT	2	10	28989	28998	20 %	80 %	0 %	0 %	374339059
28	NC_016751	CTTTT	2	10	29873	29882	0 %	80 %	0 %	20 %	374339060
29	NC_016751	ATATA	2	10	31094	31103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016751	AACAT	2	10	31725	31734	60 %	20 %	0 %	20 %	374339062
31	NC_016751	TCAAA	2	10	33534	33543	60 %	20 %	0 %	20 %	374339063
32	NC_016751	AAAAG	2	10	33833	33842	80 %	0 %	20 %	0 %	374339063
33	NC_016751	GGTAT	2	10	35334	35343	20 %	40 %	40 %	0 %	374339064
34	NC_016751	AAAAT	2	10	36456	36465	80 %	20 %	0 %	0 %	374339066
35	NC_016751	AAAGG	2	10	36731	36740	60 %	0 %	40 %	0 %	374339066
36	NC_016751	GGAAT	2	10	38080	38089	40 %	20 %	40 %	0 %	374339068
37	NC_016751	ATATA	2	10	40247	40256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016751	GGAAT	2	10	43584	43593	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016751	CAAAG	2	10	45008	45017	60 %	0 %	20 %	20 %	374339075
40	NC_016751	AAAGT	2	10	45297	45306	60 %	20 %	20 %	0 %	374339075
41	NC_016751	AAAAG	2	10	46063	46072	80 %	0 %	20 %	0 %	374339075
42	NC_016751	GTAAT	2	10	46317	46326	40 %	40 %	20 %	0 %	374339075
43	NC_016751	AAAAC	2	10	46392	46401	80 %	0 %	0 %	20 %	374339075
44	NC_016751	GAAAT	2	10	46554	46563	60 %	20 %	20 %	0 %	374339075
45	NC_016751	TACAA	2	10	46858	46867	60 %	20 %	0 %	20 %	374339075
46	NC_016751	ATAAA	2	10	48465	48474	80 %	20 %	0 %	0 %	374339076
47	NC_016751	AAAAT	2	10	49084	49093	80 %	20 %	0 %	0 %	374339076
48	NC_016751	GAAAA	2	10	49461	49470	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016751	AGAAA	2	10	49937	49946	80 %	0 %	20 %	0 %	374339077
50	NC_016751	TATAA	2	10	51521	51530	60 %	40 %	0 %	0 %	374339079
51	NC_016751	AAATT	2	10	52513	52522	60 %	40 %	0 %	0 %	374339080
52	NC_016751	TAATG	2	10	52627	52636	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016751	AATGA	2	10	53923	53932	60 %	20 %	20 %	0 %	374339081
54	NC_016751	AGAAA	2	10	54165	54174	80 %	0 %	20 %	0 %	374339082
55	NC_016751	ATTAT	2	10	54846	54855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016751	AAGAA	3	15	55876	55890	80 %	0 %	20 %	0 %	374339084
57	NC_016751	AATTG	2	10	56164	56173	40 %	40 %	20 %	0 %	374339084
58	NC_016751	AGAAA	2	10	57967	57976	80 %	0 %	20 %	0 %	374339085
59	NC_016751	AAAAT	2	10	57977	57986	80 %	20 %	0 %	0 %	374339085
60	NC_016751	GATTT	2	10	58350	58359	20 %	60 %	20 %	0 %	374339085
61	NC_016751	TAAAA	2	10	58697	58706	80 %	20 %	0 %	0 %	374339086
62	NC_016751	ATGGA	2	10	59609	59618	40 %	20 %	40 %	0 %	374339086
63	NC_016751	TTATA	2	10	60099	60108	40 %	60 %	0 %	0 %	374339087
64	NC_016751	ATGTT	2	10	60477	60486	20 %	60 %	20 %	0 %	374339087
65	NC_016751	ATTAT	2	10	61645	61654	40 %	60 %	0 %	0 %	374339088
66	NC_016751	AATAC	2	10	65995	66004	60 %	20 %	0 %	20 %	374339091
67	NC_016751	TAAAA	2	10	66397	66406	80 %	20 %	0 %	0 %	374339091
68	NC_016751	ATGAA	2	10	67020	67029	60 %	20 %	20 %	0 %	374339091
69	NC_016751	ATAGA	2	10	70097	70106	60 %	20 %	20 %	0 %	374339094
70	NC_016751	AAAAT	2	10	71309	71318	80 %	20 %	0 %	0 %	374339095
71	NC_016751	TTAAT	2	10	74038	74047	40 %	60 %	0 %	0 %	374339096
72	NC_016751	GAATT	2	10	76339	76348	40 %	40 %	20 %	0 %	374339099
73	NC_016751	GTATA	2	10	78827	78836	40 %	40 %	20 %	0 %	374339102
74	NC_016751	TATAA	2	10	78888	78897	60 %	40 %	0 %	0 %	374339102
75	NC_016751	ATATT	2	10	79823	79832	40 %	60 %	0 %	0 %	374339104
76	NC_016751	TCTTT	2	10	82018	82027	0 %	80 %	0 %	20 %	374339106
77	NC_016751	ATTTT	2	10	82091	82100	20 %	80 %	0 %	0 %	374339106
78	NC_016751	TATAA	2	10	82376	82385	60 %	40 %	0 %	0 %	374339107
79	NC_016751	CTTTT	2	10	83868	83877	0 %	80 %	0 %	20 %	374339107
80	NC_016751	CCTGT	2	10	84965	84974	0 %	40 %	20 %	40 %	374339109
81	NC_016751	ATTTT	2	10	85663	85672	20 %	80 %	0 %	0 %	374339109
82	NC_016751	AAATC	2	10	85712	85721	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016751	ATTAT	2	10	85724	85733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016751	ATAAA	2	10	86359	86368	80 %	20 %	0 %	0 %	374339110
85	NC_016751	ATAAA	2	10	87220	87229	80 %	20 %	0 %	0 %	374339110
86	NC_016751	ATAGA	2	10	87841	87850	60 %	20 %	20 %	0 %	374339110
87	NC_016751	TATAA	2	10	88301	88310	60 %	40 %	0 %	0 %	374339111
88	NC_016751	AGGAA	2	10	89000	89009	60 %	0 %	40 %	0 %	374339113
89	NC_016751	TCAAT	2	10	92006	92015	40 %	40 %	0 %	20 %	374339114
90	NC_016751	AAAAT	2	10	92106	92115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016751	CAGGT	2	10	92560	92569	20 %	20 %	40 %	20 %	374339115
92	NC_016751	AAGAA	2	10	93353	93362	80 %	0 %	20 %	0 %	374339115
93	NC_016751	AAAAT	2	10	94332	94341	80 %	20 %	0 %	0 %	374339117
94	NC_016751	AAAAT	2	10	94708	94717	80 %	20 %	0 %	0 %	374339117
95	NC_016751	AATTG	2	10	95477	95486	40 %	40 %	20 %	0 %	374339117
96	NC_016751	ACAGA	2	10	96009	96018	60 %	0 %	20 %	20 %	374339117
97	NC_016751	ATATA	2	10	97067	97076	60 %	40 %	0 %	0 %	374339118
98	NC_016751	ATACG	2	10	97154	97163	40 %	20 %	20 %	20 %	374339118
99	NC_016751	AAAAT	2	10	97804	97813	80 %	20 %	0 %	0 %	374339118
100	NC_016751	ATAGA	2	10	102625	102634	60 %	20 %	20 %	0 %	374339124
101	NC_016751	TGTAA	2	10	102948	102957	40 %	40 %	20 %	0 %	374339124
102	NC_016751	ACATT	2	10	106637	106646	40 %	40 %	0 %	20 %	374339128
103	NC_016751	AAAAG	2	10	107242	107251	80 %	0 %	20 %	0 %	374339128
104	NC_016751	TATAA	2	10	107419	107428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016751	TAATA	2	10	108991	109000	60 %	40 %	0 %	0 %	374339130
106	NC_016751	ATGGA	2	10	110009	110018	40 %	20 %	40 %	0 %	374339131
107	NC_016751	CCTTT	2	10	111191	111200	0 %	60 %	0 %	40 %	374339132
108	NC_016751	AACAA	2	10	112371	112380	80 %	0 %	0 %	20 %	374339133
109	NC_016751	ATAAA	2	10	112762	112771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016751	GTATT	2	10	112988	112997	20 %	60 %	20 %	0 %	374339134
111	NC_016751	AAAGA	2	10	114172	114181	80 %	0 %	20 %	0 %	374339136
112	NC_016751	AATTT	2	10	114911	114920	40 %	60 %	0 %	0 %	374339136
113	NC_016751	CTTCT	2	10	117393	117402	0 %	60 %	0 %	40 %	374339140
114	NC_016751	TGTAT	2	10	117523	117532	20 %	60 %	20 %	0 %	374339140
115	NC_016751	TTTCA	2	10	120587	120596	20 %	60 %	0 %	20 %	374339144
116	NC_016751	TATAT	2	10	123014	123023	40 %	60 %	0 %	0 %	374339145
117	NC_016751	TTGGA	2	10	123949	123958	20 %	40 %	40 %	0 %	374339145
118	NC_016751	TAAAA	2	10	124063	124072	80 %	20 %	0 %	0 %	374339145
119	NC_016751	CCTCA	2	10	124455	124464	20 %	20 %	0 %	60 %	374339146
120	NC_016751	ATTTT	2	10	125239	125248	20 %	80 %	0 %	0 %	374339147
121	NC_016751	ATTGA	2	10	126851	126860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016751	GAAAT	2	10	127492	127501	60 %	20 %	20 %	0 %	374339149
123	NC_016751	ATTTA	2	10	127573	127582	40 %	60 %	0 %	0 %	374339149
124	NC_016751	TATGA	2	10	128646	128655	40 %	40 %	20 %	0 %	374339149
125	NC_016751	ATAGA	2	10	128866	128875	60 %	20 %	20 %	0 %	374339149
126	NC_016751	TATAA	2	10	129915	129924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016751	GTAAA	2	10	132176	132185	60 %	20 %	20 %	0 %	374339154
128	NC_016751	TTTTA	2	10	133714	133723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016751	ATTTT	2	10	133823	133832	20 %	80 %	0 %	0 %	374339156
130	NC_016751	TGTAA	2	10	136137	136146	40 %	40 %	20 %	0 %	374339158
131	NC_016751	AAAGA	2	10	139661	139670	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016751	AAAAT	2	10	140494	140503	80 %	20 %	0 %	0 %	374339163
133	NC_016751	AAGAA	2	10	140924	140933	80 %	0 %	20 %	0 %	374339164
134	NC_016751	AAATA	2	10	142177	142186	80 %	20 %	0 %	0 %	374339164
135	NC_016751	TTCTT	2	10	143661	143670	0 %	80 %	0 %	20 %	374339165
136	NC_016751	AAAAT	2	10	145766	145775	80 %	20 %	0 %	0 %	374339166
137	NC_016751	ATTTT	3	15	146436	146450	20 %	80 %	0 %	0 %	374339167
138	NC_016751	TAAAA	2	10	147835	147844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016751	ATTAC	2	10	148898	148907	40 %	40 %	0 %	20 %	374339168
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