MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 chromosome

Total Repeats: 264

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016751	ATATA	2	10	2097	2106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016751	TATTT	2	10	5605	5614	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016751	TTTCT	2	10	19314	19323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016751	AATAT	2	10	23839	23848	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016751	TATAT	2	10	24674	24683	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016751	AAAAT	2	10	27227	27236	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016751	ATATA	2	10	31094	31103	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016751	ATATA	2	10	40247	40256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016751	GGAAT	2	10	43584	43593	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016751	GAAAA	2	10	49461	49470	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016751	TAATG	2	10	52627	52636	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016751	ATTAT	2	10	54846	54855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016751	AAATC	2	10	85712	85721	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016751	ATTAT	2	10	85724	85733	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016751	AAAAT	2	10	92106	92115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016751	TATAA	2	10	107419	107428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016751	ATAAA	2	10	112762	112771	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016751	ATTGA	2	10	126851	126860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016751	TATAA	2	10	129915	129924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016751	TTTTA	2	10	133714	133723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016751	AAAGA	2	10	139661	139670	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016751	TAAAA	2	10	147835	147844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016751	AATAA	2	10	156834	156843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016751	TAAAA	2	10	156956	156965	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016751	AAAAT	2	10	166847	166856	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016751	ATAAA	2	10	203973	203982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016751	TGTAT	2	10	211438	211447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016751	CGATA	2	10	211675	211684	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016751	ATTGG	2	10	212409	212418	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016751	CTTTT	2	10	213447	213456	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016751	ATTTT	2	10	221730	221739	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016751	GTATA	2	10	221798	221807	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016751	AATAT	2	10	260845	260854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016751	ATATA	2	10	261050	261059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016751	TAATA	2	10	281219	281228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016751	AAAAG	2	10	291004	291013	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016751	CCAAT	2	10	292043	292052	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016751	AAATT	2	10	294011	294020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016751	TAAAA	2	10	300764	300773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016751	TAATT	2	10	303664	303673	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016751	TCAAT	2	10	309476	309485	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016751	TAAAA	2	10	338262	338271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016751	AAAAT	2	10	358517	358526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016751	TAAAA	2	10	370745	370754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016751	TGTTT	2	10	382279	382288	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016751	GTGGG	2	10	391125	391134	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016751	GGAAT	2	10	393817	393826	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016751	TTCTA	2	10	397136	397145	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016751	TTTAT	2	10	403183	403192	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016751	TCGTA	2	10	403209	403218	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016751	AATTA	2	10	413501	413510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016751	GTTTT	2	10	425991	426000	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016751	GAAAC	2	10	426725	426734	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016751	TATAT	2	10	427221	427230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016751	AAGTA	2	10	453466	453475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016751	ATCCC	2	10	466167	466176	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_016751	TAATT	2	10	474244	474253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016751	TATAA	2	10	492487	492496	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016751	TAATA	2	10	523124	523133	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016751	CATCA	2	10	526991	527000	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016751	TCATT	2	10	531405	531414	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016751	ATTAT	2	10	538910	538919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016751	TAATA	2	10	538951	538960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016751	TAAAA	2	10	569388	569397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016751	ATAAA	2	10	569543	569552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016751	TTTTA	2	10	579798	579807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016751	TAATA	2	10	615640	615649	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016751	AAATT	2	10	626762	626771	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016751	ATTTT	2	10	635329	635338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016751	TTTTA	2	10	646083	646092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016751	TTAAA	2	10	662994	663003	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016751	TTTAT	2	10	696474	696483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016751	AATTG	2	10	697807	697816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016751	ATTAT	2	10	702824	702833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016751	TTTAA	2	10	713696	713705	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016751	CTCCC	2	10	744104	744113	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
77	NC_016751	TTCCC	2	10	744484	744493	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_016751	CTTAT	2	10	746562	746571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016751	ACATT	2	10	748802	748811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016751	TTATT	2	10	749687	749696	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016751	TACAT	2	10	783205	783214	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016751	TATAT	2	10	789944	789953	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016751	TAAAA	2	10	793063	793072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016751	TAATT	2	10	800593	800602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016751	ATTAT	2	10	822203	822212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016751	ATTTT	2	10	822991	823000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016751	TAAAA	2	10	824477	824486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016751	CTCCC	2	10	833149	833158	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
89	NC_016751	TTCCC	2	10	833529	833538	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
90	NC_016751	GTTTT	2	10	841641	841650	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016751	AAAAT	2	10	841712	841721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016751	GGAGC	2	10	881800	881809	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016751	ATTTT	2	10	886463	886472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016751	CAAAT	2	10	894151	894160	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016751	ATTAT	2	10	908826	908835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016751	CCTTT	2	10	909041	909050	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_016751	ATATT	2	10	909229	909238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016751	TCAAA	2	10	909287	909296	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016751	ATAAA	2	10	909807	909816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016751	AAAAT	2	10	910615	910624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016751	CATTT	2	10	911184	911193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016751	ACCTT	2	10	916480	916489	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016751	ATATT	2	10	916668	916677	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016751	TCAAA	2	10	916726	916735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016751	ATAAA	2	10	916857	916866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016751	ATTTT	2	10	916893	916902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016751	ATAAA	2	10	916935	916944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016751	ATAAA	2	10	917029	917038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016751	AAACA	2	10	917549	917558	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016751	TAAAG	2	10	917613	917622	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016751	ATTTT	2	10	924442	924451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016751	TATTC	2	10	936007	936016	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_016751	TAATT	2	10	954852	954861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016751	TATAA	2	10	962863	962872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016751	AAAAT	2	10	964730	964739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016751	TTTTC	2	10	983839	983848	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016751	ATTTA	2	10	996997	997006	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016751	TTTTA	2	10	997040	997049	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016751	TATAT	2	10	1008753	1008762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016751	ATATT	2	10	1012264	1012273	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016751	TATAT	2	10	1017274	1017283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016751	TTTAA	2	10	1035341	1035350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016751	ATATA	2	10	1051376	1051385	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016751	CATAA	2	10	1053957	1053966	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016751	AATTT	2	10	1054194	1054203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016751	GTATT	2	10	1054755	1054764	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016751	TTTAA	2	10	1077967	1077976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016751	TGATA	2	10	1096054	1096063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016751	TATAA	2	10	1102044	1102053	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016751	ATTTT	2	10	1119544	1119553	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016751	ATAAA	2	10	1134545	1134554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016751	ATATT	2	10	1138446	1138455	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016751	AAATT	2	10	1139065	1139074	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016751	TATTT	2	10	1144663	1144672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016751	CAAAA	2	10	1145023	1145032	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016751	ATATA	2	10	1149303	1149312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016751	AGTAT	2	10	1165839	1165848	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016751	TAAAA	2	10	1165857	1165866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016751	TAAAT	2	10	1177438	1177447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016751	AATTA	2	10	1177581	1177590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016751	TTTTC	2	10	1189195	1189204	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016751	CAATT	2	10	1193731	1193740	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_016751	ACCCC	2	10	1193967	1193976	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
144	NC_016751	CAATT	2	10	1198678	1198687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016751	AATTT	2	10	1200511	1200520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016751	TTTAC	2	10	1202777	1202786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016751	CATTT	2	10	1208746	1208755	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_016751	CAAAT	2	10	1210341	1210350	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.