MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 chromosome

Total Repeats: 2668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016751	CAA	2	6	8	13	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016751	TAT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016751	TAA	2	6	2087	2092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016751	AAC	2	6	2110	2115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016751	AGC	2	6	2883	2888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016751	TCC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016751	ATT	2	6	5616	5621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016751	TTA	2	6	6600	6605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016751	ATG	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016751	GGA	2	6	7473	7478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016751	TAA	2	6	11291	11296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016751	CTT	2	6	11309	11314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016751	AAT	2	6	11333	11338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016751	GTT	2	6	11342	11347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016751	TAA	2	6	11368	11373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016751	AGG	2	6	11401	11406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016751	CCT	2	6	13691	13696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016751	TAA	2	6	14081	14086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016751	ATA	2	6	14150	14155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016751	ATT	2	6	14162	14167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016751	ATA	2	6	14214	14219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016751	AGG	2	6	14301	14306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016751	AGG	2	6	14563	14568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016751	ATT	2	6	15611	15616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016751	GGT	2	6	16862	16867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016751	TAA	2	6	17163	17168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016751	TAA	2	6	17213	17218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016751	AGG	2	6	17264	17269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016751	AAT	2	6	18647	18652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016751	ATC	2	6	19260	19265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016751	AAT	3	9	19298	19306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016751	ATT	2	6	19326	19331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016751	ATA	2	6	19395	19400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016751	AGG	2	6	19416	19421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016751	TAT	2	6	24665	24670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016751	AAT	2	6	27215	27220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016751	GAT	2	6	27317	27322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016751	TCC	2	6	28696	28701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016751	TGG	2	6	31003	31008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016751	ATT	2	6	31088	31093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016751	TAA	4	12	34244	34255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016751	AAT	2	6	39577	39582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016751	TAT	2	6	41397	41402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016751	CAA	2	6	41437	41442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016751	AGG	2	6	41484	41489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016751	TGG	2	6	49636	49641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016751	ACC	2	6	49658	49663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016751	ATT	2	6	49748	49753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016751	TGT	2	6	50046	50051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016751	AAT	2	6	50073	50078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016751	AGG	2	6	50103	50108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016751	TAT	2	6	50645	50650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016751	AAT	2	6	52649	52654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016751	TAT	2	6	54050	54055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016751	ATG	2	6	54081	54086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016751	AGG	2	6	54114	54119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016751	AAT	2	6	54738	54743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016751	ATT	2	6	54772	54777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016751	ATT	2	6	54789	54794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016751	GTA	2	6	54818	54823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016751	AGT	2	6	54856	54861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016751	ATA	3	9	55814	55822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016751	TCA	2	6	56504	56509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016751	TTA	2	6	56545	56550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016751	GTT	2	6	56556	56561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016751	TAT	2	6	56566	56571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016751	TGA	2	6	56590	56595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016751	TAA	2	6	63973	63978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016751	ATA	2	6	68001	68006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016751	TAT	2	6	74764	74769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016751	AGG	2	6	74801	74806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016751	AGA	2	6	74807	74812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016751	CTT	2	6	77911	77916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016751	ATT	2	6	81498	81503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016751	AGA	2	6	81568	81573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016751	CAT	4	12	81586	81597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016751	CCG	2	6	81791	81796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016751	AAT	2	6	81831	81836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016751	ATT	2	6	81849	81854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016751	GAA	2	6	81865	81870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016751	TCC	2	6	85689	85694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016751	TAA	2	6	85706	85711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016751	TAA	2	6	92076	92081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016751	ATT	2	6	92090	92095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016751	TAT	2	6	92120	92125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016751	TAT	2	6	98796	98801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016751	GCA	2	6	98825	98830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016751	GAG	2	6	98890	98895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016751	CCG	2	6	98927	98932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016751	ATT	2	6	99197	99202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016751	GGT	2	6	104361	104366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016751	ATT	2	6	105755	105760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016751	ATA	2	6	105780	105785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016751	TTA	2	6	105809	105814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016751	ATA	2	6	107335	107340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016751	AAT	2	6	107448	107453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016751	AGG	2	6	107464	107469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016751	AGG	2	6	107979	107984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016751	TTA	2	6	107988	107993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016751	TAG	2	6	111033	111038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016751	TAA	3	9	112821	112829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016751	TTG	2	6	113192	113197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016751	AAT	2	6	113234	113239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016751	TCC	2	6	124886	124891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016751	TAA	2	6	124910	124915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016751	ATA	2	6	124920	124925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016751	ATT	2	6	126828	126833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016751	GGC	2	6	129495	129500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016751	ATT	2	6	129770	129775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016751	TCC	2	6	129776	129781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016751	TAC	2	6	129807	129812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016751	CTA	2	6	129892	129897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016751	ATA	2	6	130720	130725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016751	ACT	2	6	130753	130758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016751	TAT	2	6	133737	133742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016751	GTT	2	6	135038	135043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016751	CCT	2	6	138280	138285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016751	CTT	2	6	139620	139625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016751	TAT	2	6	139634	139639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016751	TAA	2	6	139751	139756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016751	AGG	2	6	139763	139768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016751	TGA	2	6	140752	140757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016751	AAT	2	6	142213	142218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016751	CTC	3	9	147657	147665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016751	TAA	2	6	147702	147707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016751	ACT	2	6	147856	147861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016751	ATT	2	6	147875	147880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016751	AGG	2	6	152894	152899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016751	AGG	2	6	154209	154214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016751	TTA	2	6	156923	156928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016751	AGG	2	6	157025	157030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016751	TAA	2	6	159294	159299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016751	AGG	2	6	159422	159427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016751	ATA	2	6	164562	164567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016751	ATT	2	6	166373	166378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016751	TAA	2	6	167014	167019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016751	TAT	2	6	168762	168767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016751	ATA	2	6	168845	168850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016751	TTG	2	6	168855	168860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016751	AAG	2	6	168864	168869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016751	TTG	2	6	168876	168881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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