MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 chromosome

Total Repeats: 33593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016751	TTG	2	6	109	114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
2	NC_016751	TAA	2	6	220	225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
3	NC_016751	TGT	2	6	440	445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
4	NC_016751	ATT	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
5	NC_016751	AAT	2	6	492	497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
6	NC_016751	TTA	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
7	NC_016751	TAA	2	6	572	577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
8	NC_016751	CAG	2	6	619	624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374339023
9	NC_016751	ATG	2	6	642	647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339023
10	NC_016751	AGA	2	6	659	664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
11	NC_016751	TTA	2	6	711	716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
12	NC_016751	TGA	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339023
13	NC_016751	ATT	2	6	785	790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
14	NC_016751	ATT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339023
15	NC_016751	GAA	2	6	834	839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
16	NC_016751	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
17	NC_016751	GTT	2	6	888	893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
18	NC_016751	GAT	2	6	972	977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339023
19	NC_016751	GTT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
20	NC_016751	ATA	2	6	1006	1011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339023
21	NC_016751	GAA	2	6	1094	1099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
22	NC_016751	TTG	2	6	1327	1332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339023
23	NC_016751	AGA	2	6	1410	1415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
24	NC_016751	TGA	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339023
25	NC_016751	AAG	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
26	NC_016751	GAA	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339023
27	NC_016751	TCT	2	6	1541	1546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339024
28	NC_016751	ATA	2	6	1585	1590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339024
29	NC_016751	TGA	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339024
30	NC_016751	CAG	2	6	1608	1613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374339024
31	NC_016751	CAT	2	6	1650	1655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374339024
32	NC_016751	TAA	2	6	1801	1806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339024
33	NC_016751	TTC	2	6	1807	1812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339024
34	NC_016751	TTC	2	6	1866	1871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339024
35	NC_016751	CTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339024
36	NC_016751	CAG	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374339024
37	NC_016751	GAA	2	6	2179	2184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339025
38	NC_016751	TCC	2	6	2227	2232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374339025
39	NC_016751	TAA	2	6	2265	2270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339025
40	NC_016751	AGA	2	6	2345	2350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339025
41	NC_016751	GAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339025
42	NC_016751	TGT	2	6	2391	2396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339025
43	NC_016751	TGT	2	6	2491	2496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339025
44	NC_016751	TGT	2	6	2635	2640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339025
45	NC_016751	TGC	2	6	2782	2787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374339025
46	NC_016751	TAA	2	6	2873	2878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339025
47	NC_016751	GCT	2	6	2897	2902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374339026
48	NC_016751	AAG	2	6	2932	2937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339026
49	NC_016751	TCT	2	6	2944	2949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339026
50	NC_016751	TCC	2	6	3165	3170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374339027
51	NC_016751	TAA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339027
52	NC_016751	TTG	2	6	3219	3224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339027
53	NC_016751	TAA	2	6	3336	3341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339027
54	NC_016751	AAT	2	6	3381	3386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339027
55	NC_016751	TAT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339027
56	NC_016751	TCA	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374339027
57	NC_016751	AAT	2	6	3596	3601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339027
58	NC_016751	TAT	2	6	3670	3675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339027
59	NC_016751	TTA	2	6	3771	3776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339027
60	NC_016751	CAC	2	6	3853	3858	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374339027
61	NC_016751	ACA	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374339028
62	NC_016751	GCC	2	6	3902	3907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374339028
63	NC_016751	AAG	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339028
64	NC_016751	AAC	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374339028
65	NC_016751	GGT	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374339028
66	NC_016751	ATT	2	6	4050	4055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339028
67	NC_016751	TTC	2	6	4118	4123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339028
68	NC_016751	GCC	2	6	4250	4255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374339028
69	NC_016751	CAT	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374339028
70	NC_016751	ATT	2	6	4317	4322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339028
71	NC_016751	ATC	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374339029
72	NC_016751	CTT	2	6	4488	4493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
73	NC_016751	TTC	2	6	4507	4512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
74	NC_016751	ATA	2	6	4553	4558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339029
75	NC_016751	GCA	2	6	4595	4600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374339029
76	NC_016751	ATT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339029
77	NC_016751	TCT	2	6	4736	4741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
78	NC_016751	TTC	2	6	4819	4824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
79	NC_016751	ATA	2	6	4839	4844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339029
80	NC_016751	ATG	2	6	4848	4853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339029
81	NC_016751	GCA	2	6	4910	4915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374339029
82	NC_016751	ACC	2	6	4930	4935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374339029
83	NC_016751	TAA	2	6	5026	5031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339029
84	NC_016751	CTT	2	6	5058	5063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
85	NC_016751	TTG	2	6	5106	5111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339029
86	NC_016751	AAT	2	6	5137	5142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339029
87	NC_016751	AAG	2	6	5244	5249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339029
88	NC_016751	TTC	2	6	5266	5271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
89	NC_016751	TGT	2	6	5286	5291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339029
90	NC_016751	TCT	2	6	5294	5299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
91	NC_016751	TCT	2	6	5354	5359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339029
92	NC_016751	AAT	2	6	5363	5368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339029
93	NC_016751	ATA	2	6	5397	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339029
94	NC_016751	AAG	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339029
95	NC_016751	ATA	2	6	5490	5495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339029
96	NC_016751	TGT	2	6	5503	5508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339029
97	NC_016751	ATT	2	6	5753	5758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339030
98	NC_016751	TAA	2	6	5803	5808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339030
99	NC_016751	AGG	2	6	5854	5859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374339030
100	NC_016751	TGG	2	6	5959	5964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374339030
101	NC_016751	TTC	2	6	5992	5997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339030
102	NC_016751	TAA	2	6	6009	6014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339030
103	NC_016751	TCA	2	6	6016	6021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374339030
104	NC_016751	TGA	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339030
105	NC_016751	TGT	2	6	6211	6216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339030
106	NC_016751	TTC	2	6	6250	6255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339030
107	NC_016751	GAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339030
108	NC_016751	ATT	2	6	6564	6569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339030
109	NC_016751	ATA	2	6	6619	6624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339031
110	NC_016751	GAA	2	6	6681	6686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339031
111	NC_016751	GCA	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374339031
112	NC_016751	AAG	2	6	6781	6786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339031
113	NC_016751	GAA	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339031
114	NC_016751	TGA	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339031
115	NC_016751	TAT	2	6	6873	6878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339031
116	NC_016751	AAT	2	6	6925	6930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339031
117	NC_016751	AGA	2	6	7028	7033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374339032
118	NC_016751	ATT	2	6	7051	7056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339032
119	NC_016751	TAT	2	6	7057	7062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339032
120	NC_016751	ATT	2	6	7163	7168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339032
121	NC_016751	TAA	2	6	7344	7349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339032
122	NC_016751	GTT	2	6	7403	7408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374339032
123	NC_016751	ATT	2	6	7439	7444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339032
124	NC_016751	AAT	2	6	7619	7624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339033
125	NC_016751	AAT	2	6	7673	7678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339033
126	NC_016751	ATT	2	6	7737	7742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339033
127	NC_016751	CTT	2	6	7806	7811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374339033
128	NC_016751	TAT	2	6	8043	8048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374339033
129	NC_016751	TGA	2	6	8054	8059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339033
130	NC_016751	AAT	2	6	8060	8065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374339033
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132	NC_016751	TGA	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374339033
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