MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus macedonicus ACA-DC 198

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016749	CTTTT	2	10	2704	2713	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016749	GGAAA	2	10	4957	4966	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016749	TAGAG	2	10	9334	9343	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016749	CGTTT	2	10	17151	17160	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016749	TCGTG	2	10	19948	19957	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016749	GTTAA	2	10	20696	20705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016749	GGGAG	2	10	21215	21224	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016749	AGGGA	2	10	23423	23432	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016749	ATGGA	2	10	25217	25226	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016749	ATGAC	2	10	37594	37603	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016749	TTAAT	2	10	43525	43534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016749	ATTTT	2	10	44059	44068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016749	AAAAG	2	10	44303	44312	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016749	AAATA	2	10	53155	53164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016749	TGATT	2	10	55375	55384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016749	ATTTT	2	10	55928	55937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016749	TCTTT	2	10	55996	56005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016749	TATTT	2	10	56281	56290	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016749	TTCAA	2	10	56359	56368	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016749	AAGGA	2	10	62668	62677	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016749	CGTTT	2	10	71599	71608	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016749	TAAAA	2	10	72764	72773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016749	TCGTG	2	10	75428	75437	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016749	GTTAA	2	10	76176	76185	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016749	GGGAG	2	10	76695	76704	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016749	AGGGA	2	10	78903	78912	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016749	TCGTG	2	10	81238	81247	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016749	GTTAA	2	10	81986	81995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016749	GGGAG	2	10	82505	82514	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016749	AGGGA	2	10	84713	84722	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016749	AGTCA	2	10	87485	87494	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016749	AATGA	2	10	87533	87542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016749	AGCTA	2	10	90889	90898	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016749	GTAAA	2	10	107617	107626	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016749	TAGAT	2	10	110538	110547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016749	ATGTA	2	10	119193	119202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016749	ATTTT	2	10	119368	119377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016749	TAATC	2	10	119966	119975	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016749	TTATA	2	10	136809	136818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016749	TGAAG	2	10	138886	138895	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016749	TTTTA	2	10	142021	142030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016749	ATGAA	2	10	142047	142056	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016749	TAGTG	2	10	143646	143655	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016749	ATTTG	2	10	151221	151230	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016749	TATAT	2	10	165665	165674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016749	TAGAT	2	10	169925	169934	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016749	GGAAA	2	10	169935	169944	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016749	GGAAA	2	10	170053	170062	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016749	CAATA	2	10	172230	172239	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016749	AAGAA	2	10	172481	172490	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016749	TATTC	2	10	178569	178578	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016749	AGTAG	2	10	180249	180258	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016749	AAGGA	2	10	181051	181060	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016749	CCTAA	2	10	182306	182315	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016749	TTTAG	2	10	184055	184064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016749	GATTT	2	10	186779	186788	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016749	AGGTA	2	10	188421	188430	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016749	GAAAA	2	10	189455	189464	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016749	ATGAA	2	10	189492	189501	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016749	CTTTA	2	10	189755	189764	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016749	TATCA	2	10	197969	197978	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016749	ATCTA	2	10	203361	203370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016749	TTATA	2	10	204430	204439	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016749	AATTT	2	10	207471	207480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016749	AAAAG	2	10	220357	220366	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016749	GTTCT	2	10	226921	226930	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016749	AATGC	2	10	228325	228334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016749	TTGAT	2	10	240616	240625	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016749	ACAGA	2	10	241868	241877	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016749	AATTA	2	10	241971	241980	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016749	AAAAT	2	10	248008	248017	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016749	AAAGT	2	10	263987	263996	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016749	TAATA	2	10	273695	273704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016749	ATTAT	2	10	276108	276117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016749	TCGTG	2	10	279832	279841	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016749	GTTAA	2	10	280580	280589	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016749	GGGAG	2	10	281099	281108	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016749	AGGGA	2	10	283307	283316	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016749	TAAAC	2	10	297297	297306	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016749	GCAGA	2	10	302451	302460	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016749	GTATT	2	10	313595	313604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016749	AAATT	2	10	316819	316828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016749	ATACA	2	10	318381	318390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016749	AAATA	2	10	321085	321094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016749	TTTTC	2	10	332689	332698	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016749	CTTTT	2	10	335356	335365	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016749	GCTAT	2	10	336492	336501	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016749	CTGCC	2	10	341071	341080	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_016749	TTTAT	2	10	341243	341252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016749	TAAAA	2	10	345371	345380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016749	GAAAT	2	10	347877	347886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016749	TCGTG	2	10	371283	371292	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016749	GTTAA	2	10	372031	372040	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016749	GGGAG	2	10	372550	372559	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016749	AGGGA	2	10	374758	374767	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016749	ATAAA	2	10	382105	382114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016749	ATTAA	2	10	395273	395282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016749	TTTAT	2	10	404754	404763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016749	CAGAG	2	10	405477	405486	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016749	AAAGG	2	10	406167	406176	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016749	GGCGT	2	10	407963	407972	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016749	AAGCG	2	10	414098	414107	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016749	GGGAT	2	10	415340	415349	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016749	GGAAA	2	10	416483	416492	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016749	CTAGT	2	10	419035	419044	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016749	AATGG	2	10	424382	424391	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016749	ACTAA	2	10	424525	424534	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016749	ATATA	2	10	425332	425341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016749	GCCTA	2	10	427044	427053	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016749	TTTTA	2	10	446680	446689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016749	GAAAA	2	10	447672	447681	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016749	TTAGT	2	10	453279	453288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016749	GCTTC	2	10	469958	469967	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016749	ATATA	2	10	477031	477040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016749	TTTCC	2	10	477125	477134	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016749	TCGTG	2	10	484898	484907	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_016749	GTTAA	2	10	485646	485655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016749	GGGAG	2	10	486165	486174	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016749	AGGGA	2	10	488373	488382	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016749	TATTT	2	10	489343	489352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016749	GTTTT	2	10	489397	489406	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016749	GCTGT	2	10	489460	489469	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016749	TAGTA	2	10	489605	489614	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016749	TACTA	2	10	497802	497811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016749	AGGAA	2	10	497823	497832	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016749	TCATA	2	10	508510	508519	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016749	TTTGA	2	10	510625	510634	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016749	ATTGA	2	10	510642	510651	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016749	TAAAA	2	10	512602	512611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016749	TTTTA	2	10	520227	520236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016749	CAGAA	2	10	520321	520330	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016749	TAAAT	2	10	523011	523020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016749	TATTT	2	10	523883	523892	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016749	ATAAA	2	10	536041	536050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016749	AATGG	2	10	540029	540038	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016749	CTTTT	2	10	556399	556408	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016749	TAAAA	2	10	558487	558496	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016749	CATTA	2	10	558729	558738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016749	AATTG	2	10	561528	561537	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016749	TCGCT	2	10	579250	579259	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_016749	GAAAT	2	10	589548	589557	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016749	GATAG	2	10	595499	595508	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016749	TTATG	2	10	598187	598196	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016749	TATTT	2	10	602869	602878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016749	GTTTG	2	10	615425	615434	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016749	AAAAG	2	10	617698	617707	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016749	TTGGT	2	10	628692	628701	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016749	CTCAA	2	10	640235	640244	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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431	NC_016749	TAAAA	2	10	2087904	2087913	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_016749	TAATT	2	10	2098980	2098989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_016749	CTTTA	2	10	2106678	2106687	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
434	NC_016749	TTATA	2	10	2109378	2109387	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_016749	ACACT	2	10	2109680	2109689	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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437	NC_016749	AATAA	2	10	2118180	2118189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_016749	ACTTG	2	10	2126608	2126617	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.