MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Marinitoga piezophila KA3 plasmid pMARPI01

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016748	TCTT	2	8	122	129	0 %	75 %	0 %	25 %	373231419
2	NC_016748	TGAT	2	8	247	254	25 %	50 %	25 %	0 %	373231419
3	NC_016748	ATTT	2	8	294	301	25 %	75 %	0 %	0 %	373231419
4	NC_016748	TTAA	2	8	349	356	50 %	50 %	0 %	0 %	373231419
5	NC_016748	TCAT	2	8	571	578	25 %	50 %	0 %	25 %	373231419
6	NC_016748	AAAG	2	8	1519	1526	75 %	0 %	25 %	0 %	373231421
7	NC_016748	ATGA	2	8	1687	1694	50 %	25 %	25 %	0 %	373231421
8	NC_016748	AGAA	2	8	1845	1852	75 %	0 %	25 %	0 %	373231421
9	NC_016748	AAAT	2	8	1869	1876	75 %	25 %	0 %	0 %	373231421
10	NC_016748	AGAA	2	8	2431	2438	75 %	0 %	25 %	0 %	373231422
11	NC_016748	TAAT	2	8	2488	2495	50 %	50 %	0 %	0 %	373231422
12	NC_016748	ACGA	2	8	2995	3002	50 %	0 %	25 %	25 %	373231423
13	NC_016748	ATTT	2	8	3391	3398	25 %	75 %	0 %	0 %	373231424
14	NC_016748	AAAT	2	8	3715	3722	75 %	25 %	0 %	0 %	373231425
15	NC_016748	AATG	2	8	4503	4510	50 %	25 %	25 %	0 %	373231425
16	NC_016748	AGAA	2	8	4574	4581	75 %	0 %	25 %	0 %	373231425
17	NC_016748	AAAT	2	8	4817	4824	75 %	25 %	0 %	0 %	373231425
18	NC_016748	AAAT	2	8	4939	4946	75 %	25 %	0 %	0 %	373231425
19	NC_016748	TGAT	2	8	5422	5429	25 %	50 %	25 %	0 %	373231425
20	NC_016748	GATA	2	8	5816	5823	50 %	25 %	25 %	0 %	373231425
21	NC_016748	TGAA	2	8	6727	6734	50 %	25 %	25 %	0 %	373231426
22	NC_016748	TAAA	2	8	6754	6761	75 %	25 %	0 %	0 %	373231426
23	NC_016748	AAAG	2	8	7233	7240	75 %	0 %	25 %	0 %	373231426
24	NC_016748	TAAA	2	8	7348	7355	75 %	25 %	0 %	0 %	373231426
25	NC_016748	CTTA	2	8	7871	7878	25 %	50 %	0 %	25 %	373231427
26	NC_016748	AAAT	2	8	7928	7935	75 %	25 %	0 %	0 %	373231427
27	NC_016748	CAAA	2	8	8651	8658	75 %	0 %	0 %	25 %	373231428
28	NC_016748	AAGA	2	8	12254	12261	75 %	0 %	25 %	0 %	373231430
29	NC_016748	ATTC	2	8	13065	13072	25 %	50 %	0 %	25 %	373231431
30	NC_016748	ATGG	2	8	13180	13187	25 %	25 %	50 %	0 %	373231431
31	NC_016748	ATAA	2	8	13200	13207	75 %	25 %	0 %	0 %	373231431
32	NC_016748	ATAA	2	8	13376	13383	75 %	25 %	0 %	0 %	373231431

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.