MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Marinitoga piezophila KA3 plasmid pMARPI01

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016748	TA	3	6	308	313	50 %	50 %	0 %	0 %	373231419
2	NC_016748	TC	3	6	753	758	0 %	50 %	0 %	50 %	373231420
3	NC_016748	TA	4	8	1045	1052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016748	TA	3	6	1082	1087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016748	TA	4	8	1091	1098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016748	AT	4	8	1136	1143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016748	AC	3	6	1174	1179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016748	AT	3	6	1587	1592	50 %	50 %	0 %	0 %	373231421
9	NC_016748	TA	3	6	2178	2183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016748	TA	3	6	2662	2667	50 %	50 %	0 %	0 %	373231422
11	NC_016748	TA	3	6	3517	3522	50 %	50 %	0 %	0 %	373231424
12	NC_016748	CA	3	6	3562	3567	50 %	0 %	0 %	50 %	373231424
13	NC_016748	AT	3	6	3829	3834	50 %	50 %	0 %	0 %	373231425
14	NC_016748	TA	3	6	3859	3864	50 %	50 %	0 %	0 %	373231425
15	NC_016748	CT	3	6	3890	3895	0 %	50 %	0 %	50 %	373231425
16	NC_016748	AT	3	6	4047	4052	50 %	50 %	0 %	0 %	373231425
17	NC_016748	AT	3	6	4464	4469	50 %	50 %	0 %	0 %	373231425
18	NC_016748	TA	3	6	5067	5072	50 %	50 %	0 %	0 %	373231425
19	NC_016748	AT	3	6	5919	5924	50 %	50 %	0 %	0 %	373231426
20	NC_016748	TA	3	6	6784	6789	50 %	50 %	0 %	0 %	373231426
21	NC_016748	AT	3	6	7226	7231	50 %	50 %	0 %	0 %	373231426
22	NC_016748	TC	3	6	7634	7639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016748	AG	3	6	7833	7838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016748	AT	3	6	8148	8153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016748	AT	3	6	8214	8219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016748	AT	3	6	8958	8963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016748	AG	4	8	8988	8995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016748	AT	3	6	9175	9180	50 %	50 %	0 %	0 %	373231429
29	NC_016748	GA	3	6	9546	9551	50 %	0 %	50 %	0 %	373231429
30	NC_016748	AT	3	6	10504	10509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016748	TA	5	10	10603	10612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016748	GA	3	6	11166	11171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016748	AT	3	6	11278	11283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016748	TG	3	6	11670	11675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016748	TA	3	6	11681	11686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016748	AT	4	8	11850	11857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016748	CT	3	6	11966	11971	0 %	50 %	0 %	50 %	373231430
38	NC_016748	TA	3	6	12315	12320	50 %	50 %	0 %	0 %	373231430
39	NC_016748	AT	3	6	13082	13087	50 %	50 %	0 %	0 %	373231431
40	NC_016748	AT	4	8	13165	13172	50 %	50 %	0 %	0 %	373231431

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.