MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016639	TTTTA	2	10	2538	2547	20 %	80 %	0 %	0 %	374318771
2	NC_016639	ATTTA	2	10	2891	2900	40 %	60 %	0 %	0 %	374318771
3	NC_016639	GGTCA	2	10	4138	4147	20 %	20 %	40 %	20 %	374318772
4	NC_016639	TAAAT	2	10	4847	4856	60 %	40 %	0 %	0 %	374318772
5	NC_016639	TCAAT	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	374318772
6	NC_016639	GTAGT	2	10	5173	5182	20 %	40 %	40 %	0 %	374318772
7	NC_016639	TAATA	2	10	6033	6042	60 %	40 %	0 %	0 %	374318772
8	NC_016639	ACTTT	2	10	6831	6840	20 %	60 %	0 %	20 %	374318774
9	NC_016639	AATAC	2	10	7372	7381	60 %	20 %	0 %	20 %	374318774
10	NC_016639	ATCCA	2	10	7869	7878	40 %	20 %	0 %	40 %	374318775
11	NC_016639	AGAAT	2	10	11208	11217	60 %	20 %	20 %	0 %	374318778
12	NC_016639	GGCTC	2	10	13524	13533	0 %	20 %	40 %	40 %	374318780
13	NC_016639	AGCAG	2	10	13949	13958	40 %	0 %	40 %	20 %	374318780
14	NC_016639	TTAAT	2	10	14092	14101	40 %	60 %	0 %	0 %	374318780
15	NC_016639	ATTTA	2	10	17032	17041	40 %	60 %	0 %	0 %	374318785
16	NC_016639	TTTTA	2	10	17800	17809	20 %	80 %	0 %	0 %	374318785
17	NC_016639	TCAAG	2	10	21525	21534	40 %	20 %	20 %	20 %	374318786
18	NC_016639	ATAAA	2	10	21579	21588	80 %	20 %	0 %	0 %	374318786
19	NC_016639	AGAAA	2	10	21841	21850	80 %	0 %	20 %	0 %	374318786
20	NC_016639	AAAGC	2	10	22097	22106	60 %	0 %	20 %	20 %	374318786
21	NC_016639	TAATA	2	10	23044	23053	60 %	40 %	0 %	0 %	374318786
22	NC_016639	CAAAG	2	10	23136	23145	60 %	0 %	20 %	20 %	374318786
23	NC_016639	AGCAG	2	10	23462	23471	40 %	0 %	40 %	20 %	374318786
24	NC_016639	TACCT	2	10	25051	25060	20 %	40 %	0 %	40 %	374318786
25	NC_016639	ATATT	2	10	28031	28040	40 %	60 %	0 %	0 %	374318787
26	NC_016639	ATATT	2	10	28069	28078	40 %	60 %	0 %	0 %	374318787
27	NC_016639	TTTGT	2	10	30183	30192	0 %	80 %	20 %	0 %	374318789
28	NC_016639	TCATT	2	10	31960	31969	20 %	60 %	0 %	20 %	374318794
29	NC_016639	AAATT	2	10	33070	33079	60 %	40 %	0 %	0 %	374318795
30	NC_016639	TTAAT	2	10	37141	37150	40 %	60 %	0 %	0 %	374318799
31	NC_016639	AGAAA	2	10	47075	47084	80 %	0 %	20 %	0 %	374318807
32	NC_016639	GTTTC	2	10	47515	47524	0 %	60 %	20 %	20 %	374318807
33	NC_016639	ATTTT	2	10	48064	48073	20 %	80 %	0 %	0 %	374318807
34	NC_016639	TCGGT	2	10	60775	60784	0 %	40 %	40 %	20 %	374318816
35	NC_016639	GCTTT	2	10	62363	62372	0 %	60 %	20 %	20 %	374318817
36	NC_016639	TAAAA	2	10	66589	66598	80 %	20 %	0 %	0 %	374318819
37	NC_016639	ACTTT	2	10	69640	69649	20 %	60 %	0 %	20 %	374318823
38	NC_016639	GCTTA	2	10	69829	69838	20 %	40 %	20 %	20 %	374318823
39	NC_016639	CATTT	2	10	70532	70541	20 %	60 %	0 %	20 %	374318823
40	NC_016639	TTAAA	2	10	70557	70566	60 %	40 %	0 %	0 %	374318823
41	NC_016639	ACATA	2	10	73363	73372	60 %	20 %	0 %	20 %	374318826
42	NC_016639	TTTCT	2	10	76640	76649	0 %	80 %	0 %	20 %	374318828
43	NC_016639	ATTTA	2	10	77054	77063	40 %	60 %	0 %	0 %	374318830
44	NC_016639	AAAAG	2	10	77830	77839	80 %	0 %	20 %	0 %	374318830
45	NC_016639	GGGTT	2	10	78040	78049	0 %	40 %	60 %	0 %	374318830
46	NC_016639	TTTAT	2	10	78416	78425	20 %	80 %	0 %	0 %	374318830
47	NC_016639	GCTTA	2	10	79726	79735	20 %	40 %	20 %	20 %	374318831
48	NC_016639	GTTAT	2	10	80715	80724	20 %	60 %	20 %	0 %	374318833
49	NC_016639	GTAGA	2	10	81021	81030	40 %	20 %	40 %	0 %	374318833
50	NC_016639	CAATG	2	10	83373	83382	40 %	20 %	20 %	20 %	374318835
51	NC_016639	ATAAA	2	10	83836	83845	80 %	20 %	0 %	0 %	374318836
52	NC_016639	ATTAT	2	10	84271	84280	40 %	60 %	0 %	0 %	374318836
53	NC_016639	TAAAT	2	10	84539	84548	60 %	40 %	0 %	0 %	374318836
54	NC_016639	GAAAA	2	10	85094	85103	80 %	0 %	20 %	0 %	374318837
55	NC_016639	CGCAT	3	15	92898	92912	20 %	20 %	20 %	40 %	374318843
56	NC_016639	TGAAA	2	10	96128	96137	60 %	20 %	20 %	0 %	374318845
57	NC_016639	TTGAT	2	10	97789	97798	20 %	60 %	20 %	0 %	374318846
58	NC_016639	ATTTA	2	10	99501	99510	40 %	60 %	0 %	0 %	374318848
59	NC_016639	TCAAA	2	10	101018	101027	60 %	20 %	0 %	20 %	374318850
60	NC_016639	TTAAT	2	10	101801	101810	40 %	60 %	0 %	0 %	374318851
61	NC_016639	AAACT	2	10	104374	104383	60 %	20 %	0 %	20 %	374318853
62	NC_016639	TTAGT	2	10	104725	104734	20 %	60 %	20 %	0 %	374318854
63	NC_016639	TACTA	2	10	105841	105850	40 %	40 %	0 %	20 %	374318855
64	NC_016639	CCAAA	2	10	107164	107173	60 %	0 %	0 %	40 %	374318856
65	NC_016639	CGGAT	2	10	107711	107720	20 %	20 %	40 %	20 %	374318857
66	NC_016639	TAATA	2	10	108470	108479	60 %	40 %	0 %	0 %	374318859
67	NC_016639	TTGAT	2	10	109101	109110	20 %	60 %	20 %	0 %	374318860
68	NC_016639	ATTAT	2	10	109282	109291	40 %	60 %	0 %	0 %	374318860
69	NC_016639	AGTTC	2	10	110416	110425	20 %	40 %	20 %	20 %	374318860
70	NC_016639	TTTGA	2	10	112988	112997	20 %	60 %	20 %	0 %	374318860
71	NC_016639	GCAAA	2	10	114833	114842	60 %	0 %	20 %	20 %	374318861
72	NC_016639	TTAGT	2	10	119543	119552	20 %	60 %	20 %	0 %	374318864
73	NC_016639	TTGTC	2	10	120673	120682	0 %	60 %	20 %	20 %	374318864
74	NC_016639	ATAAA	2	10	120760	120769	80 %	20 %	0 %	0 %	374318864
75	NC_016639	AAGTA	2	10	121366	121375	60 %	20 %	20 %	0 %	374318865
76	NC_016639	TAAAA	2	10	123248	123257	80 %	20 %	0 %	0 %	374318868
77	NC_016639	AAAAC	2	10	123944	123953	80 %	0 %	0 %	20 %	374318868
78	NC_016639	TTTAA	2	10	124020	124029	40 %	60 %	0 %	0 %	374318868
79	NC_016639	GTTAC	2	10	125109	125118	20 %	40 %	20 %	20 %	374318870
80	NC_016639	TGAAA	2	10	125470	125479	60 %	20 %	20 %	0 %	374318870
81	NC_016639	CTTGT	2	10	128557	128566	0 %	60 %	20 %	20 %	374318872
82	NC_016639	ATGAT	2	10	129621	129630	40 %	40 %	20 %	0 %	374318873
83	NC_016639	CTTGT	2	10	129959	129968	0 %	60 %	20 %	20 %	374318874
84	NC_016639	TATTT	2	10	130385	130394	20 %	80 %	0 %	0 %	374318876
85	NC_016639	TCTTT	2	10	131457	131466	0 %	80 %	0 %	20 %	374318878
86	NC_016639	AACCT	2	10	132479	132488	40 %	20 %	0 %	40 %	374318879
87	NC_016639	AAATC	2	10	133411	133420	60 %	20 %	0 %	20 %	374318881
88	NC_016639	TTAAC	2	10	134548	134557	40 %	40 %	0 %	20 %	374318882
89	NC_016639	TATAA	2	10	134640	134649	60 %	40 %	0 %	0 %	374318882
90	NC_016639	TTATA	2	10	135014	135023	40 %	60 %	0 %	0 %	374318883
91	NC_016639	TTTTA	2	10	136667	136676	20 %	80 %	0 %	0 %	374318884
92	NC_016639	GCTTT	2	10	138243	138252	0 %	60 %	20 %	20 %	374318885
93	NC_016639	TATGT	2	10	138893	138902	20 %	60 %	20 %	0 %	374318885
94	NC_016639	GTTTT	2	10	141425	141434	0 %	80 %	20 %	0 %	374318886
95	NC_016639	CTTGG	2	10	142242	142251	0 %	40 %	40 %	20 %	374318886
96	NC_016639	ACAAG	2	10	145956	145965	60 %	0 %	20 %	20 %	374318887
97	NC_016639	AGTTT	2	10	146294	146303	20 %	60 %	20 %	0 %	374318888
98	NC_016639	TTAGT	2	10	146817	146826	20 %	60 %	20 %	0 %	374318888
99	NC_016639	ATATA	2	10	147723	147732	60 %	40 %	0 %	0 %	374318888
100	NC_016639	TGCAG	2	10	147811	147820	20 %	20 %	40 %	20 %	374318888
101	NC_016639	GTTAT	2	10	148227	148236	20 %	60 %	20 %	0 %	374318888
102	NC_016639	ATGGT	2	10	149427	149436	20 %	40 %	40 %	0 %	374318889
103	NC_016639	AGGAG	2	10	149682	149691	40 %	0 %	60 %	0 %	374318889
104	NC_016639	TATTT	2	10	150358	150367	20 %	80 %	0 %	0 %	374318889
105	NC_016639	AATTT	2	10	157701	157710	40 %	60 %	0 %	0 %	374318894
106	NC_016639	AGGTG	2	10	157807	157816	20 %	20 %	60 %	0 %	374318894
107	NC_016639	GAAGT	2	10	161701	161710	40 %	20 %	40 %	0 %	374318898
108	NC_016639	AAATT	2	10	165006	165015	60 %	40 %	0 %	0 %	374318901
109	NC_016639	TATCA	2	10	165383	165392	40 %	40 %	0 %	20 %	374318901
110	NC_016639	TAGCT	2	10	165470	165479	20 %	40 %	20 %	20 %	374318901
111	NC_016639	TATAT	2	10	165697	165706	40 %	60 %	0 %	0 %	374318902
112	NC_016639	TTATT	2	10	166332	166341	20 %	80 %	0 %	0 %	374318902
113	NC_016639	AATTT	2	10	166754	166763	40 %	60 %	0 %	0 %	374318903
114	NC_016639	ATTTT	2	10	167141	167150	20 %	80 %	0 %	0 %	374318903
115	NC_016639	AGCCG	2	10	167346	167355	20 %	0 %	40 %	40 %	374318903
116	NC_016639	TGGTG	2	10	171289	171298	0 %	40 %	60 %	0 %	374318907
117	NC_016639	TTAAT	2	10	172175	172184	40 %	60 %	0 %	0 %	374318909
118	NC_016639	AAGAA	2	10	173787	173796	80 %	0 %	20 %	0 %	374318909
119	NC_016639	CAGGG	2	10	174443	174452	20 %	0 %	60 %	20 %	374318910
120	NC_016639	ATATC	2	10	175217	175226	40 %	40 %	0 %	20 %	374318911
121	NC_016639	TGGAT	2	10	175994	176003	20 %	40 %	40 %	0 %	374318913
122	NC_016639	GTGCC	2	10	177464	177473	0 %	20 %	40 %	40 %	374318913
123	NC_016639	ACATA	2	10	178528	178537	60 %	20 %	0 %	20 %	374318914
124	NC_016639	TAAAA	2	10	179641	179650	80 %	20 %	0 %	0 %	374318916
125	NC_016639	TATAC	2	10	190160	190169	40 %	40 %	0 %	20 %	374318921
126	NC_016639	GTAGA	2	10	190569	190578	40 %	20 %	40 %	0 %	374318921
127	NC_016639	ACTTC	2	10	191958	191967	20 %	40 %	0 %	40 %	374318922
128	NC_016639	CGATA	2	10	193811	193820	40 %	20 %	20 %	20 %	374318923
129	NC_016639	TAAAA	2	10	199746	199755	80 %	20 %	0 %	0 %	374318927
130	NC_016639	TAGCA	2	10	199857	199866	40 %	20 %	20 %	20 %	374318927
131	NC_016639	TAAAG	2	10	200731	200740	60 %	20 %	20 %	0 %	374318928
132	NC_016639	GAATT	2	10	204672	204681	40 %	40 %	20 %	0 %	374318932
133	NC_016639	ATTTT	2	10	207618	207627	20 %	80 %	0 %	0 %	374318935
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135	NC_016639	AATTT	2	10	209822	209831	40 %	60 %	0 %	0 %	374318938
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