MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 1133

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016639	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016639	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016639	TAAA	2	8	6655	6662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016639	CCTC	2	8	10215	10222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_016639	CAAT	2	8	10262	10269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016639	ATTA	2	8	11261	11268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016639	ATTA	2	8	11475	11482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016639	TTTA	2	8	12094	12101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016639	GATT	2	8	12536	12543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016639	AAAT	2	8	12544	12551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016639	AATT	2	8	12571	12578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016639	TTAA	2	8	12752	12759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016639	TTAG	2	8	15125	15132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016639	AGTA	2	8	19062	19069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016639	ATTA	2	8	19087	19094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016639	AATA	2	8	19131	19138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016639	CTTT	2	8	19176	19183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016639	TGAA	2	8	19324	19331	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016639	TAAA	2	8	19367	19374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016639	AGAT	2	8	19555	19562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016639	TAAA	2	8	19720	19727	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016639	GATA	2	8	19800	19807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016639	AGCA	2	8	19868	19875	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016639	AGTA	2	8	20133	20140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016639	AAAC	2	8	20183	20190	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016639	TAAA	2	8	20259	20266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016639	TTAT	2	8	20454	20461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016639	TTAT	2	8	27052	27059	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016639	AGCA	2	8	27126	27133	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016639	AAGT	2	8	27578	27585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016639	TAAA	2	8	29077	29084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016639	GATA	2	8	29165	29172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016639	TAAA	2	8	29408	29415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016639	GCTA	2	8	29418	29425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016639	TAAT	2	8	30665	30672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016639	TTGT	2	8	37537	37544	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016639	TATT	2	8	37567	37574	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016639	GTAA	2	8	37578	37585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016639	AATG	2	8	38352	38359	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016639	GCTT	2	8	39142	39149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016639	ATAA	2	8	39368	39375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016639	AACA	2	8	39465	39472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016639	CTGA	2	8	41427	41434	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016639	ATTG	2	8	41597	41604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016639	TAAA	2	8	41754	41761	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016639	ATTT	2	8	41859	41866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016639	ATTA	2	8	42076	42083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016639	TGCT	2	8	42199	42206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016639	ATTA	2	8	42806	42813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016639	ATTA	2	8	43171	43178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016639	TAAA	2	8	43273	43280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016639	TACC	2	8	45354	45361	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016639	AAAC	2	8	45362	45369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016639	TAAT	2	8	45438	45445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016639	ATTA	2	8	45473	45480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016639	TAAA	2	8	45491	45498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016639	ATGA	2	8	45695	45702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016639	TAAC	2	8	45885	45892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016639	ATTC	2	8	46313	46320	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016639	TTAC	2	8	46677	46684	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016639	AGTA	2	8	49369	49376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016639	ATAC	2	8	49587	49594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016639	TTGC	2	8	49693	49700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016639	TGTT	2	8	50062	50069	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016639	AAGT	2	8	50099	50106	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016639	CTTG	2	8	50569	50576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016639	ATCT	2	8	51145	51152	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016639	TGCT	2	8	51309	51316	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016639	TTTA	2	8	51730	51737	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016639	TCAC	2	8	51839	51846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016639	TAAA	2	8	51879	51886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016639	TTTA	2	8	52611	52618	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016639	ATTA	2	8	52994	53001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016639	TAAA	2	8	53219	53226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016639	GAGG	2	8	53245	53252	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016639	ATTG	2	8	53628	53635	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016639	TTAT	2	8	53842	53849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016639	TGCT	2	8	53924	53931	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016639	GTGA	2	8	54031	54038	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016639	GTTC	2	8	54809	54816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016639	GACC	2	8	54827	54834	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016639	AAAT	2	8	55549	55556	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016639	TGAT	2	8	55659	55666	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016639	TAAA	2	8	56441	56448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016639	ATCT	2	8	57646	57653	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016639	GTTT	2	8	59790	59797	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016639	TAAA	2	8	62947	62954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016639	ATTT	2	8	62968	62975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016639	ATTT	2	8	64970	64977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016639	TTAA	2	8	66632	66639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016639	TAGT	2	8	67123	67130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016639	ATAA	2	8	69192	69199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016639	GTAA	2	8	69240	69247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016639	CAAT	2	8	74470	74477	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016639	CAAT	2	8	74755	74762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016639	TAAG	2	8	75482	75489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016639	AGAA	2	8	75842	75849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016639	CAAT	2	8	75978	75985	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016639	TAAA	2	8	78616	78623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016639	ATTT	2	8	78706	78713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016639	AAAT	2	8	84664	84671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016639	TATC	2	8	88504	88511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016639	TAGC	2	8	88608	88615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016639	AGGT	2	8	89377	89384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016639	TAAA	2	8	94107	94114	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016639	TTTA	2	8	96755	96762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016639	AATT	2	8	97006	97013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016639	TAAA	2	8	98362	98369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016639	ATTA	2	8	98600	98607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016639	TCCA	2	8	101503	101510	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016639	AAGC	2	8	101598	101605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016639	ATGT	2	8	103653	103660	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016639	ATCA	2	8	106946	106953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016639	TTTA	2	8	108621	108628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016639	ATTC	2	8	114024	114031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016639	ATTA	2	8	114105	114112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016639	GAAA	2	8	114226	114233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016639	ACTC	2	8	118165	118172	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016639	CAAA	2	8	118187	118194	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016639	AAGT	2	8	121524	121531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016639	AAAT	2	8	122872	122879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016639	CTAC	2	8	123101	123108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016639	AGTA	2	8	123210	123217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016639	CGCT	2	8	125811	125818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016639	TCAC	2	8	125840	125847	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016639	AAAG	2	8	126406	126413	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016639	ATAA	2	8	126418	126425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016639	ATCA	2	8	126442	126449	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016639	GCCG	2	8	126590	126597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016639	ACGT	2	8	128926	128933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016639	TAAT	2	8	130339	130346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016639	TTTA	2	8	130513	130520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016639	GAAA	2	8	131811	131818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016639	TAAT	2	8	132086	132093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016639	TTTG	2	8	132920	132927	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016639	AAAT	2	8	135311	135318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016639	CTGT	2	8	137766	137773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016639	AAAC	2	8	152655	152662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016639	GAAG	2	8	152799	152806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016639	TGAT	2	8	152850	152857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016639	ATTA	2	8	153120	153127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016639	CGAT	2	8	153360	153367	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016639	TAAT	2	8	153491	153498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016639	TAGA	2	8	153890	153897	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016639	ATTT	2	8	154176	154183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016639	ATAA	2	8	154364	154371	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016639	TACC	2	8	154806	154813	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016639	TTGC	2	8	155066	155073	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016639	AAAG	2	8	155514	155521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016639	GGTG	2	8	155888	155895	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016639	ATAA	2	8	155898	155905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016639	GCGA	2	8	159976	159983	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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154	NC_016639	TCTA	2	8	168658	168665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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