MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 2640

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016639	TTAT	2	8	2699	2706	25 %	75 %	0 %	0 %	374318771
2	NC_016639	TTAT	2	8	2921	2928	25 %	75 %	0 %	0 %	374318771
3	NC_016639	AACT	2	8	3304	3311	50 %	25 %	0 %	25 %	374318772
4	NC_016639	CAAA	2	8	3350	3357	75 %	0 %	0 %	25 %	374318772
5	NC_016639	TATT	2	8	3617	3624	25 %	75 %	0 %	0 %	374318772
6	NC_016639	TCGC	2	8	3747	3754	0 %	25 %	25 %	50 %	374318772
7	NC_016639	AATA	2	8	5318	5325	75 %	25 %	0 %	0 %	374318772
8	NC_016639	ATTC	2	8	5355	5362	25 %	50 %	0 %	25 %	374318772
9	NC_016639	ATTT	2	8	6559	6566	25 %	75 %	0 %	0 %	374318773
10	NC_016639	ATAA	2	8	7112	7119	75 %	25 %	0 %	0 %	374318774
11	NC_016639	ACTT	2	8	7495	7502	25 %	50 %	0 %	25 %	374318775
12	NC_016639	ATTT	2	8	7902	7909	25 %	75 %	0 %	0 %	374318775
13	NC_016639	ATGA	2	8	13446	13453	50 %	25 %	25 %	0 %	374318780
14	NC_016639	TAAA	2	8	14469	14476	75 %	25 %	0 %	0 %	374318781
15	NC_016639	TAAA	2	8	14628	14635	75 %	25 %	0 %	0 %	374318781
16	NC_016639	TCAT	2	8	14749	14756	25 %	50 %	0 %	25 %	374318781
17	NC_016639	CTTT	2	8	14883	14890	0 %	75 %	0 %	25 %	374318781
18	NC_016639	GCAA	2	8	15223	15230	50 %	0 %	25 %	25 %	374318782
19	NC_016639	TCTT	2	8	15300	15307	0 %	75 %	0 %	25 %	374318782
20	NC_016639	AGTA	2	8	15561	15568	50 %	25 %	25 %	0 %	374318783
21	NC_016639	GCTT	2	8	16087	16094	0 %	50 %	25 %	25 %	374318784
22	NC_016639	AATT	2	8	16436	16443	50 %	50 %	0 %	0 %	374318784
23	NC_016639	GCTT	2	8	16707	16714	0 %	50 %	25 %	25 %	374318784
24	NC_016639	AATA	2	8	17060	17067	75 %	25 %	0 %	0 %	374318785
25	NC_016639	TCTA	2	8	17527	17534	25 %	50 %	0 %	25 %	374318785
26	NC_016639	ACGT	2	8	17950	17957	25 %	25 %	25 %	25 %	374318785
27	NC_016639	CTTG	2	8	18065	18072	0 %	50 %	25 %	25 %	374318785
28	NC_016639	GTAA	2	8	21374	21381	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
29	NC_016639	AGAT	2	8	21628	21635	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
30	NC_016639	AGCA	2	8	21747	21754	50 %	0 %	25 %	25 %	374318786
31	NC_016639	AAAT	2	8	21790	21797	75 %	25 %	0 %	0 %	374318786
32	NC_016639	AATG	2	8	21991	21998	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
33	NC_016639	ATTA	2	8	22292	22299	50 %	50 %	0 %	0 %	374318786
34	NC_016639	ATAG	2	8	22340	22347	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
35	NC_016639	ATAG	2	8	22352	22359	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
36	NC_016639	CGTT	2	8	22770	22777	0 %	50 %	25 %	25 %	374318786
37	NC_016639	CAAA	2	8	23087	23094	75 %	0 %	0 %	25 %	374318786
38	NC_016639	TAGT	2	8	23217	23224	25 %	50 %	25 %	0 %	374318786
39	NC_016639	AGTT	2	8	23317	23324	25 %	50 %	25 %	0 %	374318786
40	NC_016639	GTTA	2	8	24008	24015	25 %	50 %	25 %	0 %	374318786
41	NC_016639	TAAA	2	8	24564	24571	75 %	25 %	0 %	0 %	374318786
42	NC_016639	AAGT	2	8	25089	25096	50 %	25 %	25 %	0 %	374318786
43	NC_016639	TTCA	2	8	25647	25654	25 %	50 %	0 %	25 %	374318786
44	NC_016639	AATA	2	8	26140	26147	75 %	25 %	0 %	0 %	374318786
45	NC_016639	TAAA	2	8	26286	26293	75 %	25 %	0 %	0 %	374318786
46	NC_016639	TAAT	2	8	27956	27963	50 %	50 %	0 %	0 %	374318787
47	NC_016639	AAGA	2	8	28108	28115	75 %	0 %	25 %	0 %	374318787
48	NC_016639	AAAT	2	8	28200	28207	75 %	25 %	0 %	0 %	374318787
49	NC_016639	ATTA	2	8	28228	28235	50 %	50 %	0 %	0 %	374318787
50	NC_016639	TCTA	2	8	30167	30174	25 %	50 %	0 %	25 %	374318789
51	NC_016639	ATTT	2	8	30211	30218	25 %	75 %	0 %	0 %	374318789
52	NC_016639	TGTC	2	8	30275	30282	0 %	50 %	25 %	25 %	374318789
53	NC_016639	ATAC	2	8	30872	30879	50 %	25 %	0 %	25 %	374318792
54	NC_016639	ATAA	2	8	31296	31303	75 %	25 %	0 %	0 %	374318792
55	NC_016639	CACT	2	8	31390	31397	25 %	25 %	0 %	50 %	374318792
56	NC_016639	TATT	2	8	32214	32221	25 %	75 %	0 %	0 %	374318794
57	NC_016639	AATT	2	8	33848	33855	50 %	50 %	0 %	0 %	374318797
58	NC_016639	TACC	2	8	33938	33945	25 %	25 %	0 %	50 %	374318797
59	NC_016639	GTTA	2	8	34320	34327	25 %	50 %	25 %	0 %	374318797
60	NC_016639	AAAC	2	8	35747	35754	75 %	0 %	0 %	25 %	374318798
61	NC_016639	TTAG	2	8	35923	35930	25 %	50 %	25 %	0 %	374318798
62	NC_016639	TTGC	2	8	36218	36225	0 %	50 %	25 %	25 %	374318798
63	NC_016639	ACTA	2	8	36372	36379	50 %	25 %	0 %	25 %	374318798
64	NC_016639	TTCC	2	8	36458	36465	0 %	50 %	0 %	50 %	374318798
65	NC_016639	TGTT	2	8	36926	36933	0 %	75 %	25 %	0 %	374318799
66	NC_016639	TAAT	2	8	43101	43108	50 %	50 %	0 %	0 %	374318802
67	NC_016639	GAAA	2	8	43485	43492	75 %	0 %	25 %	0 %	374318803
68	NC_016639	ATTT	2	8	43529	43536	25 %	75 %	0 %	0 %	374318803
69	NC_016639	ACAA	2	8	43796	43803	75 %	0 %	0 %	25 %	374318803
70	NC_016639	AAAT	2	8	44000	44007	75 %	25 %	0 %	0 %	374318804
71	NC_016639	ATCA	2	8	47354	47361	50 %	25 %	0 %	25 %	374318807
72	NC_016639	TGCC	2	8	47664	47671	0 %	25 %	25 %	50 %	374318807
73	NC_016639	TATC	2	8	48223	48230	25 %	50 %	0 %	25 %	374318807
74	NC_016639	TTAA	2	8	48246	48253	50 %	50 %	0 %	0 %	374318807
75	NC_016639	TAAG	2	8	55959	55966	50 %	25 %	25 %	0 %	374318809
76	NC_016639	ATAA	2	8	56586	56593	75 %	25 %	0 %	0 %	374318810
77	NC_016639	CTTT	2	8	57286	57293	0 %	75 %	0 %	25 %	374318810
78	NC_016639	TTGC	2	8	58255	58262	0 %	50 %	25 %	25 %	374318811
79	NC_016639	ATAA	2	8	58287	58294	75 %	25 %	0 %	0 %	374318811
80	NC_016639	ATAA	2	8	58341	58348	75 %	25 %	0 %	0 %	374318811
81	NC_016639	CATC	2	8	58478	58485	25 %	25 %	0 %	50 %	374318811
82	NC_016639	ATTT	3	12	58654	58665	25 %	75 %	0 %	0 %	374318811
83	NC_016639	TTTA	2	8	59004	59011	25 %	75 %	0 %	0 %	374318812
84	NC_016639	AACG	2	8	59026	59033	50 %	0 %	25 %	25 %	374318812
85	NC_016639	GTTA	2	8	59397	59404	25 %	50 %	25 %	0 %	374318813
86	NC_016639	AGAA	2	8	60042	60049	75 %	0 %	25 %	0 %	374318814
87	NC_016639	AAAG	2	8	60422	60429	75 %	0 %	25 %	0 %	374318815
88	NC_016639	TAAA	2	8	60489	60496	75 %	25 %	0 %	0 %	374318815
89	NC_016639	AAGA	2	8	61607	61614	75 %	0 %	25 %	0 %	374318817
90	NC_016639	TAAT	2	8	62423	62430	50 %	50 %	0 %	0 %	374318817
91	NC_016639	ATTA	2	8	62499	62506	50 %	50 %	0 %	0 %	374318817
92	NC_016639	GAAT	2	8	63321	63328	50 %	25 %	25 %	0 %	374318818
93	NC_016639	CAAG	2	8	63552	63559	50 %	0 %	25 %	25 %	374318818
94	NC_016639	ATGG	2	8	63875	63882	25 %	25 %	50 %	0 %	374318818
95	NC_016639	AAGA	2	8	64160	64167	75 %	0 %	25 %	0 %	374318818
96	NC_016639	GAAA	2	8	64246	64253	75 %	0 %	25 %	0 %	374318818
97	NC_016639	TTAA	2	8	66029	66036	50 %	50 %	0 %	0 %	374318819
98	NC_016639	GGAA	2	8	66085	66092	50 %	0 %	50 %	0 %	374318819
99	NC_016639	GCAT	2	8	66137	66144	25 %	25 %	25 %	25 %	374318819
100	NC_016639	TGCT	2	8	66364	66371	0 %	50 %	25 %	25 %	374318819
101	NC_016639	AATT	2	8	67209	67216	50 %	50 %	0 %	0 %	374318820
102	NC_016639	TGTT	2	8	67469	67476	0 %	75 %	25 %	0 %	374318820
103	NC_016639	TGAT	2	8	68018	68025	25 %	50 %	25 %	0 %	374318820
104	NC_016639	AATT	2	8	68399	68406	50 %	50 %	0 %	0 %	374318820
105	NC_016639	AAAC	2	8	68973	68980	75 %	0 %	0 %	25 %	374318821
106	NC_016639	TGTT	2	8	69483	69490	0 %	75 %	25 %	0 %	374318823
107	NC_016639	TTAT	2	8	69616	69623	25 %	75 %	0 %	0 %	374318823
108	NC_016639	AACT	2	8	70005	70012	50 %	25 %	0 %	25 %	374318823
109	NC_016639	GAAT	2	8	70784	70791	50 %	25 %	25 %	0 %	374318824
110	NC_016639	TAAT	2	8	70799	70806	50 %	50 %	0 %	0 %	374318824
111	NC_016639	TAGT	2	8	71165	71172	25 %	50 %	25 %	0 %	374318824
112	NC_016639	ATTT	2	8	71255	71262	25 %	75 %	0 %	0 %	374318824
113	NC_016639	TATT	2	8	71317	71324	25 %	75 %	0 %	0 %	374318824
114	NC_016639	CTTG	2	8	71736	71743	0 %	50 %	25 %	25 %	374318824
115	NC_016639	TGTA	2	8	72125	72132	25 %	50 %	25 %	0 %	374318824
116	NC_016639	TAAT	3	12	72462	72473	50 %	50 %	0 %	0 %	374318824
117	NC_016639	TTAG	2	8	72781	72788	25 %	50 %	25 %	0 %	374318825
118	NC_016639	AAGT	2	8	73137	73144	50 %	25 %	25 %	0 %	374318826
119	NC_016639	ATTT	2	8	73759	73766	25 %	75 %	0 %	0 %	374318827
120	NC_016639	AGAT	2	8	73838	73845	50 %	25 %	25 %	0 %	374318827
121	NC_016639	TAGA	2	8	76900	76907	50 %	25 %	25 %	0 %	374318829
122	NC_016639	TAAA	2	8	76921	76928	75 %	25 %	0 %	0 %	374318829
123	NC_016639	TTTA	2	8	76966	76973	25 %	75 %	0 %	0 %	374318829
124	NC_016639	AAAT	2	8	77040	77047	75 %	25 %	0 %	0 %	374318829
125	NC_016639	TTGC	2	8	77674	77681	0 %	50 %	25 %	25 %	374318830
126	NC_016639	GATG	2	8	77775	77782	25 %	25 %	50 %	0 %	374318830
127	NC_016639	TAAA	2	8	78516	78523	75 %	25 %	0 %	0 %	374318830
128	NC_016639	TAAA	2	8	78540	78547	75 %	25 %	0 %	0 %	374318830
129	NC_016639	TGTT	2	8	79504	79511	0 %	75 %	25 %	0 %	374318831
130	NC_016639	TGTT	2	8	79521	79528	0 %	75 %	25 %	0 %	374318831
131	NC_016639	TTCT	2	8	79791	79798	0 %	75 %	0 %	25 %	374318831
132	NC_016639	GGAT	2	8	79943	79950	25 %	25 %	50 %	0 %	374318831
133	NC_016639	TACT	2	8	80158	80165	25 %	50 %	0 %	25 %	374318832
134	NC_016639	ATTT	2	8	82170	82177	25 %	75 %	0 %	0 %	374318833
135	NC_016639	ATTT	2	8	82340	82347	25 %	75 %	0 %	0 %	374318833
136	NC_016639	AGTT	2	8	82411	82418	25 %	50 %	25 %	0 %	374318834
137	NC_016639	ATCA	2	8	82433	82440	50 %	25 %	0 %	25 %	374318834
138	NC_016639	AAGT	2	8	82600	82607	50 %	25 %	25 %	0 %	374318834
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