MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 5465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016639	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016639	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016639	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016639	GTT	2	6	1018	1023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016639	GTT	2	6	6062	6067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016639	CTT	2	6	6104	6109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016639	TCA	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016639	ATA	2	6	6131	6136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016639	TAA	2	6	6175	6180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016639	GAT	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016639	AAC	3	9	6265	6273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016639	CAA	2	6	6316	6321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016639	TCC	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016639	TCT	2	6	7915	7920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016639	AAT	2	6	7948	7953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016639	GCT	2	6	8030	8035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016639	GAC	2	6	8042	8047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016639	CAA	3	9	8061	8069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016639	TAT	2	6	9179	9184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016639	CAA	2	6	9186	9191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016639	ATG	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016639	AGC	2	6	9247	9252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016639	ATA	2	6	9279	9284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016639	CAA	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016639	AAG	2	6	9429	9434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016639	TAA	2	6	9541	9546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016639	TAA	2	6	9559	9564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016639	TAA	2	6	9807	9812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016639	AGA	2	6	9891	9896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016639	TGA	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016639	AGT	2	6	10136	10141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016639	TGG	2	6	10155	10160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016639	AAT	2	6	10168	10173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016639	TGA	2	6	10191	10196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016639	GCA	2	6	10204	10209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016639	ATA	2	6	10229	10234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016639	TAC	3	9	10323	10331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016639	TGT	2	6	10332	10337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016639	GTT	2	6	10388	10393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016639	TGA	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016639	ATA	2	6	10426	10431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016639	AAG	2	6	10468	10473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016639	TAA	2	6	10477	10482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016639	TAT	2	6	10578	10583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016639	AAC	2	6	10584	10589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016639	TTG	2	6	10692	10697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016639	AAT	2	6	10787	10792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016639	ATC	2	6	10823	10828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016639	GTT	2	6	10843	10848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016639	GTA	2	6	10930	10935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016639	ACT	2	6	10976	10981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016639	TTG	2	6	10991	10996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016639	CTT	2	6	11041	11046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016639	TAC	2	6	11253	11258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016639	AAC	2	6	11316	11321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016639	ATT	2	6	11354	11359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016639	TAT	2	6	11370	11375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016639	TGG	2	6	11531	11536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016639	TTA	2	6	11747	11752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016639	ATA	2	6	11823	11828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016639	AAT	2	6	11929	11934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016639	ATT	2	6	11943	11948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016639	TTA	2	6	11954	11959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016639	ATT	3	9	11973	11981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016639	AAT	2	6	12146	12151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016639	ATT	2	6	12208	12213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016639	AAT	2	6	12223	12228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016639	GCA	2	6	12240	12245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016639	TAA	2	6	12249	12254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016639	GCT	2	6	12266	12271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016639	CTT	2	6	12480	12485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016639	AGC	2	6	12499	12504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016639	CTT	2	6	12585	12590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016639	TTC	2	6	12673	12678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016639	TTA	2	6	12738	12743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016639	GTG	2	6	12837	12842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016639	TCG	2	6	12945	12950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016639	TTA	2	6	13057	13062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016639	TAA	2	6	15137	15142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016639	GTT	2	6	15158	15163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016639	GAA	2	6	15176	15181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016639	TAG	2	6	15389	15394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016639	TTG	2	6	18260	18265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016639	ATA	2	6	18322	18327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016639	GAC	2	6	18396	18401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016639	TTA	2	6	18456	18461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016639	TTA	2	6	18466	18471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016639	TTA	2	6	18540	18545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016639	TAT	2	6	18579	18584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016639	CAG	2	6	18885	18890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016639	GGC	2	6	18910	18915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016639	TAT	3	9	18922	18930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016639	ATG	2	6	19109	19114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016639	AAG	2	6	19121	19126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016639	CAA	2	6	19227	19232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016639	ATA	2	6	19236	19241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016639	ATA	2	6	19296	19301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016639	ATA	2	6	19358	19363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016639	GCA	2	6	19379	19384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016639	TAA	2	6	19386	19391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016639	GCT	2	6	19403	19408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016639	AAT	2	6	19497	19502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016639	TAA	2	6	19513	19518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016639	GTA	2	6	19526	19531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016639	ATC	2	6	19541	19546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016639	ATT	2	6	19616	19621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016639	ATT	2	6	19692	19697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016639	GTA	2	6	19837	19842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016639	TAC	2	6	19984	19989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016639	TCC	2	6	19993	19998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016639	TGA	2	6	20043	20048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016639	AAT	2	6	20122	20127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016639	TTG	2	6	20208	20213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016639	AAT	2	6	20248	20253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016639	ATT	2	6	20291	20296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016639	GTT	2	6	20313	20318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016639	AAT	2	6	20383	20388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016639	ACC	2	6	26477	26482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016639	AAT	2	6	26557	26562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016639	CAC	2	6	26576	26581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016639	TAC	2	6	26707	26712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016639	AAT	2	6	26849	26854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016639	AAC	2	6	27046	27051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016639	TAA	2	6	27097	27102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016639	TTA	2	6	27115	27120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016639	CTT	2	6	27174	27179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016639	AAT	2	6	27253	27258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016639	AAG	2	6	27341	27346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016639	AGT	2	6	27388	27393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016639	TAA	2	6	27452	27457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016639	TAA	2	6	27473	27478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016639	GAA	2	6	28371	28376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016639	GAA	2	6	28392	28397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016639	GAT	2	6	28582	28587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016639	GTA	2	6	28654	28659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016639	ATG	2	6	28670	28675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016639	TTA	2	6	28725	28730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016639	GAA	2	6	28756	28761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016639	CTT	2	6	28814	28819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_016639	TAA	2	6	28836	28841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016639	ATA	2	6	28867	28872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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