MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia slovaca 13-B chromosome

Total Repeats: 14283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016639	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318768
2	NC_016639	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318768
3	NC_016639	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318768
4	NC_016639	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318768
5	NC_016639	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318768
6	NC_016639	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318768
7	NC_016639	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318768
8	NC_016639	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318768
9	NC_016639	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318768
10	NC_016639	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318768
11	NC_016639	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318768
12	NC_016639	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318769
13	NC_016639	TGA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318769
14	NC_016639	GTA	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318769
15	NC_016639	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318769
16	NC_016639	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318769
17	NC_016639	TCT	2	6	1505	1510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318770
18	NC_016639	ATA	3	9	1769	1777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318770
19	NC_016639	GTA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318770
20	NC_016639	TGA	2	6	1935	1940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318770
21	NC_016639	GAA	2	6	1992	1997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318770
22	NC_016639	AAT	2	6	2022	2027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318770
23	NC_016639	AAG	2	6	2039	2044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318770
24	NC_016639	TTA	2	6	2077	2082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318770
25	NC_016639	CAA	3	9	2140	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318770
26	NC_016639	AGC	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318771
27	NC_016639	ATA	2	6	2437	2442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318771
28	NC_016639	ATA	2	6	2575	2580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318771
29	NC_016639	TAA	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318771
30	NC_016639	ATG	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318771
31	NC_016639	TAT	2	6	2856	2861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318771
32	NC_016639	TTA	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318771
33	NC_016639	CTC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318772
34	NC_016639	ATT	2	6	3078	3083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
35	NC_016639	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
36	NC_016639	ATT	2	6	3204	3209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
37	NC_016639	AGA	2	6	3377	3382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
38	NC_016639	AGA	2	6	3392	3397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
39	NC_016639	AGC	2	6	3407	3412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318772
40	NC_016639	TGC	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318772
41	NC_016639	ATT	2	6	3610	3615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
42	NC_016639	GAG	2	6	3687	3692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374318772
43	NC_016639	TAT	2	6	3848	3853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
44	NC_016639	GCA	2	6	3876	3881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318772
45	NC_016639	AGA	2	6	3974	3979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
46	NC_016639	CTA	2	6	4069	4074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318772
47	NC_016639	TAT	2	6	4125	4130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
48	NC_016639	TTA	2	6	4131	4136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
49	NC_016639	TGT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318772
50	NC_016639	ATA	2	6	4345	4350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
51	NC_016639	GGC	2	6	4596	4601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374318772
52	NC_016639	GCA	2	6	4620	4625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318772
53	NC_016639	GGA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374318772
54	NC_016639	GAA	2	6	4719	4724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
55	NC_016639	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
56	NC_016639	AAT	2	6	4761	4766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
57	NC_016639	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
58	NC_016639	TAA	2	6	4787	4792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
59	NC_016639	CTA	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318772
60	NC_016639	GAG	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374318772
61	NC_016639	AAG	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
62	NC_016639	ACG	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318772
63	NC_016639	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
64	NC_016639	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
65	NC_016639	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
66	NC_016639	GAT	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318772
67	NC_016639	TGC	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318772
68	NC_016639	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
69	NC_016639	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318772
70	NC_016639	CTA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318772
71	NC_016639	AGT	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318772
72	NC_016639	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374318772
73	NC_016639	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318772
74	NC_016639	TTA	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318772
75	NC_016639	ATA	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
76	NC_016639	TAA	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
77	NC_016639	ATA	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
78	NC_016639	GAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318772
79	NC_016639	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318772
80	NC_016639	ATG	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318772
81	NC_016639	TAT	2	6	6341	6346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318773
82	NC_016639	TTC	2	6	6367	6372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318773
83	NC_016639	TAA	2	6	6421	6426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318773
84	NC_016639	CTT	2	6	6441	6446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318773
85	NC_016639	GTT	2	6	6468	6473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318773
86	NC_016639	CTA	3	9	6689	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318774
87	NC_016639	ATT	2	6	6736	6741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318774
88	NC_016639	TTC	2	6	6802	6807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318774
89	NC_016639	ATC	2	6	6953	6958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318774
90	NC_016639	CCG	2	6	7001	7006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374318774
91	NC_016639	ATT	2	6	7007	7012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318774
92	NC_016639	TAC	2	6	7063	7068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318774
93	NC_016639	ATT	2	6	7069	7074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318774
94	NC_016639	ATT	3	9	7120	7128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318774
95	NC_016639	TCA	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318774
96	NC_016639	CCT	2	6	7151	7156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318774
97	NC_016639	TAT	2	6	7194	7199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318774
98	NC_016639	TAC	2	6	7318	7323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318774
99	NC_016639	GTA	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318774
100	NC_016639	CTT	2	6	7651	7656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374318775
101	NC_016639	TAG	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318775
102	NC_016639	AGC	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318775
103	NC_016639	CTA	2	6	7840	7845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318775
104	NC_016639	ATA	3	9	8132	8140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318776
105	NC_016639	ATA	2	6	8159	8164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318776
106	NC_016639	GCC	2	6	8179	8184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374318776
107	NC_016639	ATA	2	6	8342	8347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318776
108	NC_016639	TAG	2	6	8445	8450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318776
109	NC_016639	ATT	2	6	8470	8475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318776
110	NC_016639	ACG	2	6	8576	8581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318776
111	NC_016639	TCG	2	6	8582	8587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318776
112	NC_016639	TGT	2	6	8615	8620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374318776
113	NC_016639	CTC	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374318776
114	NC_016639	TAT	2	6	8685	8690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318776
115	NC_016639	TAA	2	6	8697	8702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318776
116	NC_016639	CAA	2	6	8766	8771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374318776
117	NC_016639	ATT	2	6	8783	8788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318776
118	NC_016639	TAA	2	6	8866	8871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318776
119	NC_016639	AGC	3	9	8920	8928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374318776
120	NC_016639	AGG	2	6	9043	9048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374318776
121	NC_016639	TAC	2	6	9117	9122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318776
122	NC_016639	GGT	2	6	9631	9636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374318777
123	NC_016639	AGT	2	6	9712	9717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374318777
124	NC_016639	GGT	2	6	9728	9733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374318777
125	NC_016639	GCT	2	6	9740	9745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374318777
126	NC_016639	GAA	2	6	9773	9778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318777
127	NC_016639	TAT	2	6	11123	11128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318778
128	NC_016639	TTA	2	6	11166	11171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374318778
129	NC_016639	ATA	2	6	11243	11248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374318778
130	NC_016639	AGA	2	6	11632	11637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374318779
131	NC_016639	CAT	2	6	11708	11713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374318779
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