MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma haemocanis str. Illinois chromosome

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016638	AGCTA	2	10	17672	17681	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016638	TTCAC	2	10	17827	17836	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016638	ATCTT	2	10	57649	57658	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016638	ATAAA	2	10	57724	57733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016638	AGTTA	2	10	96985	96994	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016638	ATTTT	2	10	100282	100291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016638	CCAGC	2	10	111620	111629	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_016638	TTCTT	2	10	148038	148047	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016638	ATTAA	2	10	153900	153909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016638	TAAAA	2	10	153990	153999	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016638	CTCTT	2	10	176920	176929	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016638	TATAA	2	10	203871	203880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016638	TAGCT	2	10	206058	206067	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016638	TAGTG	2	10	206441	206450	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016638	ATGTC	2	10	252976	252985	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016638	AGGGA	2	10	278550	278559	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016638	AAACT	2	10	301039	301048	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016638	ATTTT	2	10	319363	319372	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016638	TAGTA	2	10	319446	319455	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016638	AAGAA	2	10	332958	332967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016638	TCCAT	2	10	336484	336493	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016638	AGTAA	2	10	357311	357320	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016638	AAGAA	2	10	374323	374332	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016638	TATTT	2	10	376057	376066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016638	TTTCT	2	10	386101	386110	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016638	TTATG	2	10	388846	388855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016638	TAAAT	2	10	397069	397078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016638	ACCAA	2	10	399927	399936	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016638	ATTTA	2	10	407989	407998	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016638	TTATC	2	10	408274	408283	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016638	TTTCA	2	10	408982	408991	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016638	ATACT	2	10	413221	413230	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016638	TTGAG	2	10	433587	433596	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016638	ATTTG	2	10	443831	443840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016638	ACTAG	2	10	450886	450895	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016638	TCGGT	2	10	451261	451270	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016638	TTCAC	2	10	451832	451841	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016638	TAACA	2	10	453794	453803	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016638	GTCAA	2	10	455772	455781	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016638	TAAGA	2	10	455873	455882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016638	ACTCA	2	10	478154	478163	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016638	TAAAT	2	10	484582	484591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016638	TAAAG	2	10	487095	487104	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016638	TTAAA	2	10	493283	493292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016638	AAGTT	2	10	505736	505745	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016638	TAATT	2	10	508030	508039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016638	TTTTC	2	10	580788	580797	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016638	GAAGA	2	10	583037	583046	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016638	CTTAA	2	10	584205	584214	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016638	AGACT	2	10	606439	606448	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016638	GGTTT	2	10	610177	610186	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016638	TTCCC	2	10	612161	612170	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016638	GGTTT	2	10	612304	612313	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016638	TTAAT	2	10	628246	628255	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016638	GAAAA	2	10	631813	631822	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016638	TTCAA	2	10	646027	646036	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016638	TTTAG	2	10	651528	651537	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016638	AAAAC	2	10	656151	656160	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016638	TAATC	2	10	667008	667017	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016638	ACACA	2	10	697456	697465	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016638	TTTGT	2	10	697468	697477	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016638	TTCCA	2	10	736954	736963	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016638	AAGAA	2	10	738765	738774	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016638	CCAAT	2	10	739925	739934	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016638	TGGTA	2	10	744464	744473	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016638	ATTTT	2	10	772513	772522	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016638	TATCT	2	10	777811	777820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016638	TTAAA	2	10	779497	779506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016638	ATTTT	2	10	791500	791509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016638	TCCTG	2	10	792235	792244	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_016638	AAGAT	2	10	792261	792270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016638	ATTAC	2	10	793789	793798	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016638	CTTAT	2	10	829561	829570	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.