MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma haemocanis str. Illinois chromosome

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016638	TCAA	2	8	5291	5298	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016638	ATGC	2	8	17799	17806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016638	ATTT	2	8	17936	17943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016638	CTTA	2	8	29263	29270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016638	CCGA	2	8	55630	55637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016638	ATTT	2	8	55783	55790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016638	ATAG	2	8	65958	65965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016638	ATTA	2	8	82433	82440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016638	ATAG	2	8	84695	84702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016638	ATGA	2	8	86808	86815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016638	TCCC	2	8	111534	111541	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_016638	TAGT	2	8	111713	111720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016638	TATT	2	8	131729	131736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016638	TTCT	2	8	148076	148083	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016638	CTTT	2	8	160511	160518	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016638	GAAA	2	8	162480	162487	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016638	TTCT	2	8	177446	177453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016638	GGAG	2	8	198969	198976	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016638	TAGC	2	8	198982	198989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016638	ATCC	2	8	199276	199283	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016638	ATAA	2	8	199386	199393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016638	AAAG	2	8	199760	199767	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016638	AAGA	2	8	199834	199841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016638	TAAG	2	8	200125	200132	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016638	TTTA	2	8	200362	200369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016638	AAAG	2	8	200441	200448	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016638	TAAT	2	8	204103	204110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016638	GACA	2	8	205953	205960	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016638	GCTT	2	8	206077	206084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016638	CTTT	2	8	212487	212494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016638	TTCT	2	8	212498	212505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016638	TAAA	2	8	221186	221193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016638	TTAG	2	8	221785	221792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016638	TGAT	2	8	227032	227039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016638	GGGA	2	8	227053	227060	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016638	TTCA	2	8	232333	232340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016638	TTAT	2	8	234400	234407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016638	GTAG	2	8	244435	244442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016638	ATGT	2	8	246988	246995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016638	AAAT	2	8	247167	247174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016638	ATTT	2	8	253012	253019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016638	GAAA	2	8	258268	258275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016638	CAAC	2	8	266684	266691	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016638	TTCA	2	8	273520	273527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016638	ATAC	2	8	273629	273636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016638	ATTT	2	8	275509	275516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016638	TAAA	2	8	276892	276899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016638	TTTC	2	8	278296	278303	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016638	ATTT	2	8	282328	282335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016638	TTAT	2	8	282351	282358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016638	TTTG	2	8	283420	283427	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016638	AATT	2	8	283467	283474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016638	TACA	2	8	283486	283493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016638	AAAG	2	8	285153	285160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016638	AAGG	2	8	289148	289155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016638	TCCT	2	8	297621	297628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016638	TCAA	2	8	299087	299094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016638	CTTA	2	8	313841	313848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016638	GTAA	2	8	313876	313883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016638	TCAC	2	8	319427	319434	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016638	CCTT	2	8	319482	319489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016638	GTTT	2	8	319529	319536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016638	AAAT	2	8	319537	319544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016638	CTTT	2	8	324123	324130	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016638	TAAA	2	8	335054	335061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016638	TTAG	2	8	337057	337064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016638	TTAA	2	8	337758	337765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016638	TAAA	2	8	340410	340417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016638	GAAT	2	8	343548	343555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016638	AAAT	2	8	357173	357180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016638	TAGA	2	8	357321	357328	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016638	GGGA	2	8	357833	357840	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016638	AATT	2	8	363118	363125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016638	TAAT	2	8	364574	364581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016638	ATCT	2	8	365349	365356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016638	TATT	2	8	365357	365364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016638	TTAA	3	12	366238	366249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016638	AAGC	2	8	366263	366270	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016638	TAGT	2	8	366868	366875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016638	TTGT	2	8	366895	366902	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016638	TTTC	2	8	366946	366953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016638	TTTA	2	8	367382	367389	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016638	ATTA	2	8	368718	368725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016638	TAGC	2	8	369562	369569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016638	GTTT	2	8	369680	369687	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016638	TAAA	2	8	374770	374777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016638	TTCT	2	8	374805	374812	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016638	AAAG	2	8	374891	374898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016638	AATT	2	8	375344	375351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016638	TATT	2	8	379419	379426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016638	CTTT	2	8	381006	381013	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016638	GAGT	2	8	382181	382188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016638	AGCT	2	8	382267	382274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016638	ATTT	2	8	382512	382519	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016638	AGAA	2	8	384075	384082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016638	AATT	2	8	384161	384168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016638	ACTT	2	8	386069	386076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016638	TTCT	2	8	388687	388694	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016638	AGAA	2	8	388780	388787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016638	TAAA	2	8	388789	388796	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016638	CTTC	2	8	388803	388810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016638	GTGG	2	8	388917	388924	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016638	ATGG	2	8	389148	389155	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016638	AGAA	2	8	389420	389427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016638	TATG	2	8	389429	389436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016638	CTTT	2	8	389461	389468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016638	TTCC	2	8	391621	391628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016638	AAGA	2	8	391638	391645	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016638	TAAA	2	8	393762	393769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016638	ACTT	2	8	393897	393904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016638	ATTT	2	8	397053	397060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016638	AAAT	2	8	397893	397900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016638	GGAA	2	8	403791	403798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016638	TTTA	2	8	403919	403926	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016638	ATCT	2	8	408165	408172	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016638	TTAA	2	8	408203	408210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016638	ATTA	2	8	408308	408315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016638	TAAG	2	8	409024	409031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016638	AAAC	2	8	409138	409145	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016638	GATA	2	8	411327	411334	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016638	AATT	2	8	411369	411376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016638	CAGA	2	8	411382	411389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016638	GTAA	2	8	412632	412639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016638	GTTA	2	8	412780	412787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016638	TAAA	2	8	412796	412803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016638	TCGG	2	8	412929	412936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016638	GCAA	2	8	423677	423684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016638	ATTA	2	8	424549	424556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016638	TTAC	2	8	433923	433930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016638	TTAA	2	8	436631	436638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016638	CTTT	3	12	436654	436665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016638	ATGG	2	8	436754	436761	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016638	CTAT	2	8	448907	448914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016638	GGGA	2	8	449240	449247	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016638	CATA	2	8	449302	449309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016638	TCCT	2	8	449397	449404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016638	CTTC	2	8	450965	450972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016638	TTCA	2	8	451092	451099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016638	TGCA	2	8	451401	451408	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016638	ACGC	2	8	451437	451444	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016638	TCTT	2	8	451803	451810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016638	AAAT	2	8	452298	452305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016638	TCCT	2	8	452562	452569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016638	GCTT	2	8	453139	453146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016638	CTAT	2	8	453406	453413	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016638	TAAT	2	8	464292	464299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016638	AATC	2	8	464364	464371	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016638	TGAA	2	8	464434	464441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016638	TTCT	2	8	471102	471109	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016638	GAAT	2	8	477148	477155	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016638	TATT	2	8	483174	483181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.