MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methanosaeta harundinacea 6Ac plasmid pH6Ac

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016637	ATCG	2	8	9	16	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016637	TCCC	2	8	221	228	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_016637	GTTA	2	8	231	238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016637	GATA	2	8	1012	1019	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016637	CCGG	2	8	1588	1595	0 %	0 %	50 %	50 %	386003075
6	NC_016637	ATCC	2	8	1616	1623	25 %	25 %	0 %	50 %	386003076
7	NC_016637	CCTC	2	8	1940	1947	0 %	25 %	0 %	75 %	386003076
8	NC_016637	CTCC	2	8	1970	1977	0 %	25 %	0 %	75 %	386003076
9	NC_016637	CTAT	2	8	2048	2055	25 %	50 %	0 %	25 %	386003076
10	NC_016637	GGAA	2	8	2063	2070	50 %	0 %	50 %	0 %	386003076
11	NC_016637	ACCG	2	8	2268	2275	25 %	0 %	25 %	50 %	386003076
12	NC_016637	TGGC	2	8	2511	2518	0 %	25 %	50 %	25 %	386003076
13	NC_016637	CTCC	2	8	3609	3616	0 %	25 %	0 %	75 %	386003076
14	NC_016637	CCGG	2	8	3854	3861	0 %	0 %	50 %	50 %	386003076
15	NC_016637	GTGG	2	8	3959	3966	0 %	25 %	75 %	0 %	386003076
16	NC_016637	CCCT	2	8	4788	4795	0 %	25 %	0 %	75 %	386003076
17	NC_016637	AGGC	2	8	5983	5990	25 %	0 %	50 %	25 %	386003078
18	NC_016637	CTGG	2	8	6389	6396	0 %	25 %	50 %	25 %	386003080
19	NC_016637	ACAG	2	8	7138	7145	50 %	0 %	25 %	25 %	386003082
20	NC_016637	ACCA	2	8	7207	7214	50 %	0 %	0 %	50 %	386003082
21	NC_016637	CCAC	2	8	7610	7617	25 %	0 %	0 %	75 %	386003083
22	NC_016637	CAGG	2	8	7625	7632	25 %	0 %	50 %	25 %	386003083
23	NC_016637	ATCC	2	8	8162	8169	25 %	25 %	0 %	50 %	386003084
24	NC_016637	GTCG	2	8	8269	8276	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016637	GGCG	2	8	8325	8332	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016637	TCCC	2	8	8474	8481	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_016637	GGCG	2	8	8568	8575	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016637	TGGG	2	8	8664	8671	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016637	GAAG	2	8	8753	8760	50 %	0 %	50 %	0 %	386003085
30	NC_016637	GACC	2	8	9188	9195	25 %	0 %	25 %	50 %	386003086
31	NC_016637	GGCT	2	8	9226	9233	0 %	25 %	50 %	25 %	386003086
32	NC_016637	CTGG	2	8	9317	9324	0 %	25 %	50 %	25 %	386003086
33	NC_016637	GGTA	2	8	10269	10276	25 %	25 %	50 %	0 %	386003087
34	NC_016637	TAAT	2	8	11343	11350	50 %	50 %	0 %	0 %	386003089
35	NC_016637	TACC	2	8	11376	11383	25 %	25 %	0 %	50 %	386003089

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.