MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 plasmid pTCCB09

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016634	GAACCT	2	12	1193	1204	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384440652
2	NC_016634	CTACCT	2	12	2419	2430	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384440655
3	NC_016634	CGGGCG	2	12	3125	3136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384440656
4	NC_016634	GGCCAG	2	12	4354	4365	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440656
5	NC_016634	GGGCCA	2	12	5302	5313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440659
6	NC_016634	CCCGGG	2	12	5401	5412	0 %	0 %	50 %	50 %	384440659
7	NC_016634	ACCCGC	2	12	5511	5522	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384440659
8	NC_016634	GGGCCA	2	12	5818	5829	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440659
9	NC_016634	AAGCGC	2	12	8008	8019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440663
10	NC_016634	ACCCGC	2	12	8073	8084	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384440664
11	NC_016634	AAAGGC	2	12	8549	8560	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384440665
12	NC_016634	TGGAGG	2	12	12074	12085	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384440670
13	NC_016634	GTAGCG	2	12	12431	12442	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384440670
14	NC_016634	GGCGGA	2	12	12986	12997	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384440670
15	NC_016634	CCCTCC	2	12	15937	15948	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384440677
16	NC_016634	GGCCAG	2	12	17446	17457	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440678
17	NC_016634	GGCTCA	2	12	18309	18320	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384440680
18	NC_016634	CCCGCA	2	12	19146	19157	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384440680
19	NC_016634	CCAGGG	2	12	19371	19382	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384440680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.