MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 plasmid pTCCB09

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016634	ACCAG	2	10	196	205	40 %	0 %	20 %	40 %	384440649
2	NC_016634	CAGGC	2	10	1650	1659	20 %	0 %	40 %	40 %	384440653
3	NC_016634	GCAGG	2	10	2164	2173	20 %	0 %	60 %	20 %	384440655
4	NC_016634	GGCTG	2	10	2504	2513	0 %	20 %	60 %	20 %	384440655
5	NC_016634	GAGGG	2	10	2628	2637	20 %	0 %	80 %	0 %	384440655
6	NC_016634	GGGGT	2	10	2768	2777	0 %	20 %	80 %	0 %	384440655
7	NC_016634	GCCCT	2	10	2792	2801	0 %	20 %	20 %	60 %	384440656
8	NC_016634	GGCTC	2	10	3077	3086	0 %	20 %	40 %	40 %	384440656
9	NC_016634	GGCGG	2	10	3516	3525	0 %	0 %	80 %	20 %	384440656
10	NC_016634	AGGGG	2	10	3572	3581	20 %	0 %	80 %	0 %	384440656
11	NC_016634	CCCTC	2	10	4667	4676	0 %	20 %	0 %	80 %	384440657
12	NC_016634	CTCCC	2	10	4890	4899	0 %	20 %	0 %	80 %	384440658
13	NC_016634	GGAGA	2	10	6938	6947	40 %	0 %	60 %	0 %	384440661
14	NC_016634	ACCTA	2	10	8144	8153	40 %	20 %	0 %	40 %	384440664
15	NC_016634	GAATG	2	10	9856	9865	40 %	20 %	40 %	0 %	384440666
16	NC_016634	CTTGC	2	10	11819	11828	0 %	40 %	20 %	40 %	384440669
17	NC_016634	CCCGC	2	10	12160	12169	0 %	0 %	20 %	80 %	384440670
18	NC_016634	CTCCC	2	10	12515	12524	0 %	20 %	0 %	80 %	384440670
19	NC_016634	GGGCA	2	10	14672	14681	20 %	0 %	60 %	20 %	384440675
20	NC_016634	GGAGG	2	10	15064	15073	20 %	0 %	80 %	0 %	384440676
21	NC_016634	CTCCC	2	10	16123	16132	0 %	20 %	0 %	80 %	384440677
22	NC_016634	GAAGG	2	10	16798	16807	40 %	0 %	60 %	0 %	384440678
23	NC_016634	GCCCG	2	10	17630	17639	0 %	0 %	40 %	60 %	384440678
24	NC_016634	CCTTC	2	10	17667	17676	0 %	40 %	0 %	60 %	384440678
25	NC_016634	GGAGG	2	10	18727	18736	20 %	0 %	80 %	0 %	384440680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.