MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 plasmid pTCCB09

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016634	GC	3	6	155	160	0 %	0 %	50 %	50 %	384440649
2	NC_016634	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	384440649
3	NC_016634	AG	3	6	381	386	50 %	0 %	50 %	0 %	384440650
4	NC_016634	GA	3	6	806	811	50 %	0 %	50 %	0 %	384440651
5	NC_016634	GC	3	6	896	901	0 %	0 %	50 %	50 %	384440651
6	NC_016634	TG	3	6	1210	1215	0 %	50 %	50 %	0 %	384440652
7	NC_016634	GC	3	6	2497	2502	0 %	0 %	50 %	50 %	384440655
8	NC_016634	AG	3	6	3031	3036	50 %	0 %	50 %	0 %	384440656
9	NC_016634	AG	3	6	3476	3481	50 %	0 %	50 %	0 %	384440656
10	NC_016634	AG	3	6	3976	3981	50 %	0 %	50 %	0 %	384440656
11	NC_016634	GC	3	6	5559	5564	0 %	0 %	50 %	50 %	384440659
12	NC_016634	GC	3	6	7429	7434	0 %	0 %	50 %	50 %	384440663
13	NC_016634	GA	3	6	7494	7499	50 %	0 %	50 %	0 %	384440663
14	NC_016634	CG	3	6	7979	7984	0 %	0 %	50 %	50 %	384440663
15	NC_016634	AC	3	6	9330	9335	50 %	0 %	0 %	50 %	384440666
16	NC_016634	TC	3	6	9465	9470	0 %	50 %	0 %	50 %	384440666
17	NC_016634	AT	3	6	9539	9544	50 %	50 %	0 %	0 %	384440666
18	NC_016634	AG	3	6	10092	10097	50 %	0 %	50 %	0 %	384440666
19	NC_016634	AT	3	6	10660	10665	50 %	50 %	0 %	0 %	384440667
20	NC_016634	TC	3	6	10755	10760	0 %	50 %	0 %	50 %	384440667
21	NC_016634	TC	3	6	10789	10794	0 %	50 %	0 %	50 %	384440667
22	NC_016634	AG	3	6	11143	11148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016634	CA	3	6	11165	11170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016634	GT	3	6	11341	11346	0 %	50 %	50 %	0 %	384440668
25	NC_016634	GC	3	6	11472	11477	0 %	0 %	50 %	50 %	384440668
26	NC_016634	AG	3	6	11717	11722	50 %	0 %	50 %	0 %	384440669
27	NC_016634	CG	3	6	12109	12114	0 %	0 %	50 %	50 %	384440670
28	NC_016634	GA	3	6	12804	12809	50 %	0 %	50 %	0 %	384440670
29	NC_016634	CG	3	6	13813	13818	0 %	0 %	50 %	50 %	384440672
30	NC_016634	CT	3	6	17005	17010	0 %	50 %	0 %	50 %	384440678
31	NC_016634	AG	3	6	19346	19351	50 %	0 %	50 %	0 %	384440680

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.