MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 2477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016633	TGAAT	2	10	99	108	40 %	40 %	20 %	0 %	374314451
2	NC_016633	ATCAA	2	10	517	526	60 %	20 %	0 %	20 %	374314451
3	NC_016633	GGAAG	2	10	867	876	40 %	0 %	60 %	0 %	374314451
4	NC_016633	GAAAA	2	10	1582	1591	80 %	0 %	20 %	0 %	374314452
5	NC_016633	CATTC	2	10	1828	1837	20 %	40 %	0 %	40 %	374314452
6	NC_016633	TTCCA	2	10	2742	2751	20 %	40 %	0 %	40 %	374314453
7	NC_016633	TTGGA	2	10	3059	3068	20 %	40 %	40 %	0 %	374314454
8	NC_016633	CAGGA	2	10	3284	3293	40 %	0 %	40 %	20 %	374314454
9	NC_016633	CCTTT	2	10	3390	3399	0 %	60 %	0 %	40 %	374314454
10	NC_016633	ATAAA	2	10	4301	4310	80 %	20 %	0 %	0 %	374314455
11	NC_016633	AGCTT	2	10	6877	6886	20 %	40 %	20 %	20 %	374314458
12	NC_016633	GAATT	2	10	7138	7147	40 %	40 %	20 %	0 %	374314458
13	NC_016633	CATCC	2	10	8078	8087	20 %	20 %	0 %	60 %	374314458
14	NC_016633	ATCAA	2	10	8284	8293	60 %	20 %	0 %	20 %	374314458
15	NC_016633	ACGTT	2	10	9523	9532	20 %	40 %	20 %	20 %	374314458
16	NC_016633	TGGTA	2	10	10634	10643	20 %	40 %	40 %	0 %	374314460
17	NC_016633	TTTCT	2	10	10687	10696	0 %	80 %	0 %	20 %	374314460
18	NC_016633	CCAGG	2	10	11819	11828	20 %	0 %	40 %	40 %	374314460
19	NC_016633	CCTTG	2	10	11837	11846	0 %	40 %	20 %	40 %	374314460
20	NC_016633	GTTCT	2	10	11975	11984	0 %	60 %	20 %	20 %	374314460
21	NC_016633	AGAAA	2	10	15726	15735	80 %	0 %	20 %	0 %	374314464
22	NC_016633	AATCG	2	10	16008	16017	40 %	20 %	20 %	20 %	374314464
23	NC_016633	CCAAA	2	10	17400	17409	60 %	0 %	0 %	40 %	374314465
24	NC_016633	TTTCC	2	10	17523	17532	0 %	60 %	0 %	40 %	374314465
25	NC_016633	TTGCT	2	10	18565	18574	0 %	60 %	20 %	20 %	374314466
26	NC_016633	TAATT	2	10	24847	24856	40 %	60 %	0 %	0 %	374314472
27	NC_016633	ATTTT	2	10	25382	25391	20 %	80 %	0 %	0 %	374314472
28	NC_016633	CCTTT	2	10	25866	25875	0 %	60 %	0 %	40 %	374314472
29	NC_016633	CTTGA	2	10	28264	28273	20 %	40 %	20 %	20 %	374314474
30	NC_016633	GTATT	2	10	33174	33183	20 %	60 %	20 %	0 %	374314479
31	NC_016633	CGTTT	2	10	34294	34303	0 %	60 %	20 %	20 %	374314480
32	NC_016633	TTTGC	2	10	36833	36842	0 %	60 %	20 %	20 %	374314483
33	NC_016633	GGGGC	2	10	37591	37600	0 %	0 %	80 %	20 %	374314483
34	NC_016633	AAAAG	2	10	43600	43609	80 %	0 %	20 %	0 %	374314488
35	NC_016633	ACCTT	2	10	43650	43659	20 %	40 %	0 %	40 %	374314488
36	NC_016633	CGATT	2	10	45490	45499	20 %	40 %	20 %	20 %	374314492
37	NC_016633	AGCAA	2	10	45509	45518	60 %	0 %	20 %	20 %	374314492
38	NC_016633	GGTAG	2	10	45859	45868	20 %	20 %	60 %	0 %	374314492
39	NC_016633	CTGAT	2	10	46226	46235	20 %	40 %	20 %	20 %	374314492
40	NC_016633	AGGAG	2	10	46419	46428	40 %	0 %	60 %	0 %	374314492
41	NC_016633	CATTG	2	10	47010	47019	20 %	40 %	20 %	20 %	374314493
42	NC_016633	GGCAG	2	10	48617	48626	20 %	0 %	60 %	20 %	374314494
43	NC_016633	TTGCT	2	10	50316	50325	0 %	60 %	20 %	20 %	374314496
44	NC_016633	GGCAA	2	10	51867	51876	40 %	0 %	40 %	20 %	374314496
45	NC_016633	GCAAG	2	10	54920	54929	40 %	0 %	40 %	20 %	374314497
46	NC_016633	ATGCT	2	10	57210	57219	20 %	40 %	20 %	20 %	374314499
47	NC_016633	GTTCT	2	10	58314	58323	0 %	60 %	20 %	20 %	374314500
48	NC_016633	TCCAT	2	10	60619	60628	20 %	40 %	0 %	40 %	374314503
49	NC_016633	CCGTA	2	10	63797	63806	20 %	20 %	20 %	40 %	374314507
50	NC_016633	TGTAT	2	10	65499	65508	20 %	60 %	20 %	0 %	374314508
51	NC_016633	AACCC	2	10	67373	67382	40 %	0 %	0 %	60 %	374314510
52	NC_016633	CCTTT	2	10	67894	67903	0 %	60 %	0 %	40 %	374314510
53	NC_016633	CCTGT	2	10	69098	69107	0 %	40 %	20 %	40 %	374314511
54	NC_016633	GAAGG	2	10	69557	69566	40 %	0 %	60 %	0 %	374314511
55	NC_016633	CAGCC	2	10	71081	71090	20 %	0 %	20 %	60 %	374314513
56	NC_016633	GTATC	2	10	71353	71362	20 %	40 %	20 %	20 %	374314513
57	NC_016633	GAAGG	2	10	71591	71600	40 %	0 %	60 %	0 %	374314513
58	NC_016633	GCTGA	2	10	74143	74152	20 %	20 %	40 %	20 %	374314517
59	NC_016633	TTGGG	2	10	75301	75310	0 %	40 %	60 %	0 %	374314518
60	NC_016633	AGAGG	2	10	75595	75604	40 %	0 %	60 %	0 %	374314518
61	NC_016633	TTGCC	2	10	76200	76209	0 %	40 %	20 %	40 %	374314518
62	NC_016633	CAGTT	2	10	77100	77109	20 %	40 %	20 %	20 %	374314518
63	NC_016633	CGGGA	2	10	79647	79656	20 %	0 %	60 %	20 %	374314520
64	NC_016633	TTCCG	2	10	79712	79721	0 %	40 %	20 %	40 %	374314520
65	NC_016633	CAACT	2	10	80514	80523	40 %	20 %	0 %	40 %	374314521
66	NC_016633	ACCGA	2	10	80566	80575	40 %	0 %	20 %	40 %	374314521
67	NC_016633	TACCT	2	10	83154	83163	20 %	40 %	0 %	40 %	374314525
68	NC_016633	CAAGG	2	10	83493	83502	40 %	0 %	40 %	20 %	374314525
69	NC_016633	AAGGG	2	10	84245	84254	40 %	0 %	60 %	0 %	374314525
70	NC_016633	AATGA	2	10	85279	85288	60 %	20 %	20 %	0 %	374314527
71	NC_016633	CCTTT	2	10	86666	86675	0 %	60 %	0 %	40 %	374314528
72	NC_016633	TCCCA	2	10	86931	86940	20 %	20 %	0 %	60 %	374314528
73	NC_016633	CTTTG	2	10	87337	87346	0 %	60 %	20 %	20 %	374314529
74	NC_016633	TCTTG	2	10	89356	89365	0 %	60 %	20 %	20 %	374314531
75	NC_016633	CCTTT	2	10	90040	90049	0 %	60 %	0 %	40 %	374314531
76	NC_016633	CTGTA	2	10	97259	97268	20 %	40 %	20 %	20 %	374314540
77	NC_016633	GAATG	2	10	97704	97713	40 %	20 %	40 %	0 %	374314540
78	NC_016633	GTTTG	2	10	102222	102231	0 %	60 %	40 %	0 %	374314544
79	NC_016633	TTCTG	2	10	104286	104295	0 %	60 %	20 %	20 %	374314546
80	NC_016633	AATCG	2	10	109563	109572	40 %	20 %	20 %	20 %	374314551
81	NC_016633	CCGAT	2	10	110080	110089	20 %	20 %	20 %	40 %	374314552
82	NC_016633	GCAAT	2	10	110756	110765	40 %	20 %	20 %	20 %	374314553
83	NC_016633	GCCTT	2	10	113162	113171	0 %	40 %	20 %	40 %	374314554
84	NC_016633	TGAAT	2	10	113350	113359	40 %	40 %	20 %	0 %	374314554
85	NC_016633	CTTGC	2	10	115583	115592	0 %	40 %	20 %	40 %	374314556
86	NC_016633	GATTC	2	10	115640	115649	20 %	40 %	20 %	20 %	374314556
87	NC_016633	AGCGC	2	10	116420	116429	20 %	0 %	40 %	40 %	374314558
88	NC_016633	TCGAT	2	10	116748	116757	20 %	40 %	20 %	20 %	374314558
89	NC_016633	GGGAC	2	10	117239	117248	20 %	0 %	60 %	20 %	374314559
90	NC_016633	CCTTT	2	10	117710	117719	0 %	60 %	0 %	40 %	374314559
91	NC_016633	GAAGA	2	10	119514	119523	60 %	0 %	40 %	0 %	374314559
92	NC_016633	CCTTG	2	10	119543	119552	0 %	40 %	20 %	40 %	374314559
93	NC_016633	TCTGA	2	10	122215	122224	20 %	40 %	20 %	20 %	374314563
94	NC_016633	GATAG	2	10	122984	122993	40 %	20 %	40 %	0 %	374314564
95	NC_016633	CAAGG	2	10	123020	123029	40 %	0 %	40 %	20 %	374314564
96	NC_016633	GGGGA	2	10	125292	125301	20 %	0 %	80 %	0 %	374314565
97	NC_016633	TCTTT	2	10	125551	125560	0 %	80 %	0 %	20 %	374314565
98	NC_016633	TTTTC	2	10	128361	128370	0 %	80 %	0 %	20 %	374314568
99	NC_016633	ACGAA	2	10	128461	128470	60 %	0 %	20 %	20 %	374314568
100	NC_016633	TTCCT	2	10	130958	130967	0 %	60 %	0 %	40 %	374314570
101	NC_016633	TATCC	2	10	133641	133650	20 %	40 %	0 %	40 %	374314572
102	NC_016633	TTTTG	2	10	135497	135506	0 %	80 %	20 %	0 %	374314575
103	NC_016633	CATTA	2	10	136352	136361	40 %	40 %	0 %	20 %	374314576
104	NC_016633	AGGGT	2	10	139635	139644	20 %	20 %	60 %	0 %	374314579
105	NC_016633	CACAG	2	10	140299	140308	40 %	0 %	20 %	40 %	374314579
106	NC_016633	CAAGG	2	10	141551	141560	40 %	0 %	40 %	20 %	374314580
107	NC_016633	ATTGG	2	10	144538	144547	20 %	40 %	40 %	0 %	374314582
108	NC_016633	GGGAT	2	10	144935	144944	20 %	20 %	60 %	0 %	374314582
109	NC_016633	ATGCT	2	10	146069	146078	20 %	40 %	20 %	20 %	374314583
110	NC_016633	TTACC	2	10	148841	148850	20 %	40 %	0 %	40 %	374314586
111	NC_016633	TAGCG	2	10	150227	150236	20 %	20 %	40 %	20 %	374314587
112	NC_016633	CTTTT	2	10	151826	151835	0 %	80 %	0 %	20 %	374314588
113	NC_016633	ATACT	2	10	153538	153547	40 %	40 %	0 %	20 %	374314589
114	NC_016633	GAAGA	2	10	155464	155473	60 %	0 %	40 %	0 %	374314591
115	NC_016633	TTCTG	2	10	156043	156052	0 %	60 %	20 %	20 %	374314591
116	NC_016633	TTTGC	2	10	156065	156074	0 %	60 %	20 %	20 %	374314591
117	NC_016633	TTTTC	2	10	157489	157498	0 %	80 %	0 %	20 %	374314592
118	NC_016633	CAGAA	2	10	159258	159267	60 %	0 %	20 %	20 %	374314593
119	NC_016633	ATTTG	2	10	160195	160204	20 %	60 %	20 %	0 %	374314594
120	NC_016633	GAATT	2	10	160986	160995	40 %	40 %	20 %	0 %	374314595
121	NC_016633	AGGAT	2	10	161772	161781	40 %	20 %	40 %	0 %	374314596
122	NC_016633	ATTCC	2	10	161894	161903	20 %	40 %	0 %	40 %	374314596
123	NC_016633	TCCTG	2	10	163629	163638	0 %	40 %	20 %	40 %	374314598
124	NC_016633	GCAGG	2	10	164889	164898	20 %	0 %	60 %	20 %	374314599
125	NC_016633	CAAAA	2	10	164939	164948	80 %	0 %	0 %	20 %	374314599
126	NC_016633	TGCTT	2	10	165723	165732	0 %	60 %	20 %	20 %	374314600
127	NC_016633	AAATC	2	10	165869	165878	60 %	20 %	0 %	20 %	374314600
128	NC_016633	CAAGG	2	10	166351	166360	40 %	0 %	40 %	20 %	374314600
129	NC_016633	GTCTG	2	10	166581	166590	0 %	40 %	40 %	20 %	374314600
130	NC_016633	ACAAA	2	10	168374	168383	80 %	0 %	0 %	20 %	374314603
131	NC_016633	CGAAG	2	10	170352	170361	40 %	0 %	40 %	20 %	374314604
132	NC_016633	CCTTG	2	10	171181	171190	0 %	40 %	20 %	40 %	374314605
133	NC_016633	TCAAT	2	10	171507	171516	40 %	40 %	0 %	20 %	374314605
134	NC_016633	CTCAT	2	10	171823	171832	20 %	40 %	0 %	40 %	374314606
135	NC_016633	AGGGG	2	10	172948	172957	20 %	0 %	80 %	0 %	374314607
136	NC_016633	GAATG	2	10	173120	173129	40 %	20 %	40 %	0 %	374314607
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250	NC_016633	AAGCA	2	10	327996	328005	60 %	0 %	20 %	20 %	374314751
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257	NC_016633	TGCAG	2	10	335628	335637	20 %	20 %	40 %	20 %	374314758
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261	NC_016633	GGAAG	2	10	345114	345123	40 %	0 %	60 %	0 %	374314765
262	NC_016633	CCTTG	2	10	345627	345636	0 %	40 %	20 %	40 %	374314765
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