MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 9614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016633	AAAG	2	8	1093	1100	75 %	0 %	25 %	0 %	374314451
2	NC_016633	TTCG	2	8	1434	1441	0 %	50 %	25 %	25 %	374314452
3	NC_016633	ATGA	2	8	2253	2260	50 %	25 %	25 %	0 %	374314453
4	NC_016633	TGCT	2	8	2598	2605	0 %	50 %	25 %	25 %	374314453
5	NC_016633	TAAA	2	8	4177	4184	75 %	25 %	0 %	0 %	374314455
6	NC_016633	TTTG	2	8	4416	4423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016633	GAAC	2	8	4507	4514	50 %	0 %	25 %	25 %	374314456
8	NC_016633	TCAT	2	8	4652	4659	25 %	50 %	0 %	25 %	374314456
9	NC_016633	CCTT	2	8	5023	5030	0 %	50 %	0 %	50 %	374314456
10	NC_016633	TTGC	2	8	5033	5040	0 %	50 %	25 %	25 %	374314456
11	NC_016633	CGCT	2	8	5069	5076	0 %	25 %	25 %	50 %	374314456
12	NC_016633	CGAT	2	8	5138	5145	25 %	25 %	25 %	25 %	374314456
13	NC_016633	TTCC	2	8	6141	6148	0 %	50 %	0 %	50 %	374314457
14	NC_016633	TGCC	2	8	6323	6330	0 %	25 %	25 %	50 %	374314457
15	NC_016633	GAAA	2	8	6477	6484	75 %	0 %	25 %	0 %	374314457
16	NC_016633	CATC	2	8	6625	6632	25 %	25 %	0 %	50 %	374314458
17	NC_016633	GGAA	2	8	6800	6807	50 %	0 %	50 %	0 %	374314458
18	NC_016633	GTTG	2	8	7061	7068	0 %	50 %	50 %	0 %	374314458
19	NC_016633	GGAC	2	8	7480	7487	25 %	0 %	50 %	25 %	374314458
20	NC_016633	TGAT	2	8	7521	7528	25 %	50 %	25 %	0 %	374314458
21	NC_016633	GGCA	2	8	7620	7627	25 %	0 %	50 %	25 %	374314458
22	NC_016633	AGCG	2	8	7634	7641	25 %	0 %	50 %	25 %	374314458
23	NC_016633	GAAG	2	8	8166	8173	50 %	0 %	50 %	0 %	374314458
24	NC_016633	CTTT	2	8	8584	8591	0 %	75 %	0 %	25 %	374314458
25	NC_016633	GGTC	2	8	8729	8736	0 %	25 %	50 %	25 %	374314458
26	NC_016633	TTTC	2	8	9071	9078	0 %	75 %	0 %	25 %	374314458
27	NC_016633	GAAG	2	8	9164	9171	50 %	0 %	50 %	0 %	374314458
28	NC_016633	GTCG	2	8	10145	10152	0 %	25 %	50 %	25 %	374314459
29	NC_016633	CAAA	2	8	10876	10883	75 %	0 %	0 %	25 %	374314460
30	NC_016633	ATCT	2	8	11558	11565	25 %	50 %	0 %	25 %	374314460
31	NC_016633	CAGC	2	8	12469	12476	25 %	0 %	25 %	50 %	374314461
32	NC_016633	CCTG	2	8	12539	12546	0 %	25 %	25 %	50 %	374314461
33	NC_016633	GAAG	2	8	12688	12695	50 %	0 %	50 %	0 %	374314461
34	NC_016633	TTAT	2	8	14123	14130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016633	CATG	2	8	14175	14182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016633	TGGC	2	8	14999	15006	0 %	25 %	50 %	25 %	374314463
37	NC_016633	CCTT	2	8	15373	15380	0 %	50 %	0 %	50 %	374314463
38	NC_016633	TCCA	2	8	15580	15587	25 %	25 %	0 %	50 %	374314463
39	NC_016633	TGGT	2	8	16124	16131	0 %	50 %	50 %	0 %	374314464
40	NC_016633	CAGG	2	8	16315	16322	25 %	0 %	50 %	25 %	374314464
41	NC_016633	TTGC	2	8	16357	16364	0 %	50 %	25 %	25 %	374314464
42	NC_016633	TCTG	2	8	16446	16453	0 %	50 %	25 %	25 %	374314464
43	NC_016633	AGCT	2	8	16653	16660	25 %	25 %	25 %	25 %	374314464
44	NC_016633	TGCA	2	8	16672	16679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016633	TGCA	2	8	16691	16698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016633	GGAA	2	8	16923	16930	50 %	0 %	50 %	0 %	374314465
47	NC_016633	CTGC	2	8	18168	18175	0 %	25 %	25 %	50 %	374314465
48	NC_016633	GATG	2	8	18228	18235	25 %	25 %	50 %	0 %	374314465
49	NC_016633	TGCA	2	8	18799	18806	25 %	25 %	25 %	25 %	374314466
50	NC_016633	GGCA	2	8	19946	19953	25 %	0 %	50 %	25 %	374314467
51	NC_016633	TTCC	2	8	20080	20087	0 %	50 %	0 %	50 %	374314467
52	NC_016633	GGAA	2	8	20145	20152	50 %	0 %	50 %	0 %	374314467
53	NC_016633	TTCC	2	8	20325	20332	0 %	50 %	0 %	50 %	374314468
54	NC_016633	CTAT	2	8	20734	20741	25 %	50 %	0 %	25 %	374314468
55	NC_016633	GATT	2	8	20993	21000	25 %	50 %	25 %	0 %	374314468
56	NC_016633	GAAA	2	8	21192	21199	75 %	0 %	25 %	0 %	374314469
57	NC_016633	CCGT	2	8	21232	21239	0 %	25 %	25 %	50 %	374314469
58	NC_016633	CTGG	2	8	21746	21753	0 %	25 %	50 %	25 %	374314469
59	NC_016633	CTTC	2	8	21926	21933	0 %	50 %	0 %	50 %	374314469
60	NC_016633	TTCC	2	8	22497	22504	0 %	50 %	0 %	50 %	374314470
61	NC_016633	CAAG	2	8	22563	22570	50 %	0 %	25 %	25 %	374314470
62	NC_016633	CAAC	2	8	23376	23383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016633	ATCA	2	8	23699	23706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016633	TGAT	2	8	23852	23859	25 %	50 %	25 %	0 %	374314472
65	NC_016633	TTCT	2	8	24072	24079	0 %	75 %	0 %	25 %	374314472
66	NC_016633	TAGA	2	8	24118	24125	50 %	25 %	25 %	0 %	374314472
67	NC_016633	ATAA	2	8	24422	24429	75 %	25 %	0 %	0 %	374314472
68	NC_016633	TCTT	2	8	24508	24515	0 %	75 %	0 %	25 %	374314472
69	NC_016633	AATT	2	8	24829	24836	50 %	50 %	0 %	0 %	374314472
70	NC_016633	ATTG	2	8	25085	25092	25 %	50 %	25 %	0 %	374314472
71	NC_016633	AAAT	2	8	25737	25744	75 %	25 %	0 %	0 %	374314472
72	NC_016633	GATT	2	8	26013	26020	25 %	50 %	25 %	0 %	374314472
73	NC_016633	AGGG	2	8	26360	26367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016633	TCAA	2	8	26729	26736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016633	CCCA	2	8	26939	26946	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_016633	TCTT	2	8	27118	27125	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016633	TAAT	2	8	27395	27402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016633	ACTG	2	8	27616	27623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016633	AAAG	2	8	27718	27725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016633	AAGG	2	8	28179	28186	50 %	0 %	50 %	0 %	374314473
81	NC_016633	CTTC	2	8	28206	28213	0 %	50 %	0 %	50 %	374314473
82	NC_016633	CAAT	2	8	28952	28959	50 %	25 %	0 %	25 %	374314474
83	NC_016633	CATT	2	8	29963	29970	25 %	50 %	0 %	25 %	374314475
84	NC_016633	ACAA	2	8	31303	31310	75 %	0 %	0 %	25 %	374314477
85	NC_016633	TACC	2	8	31528	31535	25 %	25 %	0 %	50 %	374314477
86	NC_016633	TTCT	2	8	31922	31929	0 %	75 %	0 %	25 %	374314477
87	NC_016633	CTTC	2	8	32384	32391	0 %	50 %	0 %	50 %	374314478
88	NC_016633	AAAC	2	8	32406	32413	75 %	0 %	0 %	25 %	374314478
89	NC_016633	TTGC	2	8	34695	34702	0 %	50 %	25 %	25 %	374314480
90	NC_016633	CCTT	2	8	35027	35034	0 %	50 %	0 %	50 %	374314481
91	NC_016633	GCAG	2	8	35181	35188	25 %	0 %	50 %	25 %	374314481
92	NC_016633	TAGG	2	8	35262	35269	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016633	TCGA	2	8	35731	35738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016633	AAGG	2	8	35878	35885	50 %	0 %	50 %	0 %	374314483
95	NC_016633	TCTG	2	8	36043	36050	0 %	50 %	25 %	25 %	374314483
96	NC_016633	ACTT	2	8	36266	36273	25 %	50 %	0 %	25 %	374314483
97	NC_016633	CGCT	2	8	36496	36503	0 %	25 %	25 %	50 %	374314483
98	NC_016633	ATCC	2	8	36550	36557	25 %	25 %	0 %	50 %	374314483
99	NC_016633	CAAG	2	8	37146	37153	50 %	0 %	25 %	25 %	374314483
100	NC_016633	GTCG	2	8	37798	37805	0 %	25 %	50 %	25 %	374314483
101	NC_016633	CGAT	2	8	38106	38113	25 %	25 %	25 %	25 %	374314483
102	NC_016633	GCCG	2	8	38149	38156	0 %	0 %	50 %	50 %	374314483
103	NC_016633	GAAA	2	8	38257	38264	75 %	0 %	25 %	0 %	374314484
104	NC_016633	GAAA	2	8	38607	38614	75 %	0 %	25 %	0 %	374314484
105	NC_016633	AAGG	2	8	38713	38720	50 %	0 %	50 %	0 %	374314484
106	NC_016633	GGTC	2	8	39223	39230	0 %	25 %	50 %	25 %	374314484
107	NC_016633	TTCC	2	8	39754	39761	0 %	50 %	0 %	50 %	374314485
108	NC_016633	TTCT	2	8	39854	39861	0 %	75 %	0 %	25 %	374314485
109	NC_016633	TTTC	2	8	39872	39879	0 %	75 %	0 %	25 %	374314485
110	NC_016633	TCTA	2	8	40067	40074	25 %	50 %	0 %	25 %	374314485
111	NC_016633	TTAT	2	8	40340	40347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016633	GGTT	2	8	40434	40441	0 %	50 %	50 %	0 %	374314486
113	NC_016633	GCTT	2	8	40689	40696	0 %	50 %	25 %	25 %	374314486
114	NC_016633	GAGT	2	8	41153	41160	25 %	25 %	50 %	0 %	374314486
115	NC_016633	ATGG	2	8	41717	41724	25 %	25 %	50 %	0 %	374314487
116	NC_016633	CTTC	2	8	41959	41966	0 %	50 %	0 %	50 %	374314487
117	NC_016633	GGTT	2	8	41980	41987	0 %	50 %	50 %	0 %	374314487
118	NC_016633	CGTT	2	8	42114	42121	0 %	50 %	25 %	25 %	374314487
119	NC_016633	ATTG	2	8	42377	42384	25 %	50 %	25 %	0 %	374314487
120	NC_016633	CAAG	2	8	42508	42515	50 %	0 %	25 %	25 %	374314487
121	NC_016633	GTAG	2	8	42614	42621	25 %	25 %	50 %	0 %	374314487
122	NC_016633	GAAA	2	8	44069	44076	75 %	0 %	25 %	0 %	374314489
123	NC_016633	ACAA	2	8	44129	44136	75 %	0 %	0 %	25 %	374314489
124	NC_016633	TCCA	2	8	44236	44243	25 %	25 %	0 %	50 %	374314489
125	NC_016633	CTGG	2	8	44313	44320	0 %	25 %	50 %	25 %	374314490
126	NC_016633	TTCG	2	8	44828	44835	0 %	50 %	25 %	25 %	374314491
127	NC_016633	GGTT	2	8	44839	44846	0 %	50 %	50 %	0 %	374314491
128	NC_016633	AGCA	2	8	44928	44935	50 %	0 %	25 %	25 %	374314491
129	NC_016633	GCTG	2	8	45189	45196	0 %	25 %	50 %	25 %	374314492
130	NC_016633	TTGC	2	8	45523	45530	0 %	50 %	25 %	25 %	374314492
131	NC_016633	CTGC	2	8	45653	45660	0 %	25 %	25 %	50 %	374314492
132	NC_016633	AATA	2	8	46800	46807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016633	TTTG	2	8	46879	46886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016633	TATG	2	8	46943	46950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016633	ATCA	2	8	48124	48131	50 %	25 %	0 %	25 %	374314494
136	NC_016633	TTGT	2	8	48232	48239	0 %	75 %	25 %	0 %	374314494
137	NC_016633	ACAA	2	8	48635	48642	75 %	0 %	0 %	25 %	374314494
138	NC_016633	CCAT	2	8	48724	48731	25 %	25 %	0 %	50 %	374314494
139	NC_016633	AAGA	2	8	48757	48764	75 %	0 %	25 %	0 %	374314494
140	NC_016633	CCTG	2	8	48778	48785	0 %	25 %	25 %	50 %	374314494
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142	NC_016633	AAAC	2	8	49472	49479	75 %	0 %	0 %	25 %	374314495
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