MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphaerochaeta pleomorpha str. Grapes chromosome

Total Repeats: 1165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016633	TTTG	2	8	4416	4423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016633	TTAT	2	8	14123	14130	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016633	CATG	2	8	14175	14182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016633	TGCA	2	8	16672	16679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016633	TGCA	2	8	16691	16698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016633	CAAC	2	8	23376	23383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016633	ATCA	2	8	23699	23706	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016633	AGGG	2	8	26360	26367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016633	TCAA	2	8	26729	26736	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016633	CCCA	2	8	26939	26946	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11	NC_016633	TCTT	2	8	27118	27125	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016633	TAAT	2	8	27395	27402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016633	ACTG	2	8	27616	27623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016633	AAAG	2	8	27718	27725	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016633	TAGG	2	8	35262	35269	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016633	TCGA	2	8	35731	35738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016633	TTAT	2	8	40340	40347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016633	AATA	2	8	46800	46807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016633	TTTG	2	8	46879	46886	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016633	TATG	2	8	46943	46950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016633	GTAC	2	8	49076	49083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016633	GAAT	2	8	55717	55724	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016633	TCTT	2	8	58560	58567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016633	ACTG	2	8	62510	62517	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016633	TTCA	2	8	67961	67968	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016633	TAAG	2	8	72580	72587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016633	TGTC	2	8	80283	80290	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016633	AAAG	2	8	81263	81270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016633	CTTG	2	8	81312	81319	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016633	ATAA	2	8	89236	89243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016633	GACA	2	8	96299	96306	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016633	AGGT	2	8	102336	102343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016633	TGGG	2	8	114278	114285	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016633	ACTT	2	8	116847	116854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016633	TTCT	2	8	120112	120119	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016633	TTTA	2	8	120436	120443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016633	TAAA	2	8	126119	126126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016633	AAGG	2	8	126180	126187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016633	CAAA	2	8	126311	126318	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016633	TTTC	2	8	126323	126330	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016633	AAGG	2	8	126517	126524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016633	CAAT	2	8	132721	132728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016633	TAAA	2	8	132782	132789	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016633	GCTA	2	8	147008	147015	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016633	CTAT	2	8	147081	147088	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016633	AATG	2	8	157229	157236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016633	CAAA	2	8	157397	157404	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016633	ATAA	2	8	166757	166764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016633	TTAA	2	8	166787	166794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016633	TTCT	2	8	170742	170749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016633	TAAA	2	8	176124	176131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016633	TTGA	2	8	180681	180688	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016633	TTAG	2	8	198500	198507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016633	TTGA	2	8	198613	198620	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016633	AAAC	2	8	199650	199657	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016633	TTAA	2	8	199670	199677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016633	ACAA	2	8	199784	199791	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016633	TGAG	2	8	200977	200984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016633	AAAT	2	8	206100	206107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016633	ACTA	2	8	209317	209324	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016633	CTTT	2	8	209376	209383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016633	TTTG	2	8	227442	227449	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016633	CAAT	2	8	228813	228820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016633	GCTT	2	8	231866	231873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016633	CTAT	2	8	234825	234832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016633	CCTC	2	8	236339	236346	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_016633	AGGA	2	8	237202	237209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016633	GAAA	2	8	237821	237828	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016633	GTTC	2	8	237929	237936	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016633	CTTT	2	8	237969	237976	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016633	CTGA	2	8	238790	238797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016633	GTTG	2	8	239700	239707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016633	TGTC	2	8	239959	239966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016633	AACC	2	8	243287	243294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016633	TGGA	2	8	243393	243400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016633	ATTG	2	8	248357	248364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016633	GTAT	2	8	248401	248408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016633	CCCT	2	8	249378	249385	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_016633	TGTC	2	8	253954	253961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016633	AATG	2	8	255488	255495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016633	CCTT	2	8	255511	255518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016633	TCTT	2	8	258827	258834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016633	GAAG	2	8	258836	258843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016633	AGTA	2	8	259706	259713	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016633	AGGT	2	8	260861	260868	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016633	CCGG	2	8	261061	261068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016633	GGGT	2	8	267991	267998	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016633	TGCT	2	8	270357	270364	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016633	TTGG	2	8	274787	274794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016633	GTCG	2	8	283055	283062	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016633	GTAT	2	8	283872	283879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016633	AGTC	2	8	284109	284116	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016633	TTAC	2	8	284126	284133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016633	TTGG	2	8	284164	284171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016633	CCTG	2	8	287129	287136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016633	CTTT	2	8	287370	287377	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016633	AATC	2	8	287768	287775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016633	CTAT	2	8	291077	291084	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016633	ATGC	2	8	292955	292962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016633	TACG	2	8	293342	293349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016633	TTGA	2	8	295194	295201	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016633	TGAA	2	8	295278	295285	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016633	TGAA	2	8	298936	298943	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016633	ATTA	2	8	300198	300205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016633	CCTT	2	8	302365	302372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016633	ATGT	2	8	303817	303824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016633	AACA	2	8	304639	304646	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016633	CAAA	2	8	312757	312764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016633	CAGA	2	8	313987	313994	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016633	CTTG	2	8	314076	314083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016633	AGTC	2	8	314116	314123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016633	TCAA	2	8	314130	314137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016633	CTTC	2	8	314222	314229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016633	ATGC	2	8	316673	316680	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016633	TATT	2	8	317261	317268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016633	GAAA	2	8	320883	320890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016633	GAAT	2	8	331716	331723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016633	AAGC	2	8	337141	337148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016633	TATG	2	8	337258	337265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016633	TGAA	2	8	339389	339396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016633	TTAT	2	8	346117	346124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016633	CAAG	2	8	346176	346183	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016633	TGTT	2	8	362837	362844	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016633	AAAC	2	8	383702	383709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016633	ATTG	2	8	387165	387172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016633	GCCG	2	8	387176	387183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016633	CGGT	2	8	387193	387200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016633	AAGG	2	8	394028	394035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016633	CATA	2	8	397538	397545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016633	TTTC	2	8	414141	414148	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016633	TTGC	2	8	415156	415163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016633	TTTC	2	8	419280	419287	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016633	GAAA	2	8	420574	420581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016633	TACT	2	8	425155	425162	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016633	AGTA	2	8	425170	425177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016633	ATTT	2	8	425269	425276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016633	TTTA	2	8	425534	425541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016633	TTTC	2	8	425590	425597	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016633	GAAA	2	8	425932	425939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016633	CAAC	2	8	425946	425953	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016633	ACAA	2	8	425979	425986	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016633	CTTT	2	8	445619	445626	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016633	AGCA	2	8	445674	445681	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016633	AAAG	2	8	453134	453141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016633	CCTT	2	8	472623	472630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016633	TGTT	2	8	472659	472666	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016633	CTTC	2	8	486336	486343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016633	GCAA	2	8	487147	487154	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016633	TATC	2	8	490385	490392	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016633	ATTG	2	8	501695	501702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016633	ACAG	2	8	501746	501753	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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476	NC_016633	TCAT	2	8	1509812	1509819	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_016633	TTAC	2	8	1522502	1522509	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_016633	AAAG	2	8	1522611	1522618	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_016633	CATG	2	8	1538647	1538654	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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486	NC_016633	GTAG	2	8	1553828	1553835	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
487	NC_016633	CTGA	2	8	1553924	1553931	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_016633	ATTA	2	8	1557186	1557193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_016633	ATTT	2	8	1557252	1557259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_016633	CATT	2	8	1595343	1595350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
498	NC_016633	TCAA	2	8	1595406	1595413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_016633	CAAA	2	8	1595439	1595446	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
500	NC_016633	CTTT	2	8	1598483	1598490	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

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