MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Filifactor alocis ATCC 35896 chromosome

Total Repeats: 733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016630	CATTGA	2	12	3389	3400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307322
2	NC_016630	GCAGGA	2	12	3823	3834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	374307322
3	NC_016630	TGTGAC	2	12	9398	9409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374307324
4	NC_016630	CGGAAT	2	12	11581	11592	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307326
5	NC_016630	CCGATG	2	12	19602	19613	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374307331
6	NC_016630	GAAAAA	2	12	21337	21348	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307332
7	NC_016630	ATGAAA	2	12	23132	23143	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307334
8	NC_016630	TATCAT	2	12	27640	27651	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374307340
9	NC_016630	CCTTCC	2	12	30864	30875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374307342
10	NC_016630	GTTGAT	2	12	34876	34887	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374307344
11	NC_016630	GTTTTT	2	12	35326	35337	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	374307344
12	NC_016630	TGGAAA	2	12	35790	35801	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307345
13	NC_016630	TCATAT	2	12	39196	39207	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374307347
14	NC_016630	GACAGT	2	12	45536	45547	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307353
15	NC_016630	TCATAA	2	12	47472	47483	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307355
16	NC_016630	TTGACA	2	12	49510	49521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307358
17	NC_016630	TTGGAA	2	12	51498	51509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307360
18	NC_016630	TCAAAA	2	12	53961	53972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374307362
19	NC_016630	AGGTTG	2	12	54402	54413	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	374307362
20	NC_016630	TTACAA	2	12	59468	59479	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307366
21	NC_016630	ATGAAT	2	12	61268	61279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307369
22	NC_016630	GATAGA	2	12	63327	63338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307371
23	NC_016630	AAAGGA	2	12	63581	63592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374307372
24	NC_016630	TATTTT	2	12	63662	63673	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374307372
25	NC_016630	ATCAGA	2	12	68685	68696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	374307376
26	NC_016630	TGGCAA	2	12	72974	72985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307377
27	NC_016630	TTGACA	2	12	75030	75041	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307378
28	NC_016630	TTGACA	2	12	76669	76680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307380
29	NC_016630	TTTGTT	2	12	76837	76848	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	374307380
30	NC_016630	GGAAAT	2	12	77894	77905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307381
31	NC_016630	GCTATT	2	12	80201	80212	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307382
32	NC_016630	GGATTT	2	12	81902	81913	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374307384
33	NC_016630	TCGAGA	2	12	85722	85733	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307386
34	NC_016630	CCTATG	2	12	86989	87000	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374307388
35	NC_016630	CGGAAA	2	12	91344	91355	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	374307391
36	NC_016630	TATCAA	2	12	93529	93540	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307394
37	NC_016630	TAAAAG	2	12	94766	94777	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307394
38	NC_016630	GATAGG	2	12	97688	97699	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	374307398
39	NC_016630	ATAGGA	2	12	98472	98483	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307398
40	NC_016630	TAAAAG	2	12	103144	103155	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307403
41	NC_016630	TTTTTG	2	12	112399	112410	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	374307411
42	NC_016630	GATTTT	2	12	112452	112463	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374307411
43	NC_016630	CCATAA	2	12	115913	115924	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374307413
44	NC_016630	TATGAC	2	12	121294	121305	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307417
45	NC_016630	CTTTGA	2	12	123209	123220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307419
46	NC_016630	TTGAAT	2	12	126800	126811	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374307422
47	NC_016630	TGATAA	2	12	135167	135178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307430
48	NC_016630	TTTCTG	2	12	135961	135972	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	374307431
49	NC_016630	AATGAA	2	12	138835	138846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307435
50	NC_016630	CTCATA	2	12	139026	139037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374307435
51	NC_016630	ATTCAT	2	12	139454	139465	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374307435
52	NC_016630	GCTATT	2	12	141950	141961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307438
53	NC_016630	TGCAAG	2	12	151750	151761	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307447
54	NC_016630	ATCGGA	2	12	154993	155004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307451
55	NC_016630	GTTCCG	2	12	155629	155640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374307451
56	NC_016630	AGATGT	2	12	157001	157012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307452
57	NC_016630	ATATCG	2	12	158158	158169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307454
58	NC_016630	GAAAAA	2	12	158816	158827	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307454
59	NC_016630	AAAGTA	2	12	161602	161613	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307455
60	NC_016630	AGAATT	2	12	168374	168385	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307460
61	NC_016630	GAAAAA	2	12	175040	175051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307466
62	NC_016630	ATTTTT	2	12	176264	176275	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374307468
63	NC_016630	AAAGAA	2	12	176306	176317	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307468
64	NC_016630	GATGTA	2	12	178857	178868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307470
65	NC_016630	TAGAAG	2	12	181894	181905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307472
66	NC_016630	TTAAAA	2	12	184235	184246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374307474
67	NC_016630	ATTTTA	2	12	189867	189878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374307476
68	NC_016630	ATATGA	2	12	193703	193714	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307478
69	NC_016630	ATGGAT	2	12	194195	194206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307479
70	NC_016630	TGAAGA	2	12	196408	196419	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307480
71	NC_016630	TTGAAA	2	12	197895	197906	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307482
72	NC_016630	ATGAGT	2	12	201345	201356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307485
73	NC_016630	TGTATT	2	12	201907	201918	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374307485
74	NC_016630	ATTTGG	2	12	205366	205377	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374307489
75	NC_016630	TGAAAT	2	12	216329	216340	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307499
76	NC_016630	TGAATA	2	12	223119	223130	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307505
77	NC_016630	GTACTT	2	12	223704	223715	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307505
78	NC_016630	TGAAAT	2	12	227562	227573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307508
79	NC_016630	TAAAAA	2	12	227732	227743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	374307509
80	NC_016630	GGAAGA	2	12	228219	228230	50 %	0 %	50 %	0 %	374307509
81	NC_016630	TTTTGA	2	12	230722	230733	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374307512
82	NC_016630	GTAGAA	2	12	232529	232540	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374307514
83	NC_016630	GGAAAA	2	12	235664	235675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374307518
84	NC_016630	TTATTT	2	12	235971	235982	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	374307519
85	NC_016630	TTTGAA	2	12	236046	236057	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374307519
86	NC_016630	AAATTG	2	12	238463	238474	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	374307522
87	NC_016630	TAGAGT	2	12	241051	241062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374307524
88	NC_016630	TTCATT	2	12	244827	244838	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374307528
89	NC_016630	TTGGAT	2	12	245341	245352	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	374307528
90	NC_016630	CTTACG	2	12	247638	247649	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374307531
91	NC_016630	GAAAAA	2	12	250328	250339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307532
92	NC_016630	GAACAA	2	12	251571	251582	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374307533
93	NC_016630	CAAAGA	2	12	253589	253600	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	374307534
94	NC_016630	AGAAAA	2	12	256071	256082	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307537
95	NC_016630	TATTGT	2	12	256442	256453	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374307537
96	NC_016630	ATTCGG	2	12	258854	258865	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374307539
97	NC_016630	AAATTC	2	12	264778	264789	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307543
98	NC_016630	GTAAAA	2	12	270067	270078	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307547
99	NC_016630	ATATCA	2	12	270209	270220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307547
100	NC_016630	GAAAAA	2	12	271369	271380	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307547
101	NC_016630	AAGTAA	2	12	273350	273361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307548
102	NC_016630	AATTTG	2	12	275537	275548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374307550
103	NC_016630	AAAAGA	2	12	276690	276701	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307552
104	NC_016630	TCGCTT	2	12	278227	278238	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374307553
105	NC_016630	AAGATA	2	12	279208	279219	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374307555
106	NC_016630	TATCCA	2	12	287270	287281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374307563
107	NC_016630	TACAAT	2	12	288630	288641	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	374307564
108	NC_016630	ATACCT	2	12	291862	291873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374307565
109	NC_016630	TAACGT	2	12	293403	293414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374307566
110	NC_016630	TTTTAC	2	12	293574	293585	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	374307566
111	NC_016630	CCATCG	2	12	294280	294291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374307567
112	NC_016630	TCCTGT	2	12	296871	296882	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374307568
113	NC_016630	ATAACA	2	12	300935	300946	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374307571
114	NC_016630	CTAAAA	2	12	308785	308796	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374307580
115	NC_016630	AAGAAA	2	12	308908	308919	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	374307580
116	NC_016630	TTTTCT	2	12	308934	308945	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374307580
117	NC_016630	TTTAAG	2	12	310123	310134	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374307581
118	NC_016630	CATTTA	2	12	311556	311567	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374307582
119	NC_016630	TTCATA	2	12	314864	314875	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374307586
120	NC_016630	TTTGAT	2	12	318005	318016	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	374307588
121	NC_016630	TCCTTT	2	12	324818	324829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374307596
122	NC_016630	TTTCTT	2	12	334167	334178	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374307603
123	NC_016630	TTTTTC	2	12	334363	334374	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	374307603
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229	NC_016630	CAGATG	2	12	577297	577308	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307824
230	NC_016630	AATACA	2	12	578743	578754	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374307825
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232	NC_016630	TACGGA	2	12	585839	585850	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	374307831
233	NC_016630	TCCTTT	2	12	589423	589434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374307834
234	NC_016630	TTCCAA	2	12	593558	593569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374307835
235	NC_016630	TCGATT	2	12	596319	596330	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	374307838
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347	NC_016630	ACTCCG	2	12	862141	862152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374308046
348	NC_016630	CTCCTT	2	12	865299	865310	0 %	50 %	0 %	50 %	374308048
349	NC_016630	CAAAAA	2	12	866161	866172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	374308048
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460	NC_016630	AAGTAA	2	12	1168000	1168011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	374308270
461	NC_016630	AGATAG	2	12	1169067	1169078	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	374308271
462	NC_016630	GCTCTT	2	12	1174844	1174855	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374308276
463	NC_016630	TACATT	2	12	1176318	1176329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	374308277
464	NC_016630	AATCAC	2	12	1178385	1178396	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	374308279
465	NC_016630	GAACTT	2	12	1179050	1179061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	374308279
466	NC_016630	CAAAAT	2	12	1182289	1182300	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	374308280
467	NC_016630	GATATT	2	12	1184635	1184646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	374308282
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489	NC_016630	AATATA	2	12	1231343	1231354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374308323
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