MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Filifactor alocis ATCC 35896 chromosome

Total Repeats: 493

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016630	TGATT	2	10	1570	1579	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016630	ATTTT	2	10	1586	1595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016630	TTTGA	2	10	3997	4006	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016630	ATGAG	2	10	10054	10063	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016630	ATAAA	2	10	15189	15198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016630	TGAAA	2	10	16412	16421	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016630	AGTTC	2	10	16738	16747	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016630	GAAAC	2	10	16772	16781	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016630	ACGGA	2	10	22635	22644	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016630	TTGAT	2	10	23288	23297	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016630	ATGGA	2	10	28131	28140	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016630	AAAAC	2	10	28193	28202	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016630	GTTGT	2	10	30311	30320	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016630	TTCAT	2	10	30466	30475	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016630	ATTGC	2	10	31857	31866	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016630	AGAAA	2	10	32805	32814	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016630	TTCTC	2	10	52081	52090	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016630	CAAAT	2	10	57278	57287	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016630	TAATA	2	10	66375	66384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016630	TTCAA	2	10	66471	66480	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016630	GGAAT	2	10	79685	79694	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016630	GATAT	2	10	81365	81374	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016630	AATAG	2	10	85016	85025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016630	ATCAA	2	10	88305	88314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016630	ATAAA	2	10	99526	99535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016630	TGTAT	2	10	100788	100797	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016630	AAAAG	2	10	101024	101033	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016630	TAAAA	2	10	104935	104944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016630	AACAA	2	10	108682	108691	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016630	ATAGA	2	10	108715	108724	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016630	TGAAA	2	10	125709	125718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016630	AAAAT	2	10	128830	128839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016630	TAAAA	2	10	147067	147076	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016630	AAGAA	2	10	147930	147939	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016630	TAGTA	2	10	156168	156177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016630	AATGT	2	10	165937	165946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016630	ATATC	2	10	168038	168047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016630	GATAA	2	10	175257	175266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016630	AAGGA	2	10	185770	185779	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016630	TTTTA	2	10	185796	185805	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016630	TAATG	2	10	200716	200725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016630	ATCAT	2	10	236605	236614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016630	GAATT	2	10	239331	239340	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016630	TTAAA	2	10	242223	242232	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016630	GAAAG	2	10	242381	242390	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016630	ATATA	2	10	246609	246618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016630	AATTA	2	10	255122	255131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016630	AGAAA	2	10	275771	275780	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016630	ATTTT	2	10	275783	275792	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016630	TAATG	2	10	278517	278526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016630	TCATT	2	10	295411	295420	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016630	CCATC	2	10	299962	299971	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016630	ATCTT	2	10	313595	313604	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016630	ATTAA	2	10	331735	331744	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016630	CCAAT	2	10	332564	332573	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016630	TTCAT	2	10	333998	334007	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016630	CCCTC	2	10	341808	341817	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
58	NC_016630	CCTTT	2	10	379287	379296	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016630	AAAAT	2	10	379411	379420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016630	AATAA	2	10	386001	386010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016630	ATTTT	2	10	388503	388512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016630	TTAAT	2	10	398165	398174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016630	CCTTA	2	10	399342	399351	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016630	ATTTC	2	10	406467	406476	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016630	ATAGT	2	10	413140	413149	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016630	TTTGA	2	10	423380	423389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016630	GAAAA	2	10	431485	431494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016630	ATTGT	2	10	438955	438964	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016630	GATAT	2	10	452511	452520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016630	ATATC	2	10	452540	452549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016630	TATCT	2	10	456195	456204	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016630	AAGTA	2	10	459768	459777	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016630	ATTTG	2	10	460519	460528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016630	AATCG	2	10	463604	463613	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016630	ATGAA	2	10	463946	463955	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016630	TTGTA	2	10	465855	465864	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016630	ATTTT	2	10	466161	466170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016630	CTGAA	2	10	471896	471905	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016630	TACAC	2	10	480001	480010	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016630	TGAGT	2	10	480506	480515	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016630	TTTAT	2	10	482697	482706	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016630	CTTTA	2	10	483093	483102	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016630	TATAA	2	10	491969	491978	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016630	TTTTA	2	10	492071	492080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016630	ATTTT	2	10	544450	544459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016630	TTATA	2	10	546514	546523	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016630	ATTTT	2	10	571150	571159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016630	ACTTT	2	10	575357	575366	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016630	ATAAA	2	10	576358	576367	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016630	TCACT	2	10	584706	584715	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016630	TTAAT	2	10	586415	586424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016630	GAATT	2	10	596211	596220	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016630	AAATA	2	10	600255	600264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016630	TAAAA	2	10	600364	600373	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016630	CTTAA	2	10	600452	600461	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016630	TAATA	2	10	611263	611272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016630	ACAAT	2	10	623519	623528	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016630	ATTTA	2	10	627614	627623	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016630	TTCTT	2	10	631171	631180	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016630	CTATT	2	10	631300	631309	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016630	CTCTT	2	10	633479	633488	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016630	GTTTT	2	10	648638	648647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016630	GATAT	2	10	648670	648679	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016630	ATCAT	2	10	651496	651505	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016630	ATTTT	2	10	651592	651601	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016630	AAAAT	2	10	668966	668975	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016630	CAATA	2	10	669005	669014	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016630	ATTTT	2	10	672417	672426	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016630	CTCTT	2	10	674053	674062	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016630	AGTAA	2	10	681968	681977	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016630	TGATA	2	10	686310	686319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016630	TAAAT	2	10	697567	697576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016630	CTTCT	2	10	699790	699799	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016630	GTAAT	2	10	705332	705341	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016630	TATTT	2	10	714533	714542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016630	TTCAC	2	10	714810	714819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016630	AAATT	2	10	714854	714863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016630	ATTAA	2	10	715673	715682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016630	TTCTT	2	10	715844	715853	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016630	ATCTT	2	10	716269	716278	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016630	CTCCC	2	10	718528	718537	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
122	NC_016630	TTCCC	2	10	718877	718886	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_016630	TTTCT	2	10	719657	719666	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016630	CACGA	2	10	720135	720144	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016630	TACTG	2	10	724327	724336	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016630	AATAA	2	10	726274	726283	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016630	TTGTT	2	10	735837	735846	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016630	ACTAT	2	10	735978	735987	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016630	ATTTG	2	10	745747	745756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016630	AAGAC	2	10	751588	751597	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016630	TGCAT	2	10	755359	755368	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016630	AAACC	2	10	758343	758352	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016630	ATCTT	2	10	761501	761510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016630	CTCCC	2	10	763760	763769	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
135	NC_016630	TTCCC	2	10	764109	764118	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_016630	TTTCT	2	10	764872	764881	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016630	CACGA	2	10	765350	765359	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016630	TTCTT	2	10	766779	766788	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016630	ATAGA	2	10	766944	766953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016630	TTCAT	2	10	767953	767962	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016630	TCATA	2	10	772185	772194	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016630	GAATT	2	10	776988	776997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016630	TACTA	2	10	781656	781665	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016630	AAGAT	2	10	782567	782576	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016630	ATTTT	2	10	788477	788486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016630	ACAAA	2	10	789085	789094	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016630	TATCA	2	10	792660	792669	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_016630	TATAA	2	10	795580	795589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016630	ATTTT	2	10	795774	795783	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016630	TATCC	2	10	797905	797914	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_016630	GTCTT	2	10	798239	798248	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_016630	GCCTT	2	10	798519	798528	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_016630	ATTAT	2	10	802072	802081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016630	ACAAA	2	10	803601	803610	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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156	NC_016630	TGATA	2	10	806350	806359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016630	TCAAA	2	10	816219	816228	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_016630	TTTTA	2	10	820363	820372	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_016630	TATAA	2	10	821799	821808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016630	TCATT	2	10	824143	824152	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_016630	CTTTT	2	10	828510	828519	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_016630	TAATA	2	10	845634	845643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016630	TACAA	2	10	855242	855251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_016630	TCAAT	2	10	860054	860063	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_016630	TCAAG	2	10	896189	896198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_016630	CTGCA	2	10	900472	900481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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174	NC_016630	AATAA	2	10	904189	904198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_016630	ATCTT	2	10	920807	920816	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_016630	TTCCC	2	10	923415	923424	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
185	NC_016630	TTTCT	2	10	924178	924187	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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187	NC_016630	TTCTT	2	10	926085	926094	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_016630	ATAAA	2	10	927344	927353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_016630	GTATT	2	10	947852	947861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_016630	ATTCT	2	10	970846	970855	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_016630	ATTCA	2	10	971225	971234	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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253	NC_016630	ATCTT	2	10	1141189	1141198	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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285	NC_016630	ATTAT	2	10	1234629	1234638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016630	TGAAA	2	10	1237683	1237692	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016630	TTGAT	2	10	1238863	1238872	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016630	ATTTA	2	10	1250995	1251004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_016630	TTCAT	2	10	1829220	1829229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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471	NC_016630	ATTTT	2	10	1845814	1845823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_016630	GATTG	2	10	1848852	1848861	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_016630	TGTTT	2	10	1863119	1863128	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
475	NC_016630	CAAAA	2	10	1865324	1865333	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
476	NC_016630	TATTT	2	10	1878009	1878018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_016630	AACCA	2	10	1880268	1880277	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
478	NC_016630	ACAAA	2	10	1884075	1884084	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
479	NC_016630	ACAAA	2	10	1884962	1884971	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
480	NC_016630	GATAC	2	10	1888395	1888404	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
481	NC_016630	GGAAT	2	10	1888543	1888552	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_016630	AATAA	2	10	1899235	1899244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
485	NC_016630	ATACT	2	10	1899963	1899972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
486	NC_016630	GTTTT	2	10	1904726	1904735	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_016630	AAAAC	2	10	1916501	1916510	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
489	NC_016630	TTTTA	2	10	1916909	1916918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_016630	CTCTT	2	10	1918709	1918718	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
491	NC_016630	AAATG	2	10	1918722	1918731	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
492	NC_016630	TAATA	2	10	1927960	1927969	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.