MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 2540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016629	CCAAG	2	10	465	474	40 %	0 %	20 %	40 %	374298387
2	NC_016629	CAGGA	2	10	725	734	40 %	0 %	40 %	20 %	374298387
3	NC_016629	GGCGC	2	10	2641	2650	0 %	0 %	60 %	40 %	374298388
4	NC_016629	CGCAG	2	10	2822	2831	20 %	0 %	40 %	40 %	374298389
5	NC_016629	GCCGC	2	10	5388	5397	0 %	0 %	40 %	60 %	374298392
6	NC_016629	ACGCC	2	10	8591	8600	20 %	0 %	20 %	60 %	374298395
7	NC_016629	TCTCC	2	10	9364	9373	0 %	40 %	0 %	60 %	374298396
8	NC_016629	CCAGC	2	10	9391	9400	20 %	0 %	20 %	60 %	374298396
9	NC_016629	GCCTG	2	10	10777	10786	0 %	20 %	40 %	40 %	374298397
10	NC_016629	GCGCA	2	10	10879	10888	20 %	0 %	40 %	40 %	374298398
11	NC_016629	GCTCT	2	10	11081	11090	0 %	40 %	20 %	40 %	374298398
12	NC_016629	TGCCG	2	10	11854	11863	0 %	20 %	40 %	40 %	374298398
13	NC_016629	CCTTG	2	10	12345	12354	0 %	40 %	20 %	40 %	374298399
14	NC_016629	CGCAC	2	10	20394	20403	20 %	0 %	20 %	60 %	374298407
15	NC_016629	CCGGG	2	10	27744	27753	0 %	0 %	60 %	40 %	374298413
16	NC_016629	GCAGC	2	10	37644	37653	20 %	0 %	40 %	40 %	374298423
17	NC_016629	CCTCG	2	10	39497	39506	0 %	20 %	20 %	60 %	374298425
18	NC_016629	TCAAG	2	10	39986	39995	40 %	20 %	20 %	20 %	374298425
19	NC_016629	AGCGG	2	10	40990	40999	20 %	0 %	60 %	20 %	374298426
20	NC_016629	GCGCC	2	10	41081	41090	0 %	0 %	40 %	60 %	374298426
21	NC_016629	AGGGG	2	10	41911	41920	20 %	0 %	80 %	0 %	374298426
22	NC_016629	CCTGC	2	10	42322	42331	0 %	20 %	20 %	60 %	374298427
23	NC_016629	CCGGC	2	10	44419	44428	0 %	0 %	40 %	60 %	374298429
24	NC_016629	CATCG	2	10	49447	49456	20 %	20 %	20 %	40 %	374298434
25	NC_016629	GCCTT	2	10	49937	49946	0 %	40 %	20 %	40 %	374298435
26	NC_016629	TTCGC	2	10	50702	50711	0 %	40 %	20 %	40 %	374298435
27	NC_016629	GCGTA	2	10	51364	51373	20 %	20 %	40 %	20 %	374298437
28	NC_016629	ACTCG	2	10	51788	51797	20 %	20 %	20 %	40 %	374298437
29	NC_016629	AGCGC	2	10	52784	52793	20 %	0 %	40 %	40 %	374298438
30	NC_016629	CCACT	2	10	57134	57143	20 %	20 %	0 %	60 %	374298442
31	NC_016629	GCCAA	2	10	59883	59892	40 %	0 %	20 %	40 %	374298447
32	NC_016629	TTTGG	2	10	61292	61301	0 %	60 %	40 %	0 %	374298448
33	NC_016629	CGCAA	2	10	62911	62920	40 %	0 %	20 %	40 %	374298450
34	NC_016629	ACCCG	2	10	63350	63359	20 %	0 %	20 %	60 %	374298450
35	NC_016629	CCTGG	2	10	64678	64687	0 %	20 %	40 %	40 %	374298450
36	NC_016629	ACCCG	2	10	64827	64836	20 %	0 %	20 %	60 %	374298450
37	NC_016629	GAATC	2	10	67482	67491	40 %	20 %	20 %	20 %	374298452
38	NC_016629	ATGCA	2	10	67619	67628	40 %	20 %	20 %	20 %	374298452
39	NC_016629	CGCAG	2	10	68644	68653	20 %	0 %	40 %	40 %	374298453
40	NC_016629	AGAGT	2	10	69827	69836	40 %	20 %	40 %	0 %	374298454
41	NC_016629	CTCTC	2	10	71625	71634	0 %	40 %	0 %	60 %	374298455
42	NC_016629	GGCAT	2	10	76947	76956	20 %	20 %	40 %	20 %	374298458
43	NC_016629	TTCAT	2	10	80311	80320	20 %	60 %	0 %	20 %	374298460
44	NC_016629	TCAAT	2	10	80435	80444	40 %	40 %	0 %	20 %	374298460
45	NC_016629	CGGCG	2	10	86512	86521	0 %	0 %	60 %	40 %	374298466
46	NC_016629	CGAGG	2	10	86770	86779	20 %	0 %	60 %	20 %	374298466
47	NC_016629	CGGCT	2	10	88862	88871	0 %	20 %	40 %	40 %	374298468
48	NC_016629	GGCTT	2	10	90364	90373	0 %	40 %	40 %	20 %	374298469
49	NC_016629	CTGCT	2	10	91419	91428	0 %	40 %	20 %	40 %	374298469
50	NC_016629	TGGAC	2	10	95581	95590	20 %	20 %	40 %	20 %	374298472
51	NC_016629	CGGCA	2	10	98110	98119	20 %	0 %	40 %	40 %	374298474
52	NC_016629	CCTTC	2	10	100177	100186	0 %	40 %	0 %	60 %	374298475
53	NC_016629	GAAAC	2	10	100869	100878	60 %	0 %	20 %	20 %	374298475
54	NC_016629	GGCCG	2	10	101192	101201	0 %	0 %	60 %	40 %	374298475
55	NC_016629	CGCAT	2	10	103317	103326	20 %	20 %	20 %	40 %	374298476
56	NC_016629	CGGGA	2	10	105100	105109	20 %	0 %	60 %	20 %	374298478
57	NC_016629	CGCGG	2	10	109474	109483	0 %	0 %	60 %	40 %	374298482
58	NC_016629	CCACG	2	10	112514	112523	20 %	0 %	20 %	60 %	374298484
59	NC_016629	TCCAC	2	10	112813	112822	20 %	20 %	0 %	60 %	374298484
60	NC_016629	GCTGG	2	10	114965	114974	0 %	20 %	60 %	20 %	374298487
61	NC_016629	CTGGA	2	10	115929	115938	20 %	20 %	40 %	20 %	374298488
62	NC_016629	GCCCT	2	10	116042	116051	0 %	20 %	20 %	60 %	374298488
63	NC_016629	CCGGC	2	10	116079	116088	0 %	0 %	40 %	60 %	374298488
64	NC_016629	CCATG	2	10	116380	116389	20 %	20 %	20 %	40 %	374298488
65	NC_016629	CAGAC	2	10	117709	117718	40 %	0 %	20 %	40 %	374298488
66	NC_016629	TGCCT	2	10	120522	120531	0 %	40 %	20 %	40 %	374298490
67	NC_016629	TTGCA	2	10	120844	120853	20 %	40 %	20 %	20 %	374298490
68	NC_016629	CGGGC	2	10	122048	122057	0 %	0 %	60 %	40 %	374298491
69	NC_016629	GTCCC	2	10	122677	122686	0 %	20 %	20 %	60 %	374298491
70	NC_016629	GACTC	2	10	122889	122898	20 %	20 %	20 %	40 %	374298492
71	NC_016629	AGGCC	2	10	123651	123660	20 %	0 %	40 %	40 %	374298493
72	NC_016629	GGATG	2	10	124182	124191	20 %	20 %	60 %	0 %	374298493
73	NC_016629	ACGGC	2	10	127594	127603	20 %	0 %	40 %	40 %	374298494
74	NC_016629	CAGGA	2	10	127687	127696	40 %	0 %	40 %	20 %	374298494
75	NC_016629	TTCAG	2	10	129039	129048	20 %	40 %	20 %	20 %	374298496
76	NC_016629	GCGCA	2	10	129375	129384	20 %	0 %	40 %	40 %	374298496
77	NC_016629	TTTTG	2	10	131565	131574	0 %	80 %	20 %	0 %	374298498
78	NC_016629	GCCGC	3	15	131642	131656	0 %	0 %	40 %	60 %	374298498
79	NC_016629	GGTCT	2	10	133697	133706	0 %	40 %	40 %	20 %	374298500
80	NC_016629	TCGGC	2	10	134703	134712	0 %	20 %	40 %	40 %	374298500
81	NC_016629	GCCAG	2	10	135715	135724	20 %	0 %	40 %	40 %	374298501
82	NC_016629	ACGCC	2	10	136468	136477	20 %	0 %	20 %	60 %	374298502
83	NC_016629	GCCAA	2	10	139751	139760	40 %	0 %	20 %	40 %	374298507
84	NC_016629	CGCGC	2	10	140126	140135	0 %	0 %	40 %	60 %	374298508
85	NC_016629	GGTCT	2	10	140881	140890	0 %	40 %	40 %	20 %	374298509
86	NC_016629	GGCCA	2	10	140983	140992	20 %	0 %	40 %	40 %	374298509
87	NC_016629	GCCTG	2	10	141497	141506	0 %	20 %	40 %	40 %	374298509
88	NC_016629	ATCGC	2	10	143368	143377	20 %	20 %	20 %	40 %	374298511
89	NC_016629	GCCAC	2	10	144413	144422	20 %	0 %	20 %	60 %	374298512
90	NC_016629	GCCGA	2	10	146297	146306	20 %	0 %	40 %	40 %	374298515
91	NC_016629	GGCTG	2	10	147576	147585	0 %	20 %	60 %	20 %	374298517
92	NC_016629	GCACG	2	10	147670	147679	20 %	0 %	40 %	40 %	374298517
93	NC_016629	TCAGC	2	10	151846	151855	20 %	20 %	20 %	40 %	374298521
94	NC_016629	CAGAA	2	10	152636	152645	60 %	0 %	20 %	20 %	374298522
95	NC_016629	GCAGT	2	10	154681	154690	20 %	20 %	40 %	20 %	374298523
96	NC_016629	GCCCG	2	10	155395	155404	0 %	0 %	40 %	60 %	374298524
97	NC_016629	GCCGT	2	10	157153	157162	0 %	20 %	40 %	40 %	374298525
98	NC_016629	CTGGT	2	10	157309	157318	0 %	40 %	40 %	20 %	374298525
99	NC_016629	CCACG	2	10	160587	160596	20 %	0 %	20 %	60 %	374298528
100	NC_016629	CCGAT	2	10	160961	160970	20 %	20 %	20 %	40 %	374298529
101	NC_016629	CGGCC	2	10	161411	161420	0 %	0 %	40 %	60 %	374298529
102	NC_016629	GTTCC	2	10	165031	165040	0 %	40 %	20 %	40 %	374298533
103	NC_016629	CTGGG	2	10	167041	167050	0 %	20 %	60 %	20 %	374298535
104	NC_016629	CGGCG	2	10	167097	167106	0 %	0 %	60 %	40 %	374298535
105	NC_016629	CCCGG	2	10	167793	167802	0 %	0 %	40 %	60 %	374298535
106	NC_016629	GACCA	2	10	175961	175970	40 %	0 %	20 %	40 %	374298541
107	NC_016629	GCAAG	2	10	178003	178012	40 %	0 %	40 %	20 %	374298545
108	NC_016629	GCCCA	2	10	178349	178358	20 %	0 %	20 %	60 %	374298545
109	NC_016629	GCGAC	2	10	178512	178521	20 %	0 %	40 %	40 %	374298545
110	NC_016629	CTGGC	2	10	179925	179934	0 %	20 %	40 %	40 %	374298545
111	NC_016629	AAGGC	2	10	180769	180778	40 %	0 %	40 %	20 %	374298546
112	NC_016629	CTCGG	2	10	181425	181434	0 %	20 %	40 %	40 %	374298546
113	NC_016629	AATGA	2	10	181476	181485	60 %	20 %	20 %	0 %	374298546
114	NC_016629	TCCGC	2	10	187367	187376	0 %	20 %	20 %	60 %	374298550
115	NC_016629	GACAG	2	10	196848	196857	40 %	0 %	40 %	20 %	374298562
116	NC_016629	ACTCC	2	10	200310	200319	20 %	20 %	0 %	60 %	374298564
117	NC_016629	CTGCA	2	10	200718	200727	20 %	20 %	20 %	40 %	374298565
118	NC_016629	TTGCC	2	10	202947	202956	0 %	40 %	20 %	40 %	374298567
119	NC_016629	GCGCC	2	10	203067	203076	0 %	0 %	40 %	60 %	374298567
120	NC_016629	CCCTG	2	10	203662	203671	0 %	20 %	20 %	60 %	374298568
121	NC_016629	CGGCG	2	10	205569	205578	0 %	0 %	60 %	40 %	374298569
122	NC_016629	TCACG	2	10	206809	206818	20 %	20 %	20 %	40 %	374298570
123	NC_016629	GGCCT	2	10	209544	209553	0 %	20 %	40 %	40 %	374298572
124	NC_016629	CGGCT	2	10	210032	210041	0 %	20 %	40 %	40 %	374298572
125	NC_016629	GCAAG	2	10	211874	211883	40 %	0 %	40 %	20 %	374298573
126	NC_016629	GCCGG	2	10	211970	211979	0 %	0 %	60 %	40 %	374298573
127	NC_016629	TACGC	2	10	212267	212276	20 %	20 %	20 %	40 %	374298573
128	NC_016629	GGCCG	2	10	212622	212631	0 %	0 %	60 %	40 %	374298574
129	NC_016629	TCCGG	2	10	212804	212813	0 %	20 %	40 %	40 %	374298574
130	NC_016629	GCTGC	2	10	218252	218261	0 %	20 %	40 %	40 %	374298580
131	NC_016629	CCTGG	2	10	219632	219641	0 %	20 %	40 %	40 %	374298582
132	NC_016629	CACGG	2	10	221862	221871	20 %	0 %	40 %	40 %	374298585
133	NC_016629	GCCGA	2	10	222015	222024	20 %	0 %	40 %	40 %	374298585
134	NC_016629	ATCTC	2	10	222217	222226	20 %	40 %	0 %	40 %	374298586
135	NC_016629	GCCGA	2	10	226576	226585	20 %	0 %	40 %	40 %	374298589
136	NC_016629	GGGCC	2	10	227940	227949	0 %	0 %	60 %	40 %	374298589
137	NC_016629	TGGCT	2	10	233885	233894	0 %	40 %	40 %	20 %	374298595
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151	NC_016629	CTGGA	2	10	257940	257949	20 %	20 %	40 %	20 %	374298614
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166	NC_016629	GCTCG	2	10	275289	275298	0 %	20 %	40 %	40 %	374298631
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