MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 1917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016629	CCTA	2	8	63	70	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016629	AACC	2	8	121	128	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016629	AGGG	2	8	3367	3374	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016629	ACCC	2	8	3408	3415	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_016629	CGAA	2	8	3458	3465	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016629	TGAT	3	12	9121	9132	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016629	CTCC	2	8	9289	9296	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_016629	AAGA	2	8	9960	9967	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016629	TGCC	2	8	10018	10025	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016629	TCGA	2	8	14969	14976	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016629	TCTT	2	8	21203	21210	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016629	CCGG	2	8	22914	22921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016629	CGGA	2	8	24010	24017	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016629	TACC	2	8	24079	24086	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016629	CGGC	2	8	24562	24569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016629	CGGG	2	8	25772	25779	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016629	AAAG	2	8	36091	36098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016629	CACC	2	8	36893	36900	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_016629	TCCT	2	8	48033	48040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016629	ACCA	2	8	48197	48204	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016629	GCAC	2	8	49006	49013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016629	GGTT	2	8	50786	50793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016629	AGCA	2	8	50832	50839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016629	TCGG	2	8	52354	52361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016629	GCAG	2	8	52911	52918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016629	CCTT	2	8	53417	53424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016629	GAAC	2	8	54706	54713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016629	GGGA	2	8	55079	55086	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016629	AGGG	2	8	57850	57857	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016629	GATT	2	8	61842	61849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016629	TCCA	2	8	66287	66294	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016629	CGGG	2	8	66662	66669	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016629	GCAT	2	8	66710	66717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016629	CTGG	2	8	68067	68074	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016629	ACCG	2	8	71168	71175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016629	GGCT	2	8	71179	71186	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016629	GAAG	2	8	73127	73134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016629	AGCA	2	8	73207	73214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016629	CAGC	2	8	73329	73336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016629	CTGT	2	8	76214	76221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016629	CTTA	2	8	79501	79508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016629	CAAG	2	8	79649	79656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016629	GTCG	2	8	87409	87416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016629	ACGA	2	8	99366	99373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016629	GGTT	2	8	103482	103489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016629	TGAC	2	8	110049	110056	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016629	CGGA	2	8	110205	110212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016629	GGAA	2	8	110234	110241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016629	GGCC	2	8	110307	110314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016629	GTTT	2	8	113451	113458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016629	CCGC	2	8	114635	114642	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_016629	TGCG	2	8	115601	115608	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016629	GACG	2	8	119776	119783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016629	CGCT	2	8	120274	120281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016629	GCTT	2	8	120283	120290	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016629	ACAA	2	8	122856	122863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016629	GCTC	2	8	123160	123167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016629	CACC	2	8	143927	143934	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_016629	CCGG	2	8	143981	143988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016629	TCCC	2	8	144024	144031	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
61	NC_016629	ATCA	2	8	158619	158626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016629	CTTG	2	8	160214	160221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016629	GGTT	2	8	161998	162005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016629	GATC	2	8	162038	162045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016629	AGGC	2	8	162799	162806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016629	CTGC	2	8	163730	163737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016629	AGGG	2	8	166747	166754	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016629	CCCT	2	8	166760	166767	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_016629	CTGG	2	8	168745	168752	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016629	GGGC	2	8	170550	170557	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016629	AGCA	2	8	170745	170752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016629	CGGG	2	8	173422	173429	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016629	GCCA	2	8	174249	174256	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016629	CGGG	2	8	176478	176485	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016629	CGCT	2	8	180180	180187	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016629	CCGA	2	8	180391	180398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016629	GGAT	2	8	186111	186118	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016629	ACCG	2	8	186172	186179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016629	CTCC	2	8	187480	187487	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_016629	ACTG	2	8	187518	187525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016629	TCCG	2	8	200519	200526	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016629	TCCT	2	8	206405	206412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016629	CCGC	2	8	213611	213618	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_016629	CTTT	2	8	213880	213887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016629	GACG	2	8	230125	230132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016629	AGGC	2	8	230191	230198	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016629	GGGC	2	8	230537	230544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016629	GCCG	2	8	234631	234638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016629	GCTG	2	8	234773	234780	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016629	TAGT	2	8	234882	234889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016629	CATG	2	8	236542	236549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016629	TGCA	2	8	236583	236590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016629	ATAA	2	8	238206	238213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016629	TGCA	2	8	238237	238244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016629	CGGG	2	8	247896	247903	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016629	CGCC	2	8	247944	247951	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_016629	CTAC	2	8	251675	251682	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016629	ATTT	2	8	252229	252236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016629	CCGG	2	8	261240	261247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016629	GCGA	2	8	264860	264867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016629	GCTT	2	8	266886	266893	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016629	CACG	2	8	268524	268531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016629	GAAC	2	8	269481	269488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016629	CGAC	2	8	275209	275216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016629	CTGT	2	8	278720	278727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016629	AGCC	2	8	281175	281182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016629	TGCA	2	8	281905	281912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016629	TCCG	2	8	283908	283915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016629	TGGA	2	8	284039	284046	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016629	CCCT	2	8	286349	286356	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_016629	CATG	2	8	290107	290114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016629	TGCA	2	8	295650	295657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016629	AAGC	2	8	298696	298703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016629	TGCC	2	8	303297	303304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016629	GCAC	2	8	307720	307727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016629	TACA	2	8	312496	312503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016629	CAGA	2	8	314714	314721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016629	TTCC	2	8	319629	319636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016629	TGCC	2	8	320724	320731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016629	CGGA	2	8	321192	321199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016629	TACA	2	8	321220	321227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016629	GCGT	2	8	326499	326506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016629	CTGA	2	8	326624	326631	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016629	CTGT	2	8	326633	326640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016629	AGGC	2	8	328770	328777	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016629	TGCT	2	8	334514	334521	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016629	ACAT	2	8	341922	341929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016629	CTAA	2	8	342101	342108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016629	TCAC	2	8	342791	342798	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016629	ACGC	2	8	343406	343413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016629	TTTC	2	8	348435	348442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016629	TGCG	2	8	348492	348499	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016629	TGCG	2	8	350329	350336	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016629	TGCA	2	8	350362	350369	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016629	TGCC	2	8	353195	353202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016629	GCTC	2	8	353209	353216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016629	CTTG	2	8	354210	354217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016629	GGGA	2	8	371569	371576	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016629	TCGG	2	8	380830	380837	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016629	ATAG	2	8	389165	389172	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016629	TCGT	2	8	389174	389181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016629	CACC	2	8	390153	390160	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_016629	TGCT	2	8	392997	393004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016629	ATTT	2	8	396982	396989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016629	TTTC	2	8	397056	397063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016629	TCCA	2	8	397822	397829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016629	CCGC	2	8	399128	399135	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_016629	ACGC	2	8	401660	401667	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016629	CGGC	2	8	402272	402279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016629	CGCC	2	8	402919	402926	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_016629	TCGC	2	8	418157	418164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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451	NC_016629	CACC	2	8	989915	989922	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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481	NC_016629	GGCA	2	8	1036255	1036262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
482	NC_016629	AAGC	2	8	1036266	1036273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
483	NC_016629	CCGC	2	8	1036298	1036305	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
484	NC_016629	GCCA	2	8	1038547	1038554	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
485	NC_016629	CGCA	2	8	1041480	1041487	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
486	NC_016629	GGCA	2	8	1043182	1043189	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
487	NC_016629	TGTT	2	8	1048288	1048295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
488	NC_016629	GGCA	2	8	1052465	1052472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
489	NC_016629	CACC	2	8	1059324	1059331	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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491	NC_016629	GCCT	2	8	1068430	1068437	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_016629	GCAA	2	8	1069763	1069770	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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494	NC_016629	TTCC	2	8	1090021	1090028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_016629	AATT	2	8	1090062	1090069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_016629	TGCG	2	8	1094295	1094302	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_016629	AGGC	2	8	1096184	1096191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_016629	TGCA	2	8	1098626	1098633	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_016629	CATG	2	8	1101182	1101189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
500	NC_016629	AAAC	2	8	1101246	1101253	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

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