MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 52809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016629	GCA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298387
2	NC_016629	TAC	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298387
3	NC_016629	GCC	2	6	380	385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298387
4	NC_016629	GCA	2	6	423	428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298387
5	NC_016629	GAT	2	6	575	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298387
6	NC_016629	TCA	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298387
7	NC_016629	TGC	2	6	718	723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298387
8	NC_016629	CCA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298387
9	NC_016629	GGA	2	6	868	873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298387
10	NC_016629	TCC	2	6	882	887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298387
11	NC_016629	GCT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298387
12	NC_016629	GCC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298387
13	NC_016629	GCA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298387
14	NC_016629	GCT	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298387
15	NC_016629	AAG	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298387
16	NC_016629	TTA	2	6	1921	1926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298388
17	NC_016629	GCC	2	6	1937	1942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298388
18	NC_016629	GCA	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298388
19	NC_016629	ACC	2	6	2123	2128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
20	NC_016629	GCA	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298388
21	NC_016629	CCA	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
22	NC_016629	CCA	2	6	2304	2309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
23	NC_016629	CCA	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
24	NC_016629	CGG	2	6	2370	2375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298388
25	NC_016629	CGC	2	6	2388	2393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298388
26	NC_016629	CGG	2	6	2400	2405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298388
27	NC_016629	TCC	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298388
28	NC_016629	GTC	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298389
29	NC_016629	CAG	2	6	2775	2780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298389
30	NC_016629	GCA	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298389
31	NC_016629	GCC	2	6	2843	2848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298389
32	NC_016629	CGG	2	6	2960	2965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298389
33	NC_016629	AGG	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298389
34	NC_016629	TGA	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298389
35	NC_016629	ATG	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298389
36	NC_016629	GCC	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298390
37	NC_016629	TGA	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298390
38	NC_016629	GCA	2	6	3867	3872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298390
39	NC_016629	GCG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298390
40	NC_016629	TGA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298390
41	NC_016629	TGG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298390
42	NC_016629	GCG	2	6	4038	4043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298390
43	NC_016629	CCA	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298390
44	NC_016629	TCC	2	6	4154	4159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298390
45	NC_016629	TCC	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298390
46	NC_016629	TCG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298390
47	NC_016629	GCC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298390
48	NC_016629	CGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298390
49	NC_016629	GGT	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298390
50	NC_016629	GTC	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298390
51	NC_016629	AAT	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298391
52	NC_016629	CCT	3	9	4623	4631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298391
53	NC_016629	GCA	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298391
54	NC_016629	CGG	2	6	4710	4715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298391
55	NC_016629	TGC	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298391
56	NC_016629	TCT	2	6	4770	4775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298391
57	NC_016629	CGC	2	6	4801	4806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298391
58	NC_016629	GCA	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298391
59	NC_016629	GTC	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298391
60	NC_016629	CAG	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298391
61	NC_016629	CCT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298391
62	NC_016629	CGC	2	6	5058	5063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298391
63	NC_016629	CGG	2	6	5064	5069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298391
64	NC_016629	TCA	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298392
65	NC_016629	CCG	2	6	5307	5312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298392
66	NC_016629	CCA	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
67	NC_016629	ATG	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298392
68	NC_016629	CGG	2	6	5464	5469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298392
69	NC_016629	CCA	2	6	5551	5556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
70	NC_016629	CGG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298392
71	NC_016629	CCA	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
72	NC_016629	CAC	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
73	NC_016629	CGT	3	9	5737	5745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298393
74	NC_016629	TCC	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298393
75	NC_016629	CCG	2	6	5896	5901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
76	NC_016629	GTA	2	6	5912	5917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298393
77	NC_016629	GTC	4	12	5918	5929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298393
78	NC_016629	CAC	2	6	5930	5935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298393
79	NC_016629	CTT	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298393
80	NC_016629	CGC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
81	NC_016629	TTG	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298393
82	NC_016629	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
83	NC_016629	ATG	2	6	6129	6134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298393
84	NC_016629	TCG	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298393
85	NC_016629	CGC	3	9	6298	6306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
86	NC_016629	CTT	2	6	6359	6364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298393
87	NC_016629	GCA	2	6	6729	6734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298394
88	NC_016629	AAT	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298394
89	NC_016629	TCC	2	6	6923	6928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298394
90	NC_016629	GGC	2	6	6931	6936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298394
91	NC_016629	GCC	2	6	7036	7041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298394
92	NC_016629	TTG	2	6	7136	7141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298394
93	NC_016629	CTT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298394
94	NC_016629	CTT	2	6	7216	7221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298394
95	NC_016629	GCC	2	6	7420	7425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
96	NC_016629	GCC	2	6	7491	7496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
97	NC_016629	GCC	2	6	7782	7787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
98	NC_016629	CCT	2	6	7893	7898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298395
99	NC_016629	TGG	2	6	7975	7980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298395
100	NC_016629	GCC	2	6	7987	7992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
101	NC_016629	CTG	2	6	7993	7998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298395
102	NC_016629	GAC	2	6	8005	8010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298395
103	NC_016629	TTG	2	6	8050	8055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298395
104	NC_016629	GCC	2	6	8068	8073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
105	NC_016629	TTC	2	6	8173	8178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298395
106	NC_016629	TGG	2	6	8257	8262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298395
107	NC_016629	ACT	2	6	8459	8464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298395
108	NC_016629	GGC	2	6	8572	8577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298395
109	NC_016629	TCA	2	6	8582	8587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298395
110	NC_016629	GAG	2	6	8620	8625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298395
111	NC_016629	GCT	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298395
112	NC_016629	ACG	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298396
113	NC_016629	GCG	2	6	9591	9596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298396
114	NC_016629	GGT	2	6	9661	9666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298396
115	NC_016629	CAT	2	6	9712	9717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298396
116	NC_016629	GCG	2	6	10172	10177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298397
117	NC_016629	ATT	2	6	10281	10286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298397
118	NC_016629	GCC	2	6	10335	10340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298397
119	NC_016629	GAC	2	6	10455	10460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298397
120	NC_016629	CTG	2	6	10481	10486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298397
121	NC_016629	CAT	2	6	10517	10522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298397
122	NC_016629	CGG	2	6	10547	10552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298397
123	NC_016629	GGA	2	6	10619	10624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298397
124	NC_016629	TGC	2	6	10815	10820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298397
125	NC_016629	ACA	2	6	10921	10926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298398
126	NC_016629	GCT	2	6	11209	11214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298398
127	NC_016629	TGC	2	6	11217	11222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298398
128	NC_016629	CAT	2	6	11284	11289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298398
129	NC_016629	GCT	2	6	11335	11340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298398
130	NC_016629	TCC	2	6	11430	11435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298398
131	NC_016629	CCG	3	9	11464	11472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298398
132	NC_016629	TGC	2	6	11553	11558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298398
133	NC_016629	TCA	2	6	11586	11591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298398
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135	NC_016629	CTT	2	6	11659	11664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298398
136	NC_016629	CTG	2	6	11699	11704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298398
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249	NC_016629	GCT	2	6	20992	20997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298407
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253	NC_016629	CTT	2	6	21356	21361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298408
254	NC_016629	TGA	2	6	21402	21407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298408
255	NC_016629	ACA	2	6	21422	21427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298408
256	NC_016629	ATT	2	6	21553	21558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298408
257	NC_016629	GCT	2	6	21611	21616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298408
258	NC_016629	CGC	2	6	21647	21652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298408
259	NC_016629	TGC	2	6	21731	21736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298408
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262	NC_016629	GGC	2	6	21844	21849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298408
263	NC_016629	GTC	2	6	21976	21981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298408
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270	NC_016629	TGC	2	6	22287	22292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298409
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274	NC_016629	GCT	2	6	22384	22389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298409
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278	NC_016629	CCT	2	6	22678	22683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298409
279	NC_016629	CGC	2	6	22702	22707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298409
280	NC_016629	CCG	2	6	22871	22876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298409
281	NC_016629	CCG	2	6	23098	23103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298410
282	NC_016629	CTC	2	6	23128	23133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298410
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284	NC_016629	TGA	2	6	23181	23186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298410
285	NC_016629	CGC	2	6	23190	23195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298410
286	NC_016629	GAA	2	6	23236	23241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298410
287	NC_016629	GGT	2	6	23343	23348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298410
288	NC_016629	TCG	2	6	23621	23626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298410
289	NC_016629	TTC	2	6	23675	23680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298410
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362	NC_016629	GCA	2	6	29982	29987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298415
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372	NC_016629	AGT	2	6	30829	30834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298416
373	NC_016629	CTC	2	6	30860	30865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298416
374	NC_016629	CCA	2	6	30932	30937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298416
375	NC_016629	GAT	2	6	30995	31000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298416
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