MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio furnissii NCTC 11218 chromosome 2

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016628	TGTCTG	2	12	12825	12836	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016628	CAACGA	2	12	18749	18760	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016628	CAAAAA	2	12	34727	34738	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016628	AGTGAG	2	12	39188	39199	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016628	GGCACT	2	12	49190	49201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016628	TACTTT	2	12	56225	56236	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016628	CCGGAA	2	12	56534	56545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016628	TAAGCA	2	12	66420	66431	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016628	TTTTCT	2	12	140939	140950	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016628	TCTGAT	2	12	142979	142990	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016628	CCAATC	3	18	145889	145906	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016628	TTTTTA	2	12	161645	161656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016628	CAAATG	2	12	222366	222377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016628	GATCAA	2	12	295688	295699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016628	ATACGA	2	12	366359	366370	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016628	GTACAA	2	12	385030	385041	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016628	GGAGAA	2	12	388110	388121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016628	GTTCCC	2	12	400513	400524	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016628	ACTTGA	2	12	400997	401008	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016628	CCACAC	2	12	421120	421131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016628	CTACAA	2	12	438841	438852	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016628	CCAGAG	2	12	447260	447271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016628	TGACAA	2	12	459028	459039	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016628	CGTCAT	2	12	497530	497541	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016628	TGTCTT	2	12	526239	526250	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016628	TAATAT	2	12	555142	555153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016628	ATTTTT	2	12	555168	555179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016628	CCACAC	2	12	568981	568992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016628	TATGAT	2	12	623503	623514	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016628	CACGCG	2	12	640263	640274	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016628	TCCCCC	2	12	657337	657348	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
32	NC_016628	TTCTGA	2	12	687364	687375	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016628	AATAAA	2	12	694239	694250	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016628	TCTGCC	2	12	711226	711237	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016628	TCGCGC	2	12	718207	718218	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016628	AGAAAA	2	12	718236	718247	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016628	AATTCA	2	12	745453	745464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016628	CAAAAA	2	12	745579	745590	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016628	TACTCA	2	12	775831	775842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016628	TAAATC	2	12	836301	836312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016628	ACAATA	2	12	839792	839803	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016628	GGAAAC	2	12	861147	861158	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016628	ACACAA	2	12	878324	878335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016628	CACCCC	2	12	892268	892279	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
45	NC_016628	AAATAA	2	12	922479	922490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016628	TGGGTG	2	12	951024	951035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016628	TTTCTA	2	12	955957	955968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016628	CCATCT	2	12	959949	959960	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016628	CAATAA	2	12	981039	981050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016628	GAAAAA	2	12	1024105	1024116	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016628	AAATCC	2	12	1133555	1133566	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016628	GGTGAG	2	12	1144218	1144229	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016628	CATCAA	2	12	1172207	1172218	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016628	TTTATT	2	12	1180527	1180538	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016628	TCTATA	2	12	1200307	1200318	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016628	CAATCG	2	12	1200833	1200844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016628	CAACGA	2	12	1232825	1232836	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016628	ACTGCC	2	12	1386235	1386246	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016628	CAAAGT	2	12	1389557	1389568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016628	CGGTTT	2	12	1441306	1441317	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016628	GAGAAA	2	12	1457037	1457048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016628	TATCTT	2	12	1469102	1469113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016628	TAAAAA	2	12	1475430	1475441	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016628	TTTACG	2	12	1510986	1510997	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016628	GACAAC	2	12	1512461	1512472	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016628	CACGGA	2	12	1539039	1539050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016628	ACGTAA	2	12	1542795	1542806	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016628	TTTGAT	2	12	1552844	1552855	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016628	ACTCTT	2	12	1600808	1600819	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016628	TGACTT	2	12	1611143	1611154	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016628	GAAGGT	2	12	1612958	1612969	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016628	AATATC	2	12	1615814	1615825	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.