MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio furnissii NCTC 11218 chromosome 2

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016628	TCCGC	2	10	93	102	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016628	TGCGT	2	10	4208	4217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016628	GTTGC	2	10	4251	4260	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016628	CAAAG	2	10	6545	6554	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016628	ACACA	2	10	10830	10839	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016628	CAAAG	2	10	24927	24936	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016628	ATTCC	2	10	26741	26750	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016628	TTTTG	2	10	34947	34956	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016628	CTTGG	2	10	35021	35030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016628	TTATG	2	10	39263	39272	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016628	GTTTA	2	10	47180	47189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016628	TGTTC	2	10	47683	47692	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016628	ATTTA	2	10	49078	49087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016628	CCTGA	2	10	49590	49599	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016628	TCAAA	2	10	56122	56131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016628	ATTTA	2	10	56617	56626	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016628	AGTCT	2	10	57317	57326	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016628	TCAAA	2	10	63929	63938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016628	ATTTC	2	10	71114	71123	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016628	GTTAC	2	10	84122	84131	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016628	AGGTA	2	10	86321	86330	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016628	ACAGT	2	10	91001	91010	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016628	ATTCT	2	10	121659	121668	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016628	AAAAT	2	10	135224	135233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016628	TTTGA	2	10	139984	139993	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016628	GTGCA	2	10	143554	143563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016628	TGAAA	2	10	148520	148529	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016628	TGATT	2	10	149254	149263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016628	GAAAG	2	10	150588	150597	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016628	AAACG	2	10	199317	199326	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016628	TAATT	2	10	200886	200895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016628	ATTGA	2	10	200993	201002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016628	GTTTG	2	10	214758	214767	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016628	CTTTT	2	10	224594	224603	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016628	GAAAA	2	10	224622	224631	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016628	ATGAT	2	10	227755	227764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016628	TCAAT	2	10	228629	228638	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016628	TAAAC	2	10	245344	245353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016628	ATTTG	2	10	260777	260786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016628	AATTT	2	10	263733	263742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016628	CTTTT	2	10	277010	277019	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016628	TCAAA	2	10	308513	308522	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016628	CTAGC	2	10	310972	310981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016628	ACATT	2	10	322897	322906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016628	AACTA	2	10	330173	330182	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016628	TTTAT	2	10	357668	357677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016628	TCTGA	2	10	373779	373788	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016628	TTTTG	2	10	381664	381673	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016628	TAAAG	2	10	381724	381733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016628	TGCGT	2	10	384857	384866	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016628	AGTTC	2	10	392698	392707	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016628	ACCCT	2	10	402234	402243	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016628	AAATG	2	10	415376	415385	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016628	TTTGG	2	10	416031	416040	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016628	GTTTT	2	10	416334	416343	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016628	AGCTT	2	10	416844	416853	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_016628	GCCCT	2	10	417665	417674	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_016628	GCCTT	2	10	454425	454434	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016628	AATTA	2	10	458648	458657	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016628	TTAAT	2	10	459883	459892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016628	CCATC	2	10	472740	472749	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_016628	ATCGA	2	10	473057	473066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016628	GAATT	2	10	498869	498878	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016628	AAGCC	2	10	531155	531164	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016628	GCGTC	2	10	535972	535981	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_016628	GAGCC	2	10	536024	536033	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016628	ACTTG	2	10	542293	542302	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016628	TTCCA	2	10	545096	545105	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016628	AAAAT	2	10	551571	551580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016628	CAAAA	2	10	555039	555048	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016628	CAAAC	2	10	562729	562738	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016628	AATGA	2	10	580897	580906	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016628	CAGAA	2	10	582188	582197	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016628	TTTCA	2	10	590708	590717	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016628	GTGCA	2	10	602177	602186	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016628	CTTTA	2	10	607127	607136	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016628	ATTCT	2	10	618506	618515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016628	TTTAA	2	10	622515	622524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016628	AATAA	2	10	630476	630485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016628	TTAGA	2	10	635090	635099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016628	AAGCA	2	10	635147	635156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016628	TGCTT	2	10	637549	637558	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016628	TTTAA	2	10	641628	641637	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016628	AATTT	2	10	646304	646313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016628	AATCA	2	10	646318	646327	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016628	TGGGC	2	10	664813	664822	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016628	ACGTG	2	10	665185	665194	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016628	TCAAT	2	10	668978	668987	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016628	AGTAA	2	10	669542	669551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016628	GAAGT	2	10	671383	671392	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016628	AAAAT	2	10	687159	687168	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016628	TTCAT	2	10	689761	689770	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016628	CATGA	2	10	693872	693881	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016628	ACTTA	2	10	694371	694380	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016628	CAAAC	2	10	702542	702551	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_016628	GGTCC	2	10	714173	714182	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_016628	TTCAA	2	10	718267	718276	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016628	ATTCC	2	10	745227	745236	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016628	GAGAA	2	10	745392	745401	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016628	CACGA	2	10	757569	757578	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016628	ATTGA	2	10	758755	758764	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016628	GCGTA	2	10	761388	761397	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016628	AAAAT	2	10	775216	775225	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016628	TATCT	2	10	775752	775761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016628	ATGAC	2	10	779372	779381	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016628	AAATT	2	10	782391	782400	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016628	TTTAT	2	10	782541	782550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016628	TAGAT	2	10	785392	785401	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016628	TTCGA	2	10	785809	785818	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016628	AGTGG	2	10	788661	788670	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016628	AATTG	2	10	796620	796629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016628	CCCCA	2	10	826702	826711	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
113	NC_016628	TTCAA	2	10	837174	837183	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016628	TTTTC	2	10	849333	849342	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016628	AAATT	2	10	863033	863042	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016628	CTATC	2	10	878265	878274	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016628	TTTTG	2	10	878753	878762	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016628	TTTTC	2	10	902650	902659	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016628	ATTTA	2	10	910189	910198	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016628	AATCA	2	10	910869	910878	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016628	CGCAC	2	10	929015	929024	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_016628	AAAGA	2	10	933799	933808	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016628	CCCCA	2	10	947900	947909	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_016628	TAAAA	2	10	981051	981060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016628	TCATC	2	10	989657	989666	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_016628	CGCCC	2	10	993394	993403	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
127	NC_016628	CATAC	2	10	995495	995504	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016628	GTCAT	2	10	997512	997521	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016628	AACAA	2	10	1003673	1003682	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016628	AAAAT	2	10	1003707	1003716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016628	TAGAT	2	10	1033743	1033752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016628	AAGAA	2	10	1035586	1035595	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016628	ATTCC	2	10	1041003	1041012	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
134	NC_016628	CTTTT	2	10	1044843	1044852	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016628	GCAGA	2	10	1048547	1048556	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016628	TGATC	2	10	1059389	1059398	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016628	GCGCT	2	10	1065913	1065922	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_016628	TTGAA	2	10	1067816	1067825	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016628	TGAAA	2	10	1076871	1076880	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016628	AAATT	2	10	1081436	1081445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016628	TGGGG	2	10	1087433	1087442	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016628	AAAAG	2	10	1091199	1091208	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016628	GACGT	2	10	1105309	1105318	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016628	AAGTG	2	10	1112635	1112644	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016628	CAAAA	2	10	1122732	1122741	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016628	AATGA	2	10	1132020	1132029	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016628	GTTTT	2	10	1145769	1145778	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_016628	GTTTT	2	10	1187382	1187391	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_016628	TCATT	2	10	1453488	1453497	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_016628	ATGTC	2	10	1466211	1466220	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_016628	ATGTT	2	10	1504991	1505000	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_016628	TCCTT	2	10	1505056	1505065	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
194	NC_016628	ACCTA	2	10	1523704	1523713	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
195	NC_016628	GTGCT	2	10	1532829	1532838	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
196	NC_016628	TAAGC	2	10	1535500	1535509	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
197	NC_016628	TGGAC	2	10	1549238	1549247	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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206	NC_016628	CGGTT	2	10	1597420	1597429	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
207	NC_016628	TTTTG	2	10	1598949	1598958	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_016628	TGGCA	2	10	1607734	1607743	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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216	NC_016628	TAGAG	2	10	1616427	1616436	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
217	NC_016628	GCAGT	2	10	1617267	1617276	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
218	NC_016628	TCGCT	2	10	1618041	1618050	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
219	NC_016628	TCGCT	2	10	1619922	1619931	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
220	NC_016628	TCCGC	2	10	1621127	1621136	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.