MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 1286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	GTATA	2	10	7421	7430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016627	ATTTT	2	10	7506	7515	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016627	ATATA	2	10	12859	12868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016627	TTACC	2	10	14961	14970	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016627	TAATT	2	10	15139	15148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016627	CAATT	2	10	23243	23252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016627	AATAT	2	10	32837	32846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016627	TATAT	2	10	32879	32888	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016627	GAATA	2	10	40964	40973	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016627	ATTTT	2	10	41200	41209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016627	ATATA	2	10	47462	47471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016627	AATTT	2	10	54900	54909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016627	ATAAA	2	10	63724	63733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016627	GCATT	2	10	65302	65311	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016627	TCCAT	2	10	71671	71680	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016627	ATAAA	2	10	78460	78469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016627	ACAAA	2	10	85426	85435	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016627	TTCAT	2	10	95714	95723	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016627	TAAAA	2	10	97547	97556	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016627	TTTGC	2	10	97699	97708	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016627	TATAA	2	10	99876	99885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016627	TATCG	2	10	102482	102491	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016627	ATAAA	2	10	106646	106655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016627	AGATG	2	10	113259	113268	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016627	ATAAA	2	10	113276	113285	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016627	CATAT	2	10	114328	114337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016627	GATAT	2	10	115893	115902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016627	TTAAG	2	10	120593	120602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016627	GCAAA	2	10	144020	144029	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016627	TTGAT	2	10	144067	144076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016627	TTCAT	2	10	144154	144163	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016627	GAAAA	2	10	154366	154375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016627	GTTAT	2	10	155335	155344	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016627	AATAA	2	10	156720	156729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016627	ATTTA	2	10	156783	156792	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016627	ATTAT	2	10	159253	159262	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016627	AATGA	2	10	162401	162410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016627	ATATA	2	10	164821	164830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016627	AATTA	2	10	165104	165113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016627	GTAAT	2	10	167223	167232	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016627	AGAGG	2	10	183663	183672	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016627	TAAAT	2	10	192922	192931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016627	AAGAA	2	10	206915	206924	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016627	AAAAG	2	10	213274	213283	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016627	ATTTT	2	10	213809	213818	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016627	CAATT	2	10	222712	222721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016627	TTAAT	2	10	223237	223246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016627	ATAAA	2	10	225520	225529	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016627	GACAT	2	10	230394	230403	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016627	ACTCC	2	10	236229	236238	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_016627	TGAAA	2	10	238242	238251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016627	ATCCT	2	10	241113	241122	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016627	TATTT	2	10	245578	245587	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016627	TTTTA	2	10	249196	249205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016627	TTTTA	2	10	250197	250206	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016627	AGGTA	2	10	252874	252883	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016627	ATATA	2	10	268534	268543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016627	TATAA	2	10	270108	270117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016627	ATATA	2	10	271050	271059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016627	TAATA	2	10	271888	271897	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016627	TAAAA	2	10	284129	284138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016627	GAAAA	2	10	293245	293254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016627	TGAAA	2	10	293255	293264	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016627	TTTCA	2	10	294688	294697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016627	GAATA	2	10	302906	302915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016627	TTAAT	2	10	307183	307192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016627	AAATA	2	10	309789	309798	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016627	ATATA	2	10	310184	310193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016627	GCCAA	2	10	333981	333990	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016627	TCTAT	2	10	336444	336453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_016627	TATAT	2	10	340650	340659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016627	TTATA	2	10	342321	342330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016627	ATATA	2	10	342438	342447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016627	TTGTA	2	10	353559	353568	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016627	AAATA	2	10	355349	355358	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016627	ATAAC	2	10	356751	356760	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016627	TATAT	2	10	357969	357978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016627	AAAGG	2	10	359083	359092	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016627	TTACT	2	10	360046	360055	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016627	TCCAA	2	10	363571	363580	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016627	AAAAG	2	10	373762	373771	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016627	AAATT	2	10	375544	375553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016627	GTATT	2	10	379822	379831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016627	TAAAT	2	10	379862	379871	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016627	ACTTC	2	10	379953	379962	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016627	ATATT	2	10	399488	399497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016627	GCTGT	2	10	402433	402442	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016627	ATTTT	2	10	405523	405532	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016627	TAAAA	2	10	410676	410685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016627	CAAAT	2	10	412375	412384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016627	CTTGA	2	10	412448	412457	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016627	AAAAC	2	10	412642	412651	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016627	ACTTT	2	10	412840	412849	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016627	TCTAT	2	10	416893	416902	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016627	ATTAT	2	10	417125	417134	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016627	TACAA	2	10	422580	422589	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016627	AGATG	2	10	438994	439003	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016627	TAAAA	2	10	443682	443691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016627	CATTT	2	10	450768	450777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016627	GCAAA	2	10	462670	462679	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016627	CATTT	2	10	462804	462813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016627	AATCC	2	10	476629	476638	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016627	GGAGA	2	10	476693	476702	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016627	AATCC	2	10	477560	477569	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016627	GGAGA	2	10	477624	477633	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016627	AAGAT	2	10	479820	479829	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016627	TAATT	2	10	494474	494483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016627	ATTGT	2	10	507538	507547	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016627	TTTTA	2	10	508300	508309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016627	AGTTT	2	10	510905	510914	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016627	TCTAC	2	10	514055	514064	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_016627	AAATA	2	10	514438	514447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016627	AAATT	2	10	519014	519023	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016627	TAATT	2	10	519946	519955	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016627	AATTG	2	10	522638	522647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016627	TTTTA	2	10	537939	537948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016627	AAATA	2	10	544118	544127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016627	TTTTG	2	10	546785	546794	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016627	ATTTT	2	10	551390	551399	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016627	GAAAA	2	10	557696	557705	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016627	AAAGT	2	10	558183	558192	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016627	TATAC	2	10	558282	558291	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016627	TTACT	2	10	564490	564499	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016627	CAGAA	2	10	567615	567624	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016627	AGAAT	2	10	567650	567659	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016627	TAAAA	2	10	568409	568418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016627	AAGTT	2	10	568468	568477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016627	TACAA	2	10	571052	571061	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016627	AAATA	2	10	571223	571232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016627	TTTAT	2	10	577027	577036	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016627	TGAAA	2	10	579686	579695	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016627	TTTGT	2	10	581362	581371	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016627	AGTGT	2	10	581981	581990	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016627	TCCAA	2	10	582002	582011	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016627	AAAGT	2	10	582097	582106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016627	TGAAA	2	10	590723	590732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016627	TATAT	2	10	591143	591152	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016627	ATTAA	2	10	595060	595069	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016627	TAATA	2	10	595537	595546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016627	TGAAA	2	10	596669	596678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016627	TATAA	2	10	601520	601529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016627	TTTCT	2	10	606160	606169	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_016627	TTCTA	2	10	606502	606511	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_016627	TTATT	2	10	610337	610346	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016627	TATAA	2	10	612506	612515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016627	TTTAA	2	10	612777	612786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016627	TAGAA	2	10	613499	613508	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016627	TGAAA	2	10	622465	622474	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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