MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 2902

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	ATGTT	2	10	2462	2471	20 %	60 %	20 %	0 %	374294495
2	NC_016627	AAATC	2	10	2957	2966	60 %	20 %	0 %	20 %	374294495
3	NC_016627	TGCAA	2	10	6212	6221	40 %	20 %	20 %	20 %	374294499
4	NC_016627	AAACT	2	10	6460	6469	60 %	20 %	0 %	20 %	374294499
5	NC_016627	AATAC	2	10	8242	8251	60 %	20 %	0 %	20 %	374294500
6	NC_016627	AATAT	2	10	9001	9010	60 %	40 %	0 %	0 %	374294501
7	NC_016627	TAAAG	2	10	9092	9101	60 %	20 %	20 %	0 %	374294501
8	NC_016627	ATTGC	2	10	10019	10028	20 %	40 %	20 %	20 %	374294502
9	NC_016627	TATTG	2	10	10591	10600	20 %	60 %	20 %	0 %	374294503
10	NC_016627	ATGCA	2	10	10953	10962	40 %	20 %	20 %	20 %	374294503
11	NC_016627	AGAAA	2	10	11612	11621	80 %	0 %	20 %	0 %	374294504
12	NC_016627	GATAA	2	10	11789	11798	60 %	20 %	20 %	0 %	374294504
13	NC_016627	TTTTC	2	10	14719	14728	0 %	80 %	0 %	20 %	374294505
14	NC_016627	CCTAT	2	10	16236	16245	20 %	40 %	0 %	40 %	374294506
15	NC_016627	CATTC	2	10	16567	16576	20 %	40 %	0 %	40 %	374294506
16	NC_016627	ATTTT	2	10	17042	17051	20 %	80 %	0 %	0 %	374294507
17	NC_016627	AAAGT	2	10	18155	18164	60 %	20 %	20 %	0 %	374294507
18	NC_016627	AATAC	2	10	19405	19414	60 %	20 %	0 %	20 %	374294507
19	NC_016627	TCTTA	2	10	21900	21909	20 %	60 %	0 %	20 %	374294508
20	NC_016627	TAAAA	2	10	22133	22142	80 %	20 %	0 %	0 %	374294508
21	NC_016627	TAATT	2	10	22169	22178	40 %	60 %	0 %	0 %	374294508
22	NC_016627	TGCCT	2	10	25655	25664	0 %	40 %	20 %	40 %	374294511
23	NC_016627	ATGAA	2	10	31101	31110	60 %	20 %	20 %	0 %	374294514
24	NC_016627	TTTTA	2	10	32943	32952	20 %	80 %	0 %	0 %	374294517
25	NC_016627	ATTAC	2	10	37442	37451	40 %	40 %	0 %	20 %	374294520
26	NC_016627	GATAA	2	10	37945	37954	60 %	20 %	20 %	0 %	374294521
27	NC_016627	AGGTA	2	10	38069	38078	40 %	20 %	40 %	0 %	374294521
28	NC_016627	TTTTA	2	10	39078	39087	20 %	80 %	0 %	0 %	374294523
29	NC_016627	ATTAT	2	10	41889	41898	40 %	60 %	0 %	0 %	374294525
30	NC_016627	TATTT	2	10	43102	43111	20 %	80 %	0 %	0 %	374294527
31	NC_016627	AAGGG	2	10	44356	44365	40 %	0 %	60 %	0 %	374294528
32	NC_016627	TAGTT	2	10	46598	46607	20 %	60 %	20 %	0 %	374294530
33	NC_016627	TGAAA	2	10	46757	46766	60 %	20 %	20 %	0 %	374294530
34	NC_016627	AAAAT	2	10	52357	52366	80 %	20 %	0 %	0 %	374294534
35	NC_016627	TAAAA	2	10	53096	53105	80 %	20 %	0 %	0 %	374294534
36	NC_016627	GGTTG	2	10	54409	54418	0 %	40 %	60 %	0 %	374294535
37	NC_016627	TGTTT	2	10	56147	56156	0 %	80 %	20 %	0 %	374294536
38	NC_016627	AAATA	2	10	56911	56920	80 %	20 %	0 %	0 %	374294537
39	NC_016627	TAGTT	2	10	58917	58926	20 %	60 %	20 %	0 %	374294538
40	NC_016627	TTTAA	2	10	63162	63171	40 %	60 %	0 %	0 %	374294543
41	NC_016627	AAAGG	2	10	64881	64890	60 %	0 %	40 %	0 %	374294544
42	NC_016627	GTATA	2	10	66469	66478	40 %	40 %	20 %	0 %	374294546
43	NC_016627	AATTT	2	10	68382	68391	40 %	60 %	0 %	0 %	374294547
44	NC_016627	CTTTT	2	10	68692	68701	0 %	80 %	0 %	20 %	374294547
45	NC_016627	TTTCC	2	10	71948	71957	0 %	60 %	0 %	40 %	374294550
46	NC_016627	AGTAT	2	10	72176	72185	40 %	40 %	20 %	0 %	374294550
47	NC_016627	ATTTT	2	10	73248	73257	20 %	80 %	0 %	0 %	374294550
48	NC_016627	AATAA	2	10	73397	73406	80 %	20 %	0 %	0 %	374294550
49	NC_016627	TATTG	2	10	75959	75968	20 %	60 %	20 %	0 %	374294553
50	NC_016627	ATTGC	2	10	80363	80372	20 %	40 %	20 %	20 %	374294557
51	NC_016627	CAGAA	2	10	81364	81373	60 %	0 %	20 %	20 %	374294558
52	NC_016627	TCCTT	2	10	82602	82611	0 %	60 %	0 %	40 %	374294560
53	NC_016627	AGTCG	2	10	84400	84409	20 %	20 %	40 %	20 %	374294562
54	NC_016627	CAAAG	2	10	85526	85535	60 %	0 %	20 %	20 %	374294564
55	NC_016627	GCTGA	2	10	86077	86086	20 %	20 %	40 %	20 %	374294564
56	NC_016627	CCATT	2	10	86343	86352	20 %	40 %	0 %	40 %	374294564
57	NC_016627	CCATT	2	10	87965	87974	20 %	40 %	0 %	40 %	374294566
58	NC_016627	ATCTC	2	10	89466	89475	20 %	40 %	0 %	40 %	374294566
59	NC_016627	TGAGT	2	10	91066	91075	20 %	40 %	40 %	0 %	374294568
60	NC_016627	TATTG	2	10	95065	95074	20 %	60 %	20 %	0 %	374294570
61	NC_016627	CAGGA	2	10	96641	96650	40 %	0 %	40 %	20 %	374294571
62	NC_016627	AAGAA	2	10	98637	98646	80 %	0 %	20 %	0 %	374294572
63	NC_016627	ATTCT	2	10	103277	103286	20 %	60 %	0 %	20 %	374294576
64	NC_016627	TTTAT	2	10	106106	106115	20 %	80 %	0 %	0 %	374294578
65	NC_016627	CAATA	2	10	107980	107989	60 %	20 %	0 %	20 %	374294580
66	NC_016627	CAAGG	2	10	108105	108114	40 %	0 %	40 %	20 %	374294580
67	NC_016627	GGACA	2	10	108135	108144	40 %	0 %	40 %	20 %	374294580
68	NC_016627	CAAGA	2	10	110724	110733	60 %	0 %	20 %	20 %	374294583
69	NC_016627	ATTTT	2	10	112398	112407	20 %	80 %	0 %	0 %	374294585
70	NC_016627	TAATA	2	10	115133	115142	60 %	40 %	0 %	0 %	374294589
71	NC_016627	GTACG	2	10	118160	118169	20 %	20 %	40 %	20 %	374294593
72	NC_016627	TTACT	2	10	118574	118583	20 %	60 %	0 %	20 %	374294593
73	NC_016627	CCTTC	2	10	119411	119420	0 %	40 %	0 %	60 %	374294594
74	NC_016627	TTCAG	2	10	119726	119735	20 %	40 %	20 %	20 %	374294594
75	NC_016627	TCATT	2	10	119757	119766	20 %	60 %	0 %	20 %	374294594
76	NC_016627	GAAGC	2	10	122790	122799	40 %	0 %	40 %	20 %	374294598
77	NC_016627	TATTT	2	10	122860	122869	20 %	80 %	0 %	0 %	374294598
78	NC_016627	ATCCA	2	10	123086	123095	40 %	20 %	0 %	40 %	374294598
79	NC_016627	TTATA	2	10	123415	123424	40 %	60 %	0 %	0 %	374294599
80	NC_016627	CGGTT	2	10	124094	124103	0 %	40 %	40 %	20 %	374294599
81	NC_016627	AATTT	2	10	126173	126182	40 %	60 %	0 %	0 %	374294601
82	NC_016627	TACAA	2	10	127714	127723	60 %	20 %	0 %	20 %	374294602
83	NC_016627	GTATA	2	10	130151	130160	40 %	40 %	20 %	0 %	374294603
84	NC_016627	GAAAA	2	10	138581	138590	80 %	0 %	20 %	0 %	374294610
85	NC_016627	GAAAT	2	10	138706	138715	60 %	20 %	20 %	0 %	374294610
86	NC_016627	GACTT	2	10	139300	139309	20 %	40 %	20 %	20 %	374294611
87	NC_016627	GTATT	2	10	140348	140357	20 %	60 %	20 %	0 %	374294612
88	NC_016627	GGAAG	2	10	140587	140596	40 %	0 %	60 %	0 %	374294612
89	NC_016627	ACTTA	2	10	141285	141294	40 %	40 %	0 %	20 %	374294612
90	NC_016627	AAGCA	2	10	147331	147340	60 %	0 %	20 %	20 %	374294618
91	NC_016627	AAAAT	2	10	147737	147746	80 %	20 %	0 %	0 %	374294618
92	NC_016627	GTGAT	2	10	149394	149403	20 %	40 %	40 %	0 %	374294619
93	NC_016627	GATGT	2	10	150291	150300	20 %	40 %	40 %	0 %	374294620
94	NC_016627	GAAAA	2	10	152466	152475	80 %	0 %	20 %	0 %	374294621
95	NC_016627	AAGAC	2	10	153300	153309	60 %	0 %	20 %	20 %	374294622
96	NC_016627	AAAGA	2	10	155506	155515	80 %	0 %	20 %	0 %	374294624
97	NC_016627	ATTAT	2	10	157370	157379	40 %	60 %	0 %	0 %	374294625
98	NC_016627	AATTT	2	10	160563	160572	40 %	60 %	0 %	0 %	374294628
99	NC_016627	TTTCT	2	10	161103	161112	0 %	80 %	0 %	20 %	374294629
100	NC_016627	AATCA	2	10	162450	162459	60 %	20 %	0 %	20 %	374294631
101	NC_016627	ATGTA	2	10	162823	162832	40 %	40 %	20 %	0 %	374294631
102	NC_016627	ATAGA	2	10	163153	163162	60 %	20 %	20 %	0 %	374294631
103	NC_016627	CAACC	2	10	163951	163960	40 %	0 %	0 %	60 %	374294633
104	NC_016627	GATTA	2	10	163969	163978	40 %	40 %	20 %	0 %	374294633
105	NC_016627	ATATT	2	10	166511	166520	40 %	60 %	0 %	0 %	374294636
106	NC_016627	ATGTA	2	10	167058	167067	40 %	40 %	20 %	0 %	374294637
107	NC_016627	TTATA	2	10	172382	172391	40 %	60 %	0 %	0 %	374294644
108	NC_016627	AAAAG	2	10	174175	174184	80 %	0 %	20 %	0 %	374294647
109	NC_016627	GCAAT	2	10	175823	175832	40 %	20 %	20 %	20 %	374294650
110	NC_016627	GACAA	2	10	177881	177890	60 %	0 %	20 %	20 %	374294653
111	NC_016627	ATTAT	2	10	180962	180971	40 %	60 %	0 %	0 %	374294656
112	NC_016627	AAAAC	2	10	181247	181256	80 %	0 %	0 %	20 %	374294657
113	NC_016627	GGTAA	2	10	181267	181276	40 %	20 %	40 %	0 %	374294657
114	NC_016627	TTATC	2	10	181503	181512	20 %	60 %	0 %	20 %	374294657
115	NC_016627	GAAAA	2	10	181852	181861	80 %	0 %	20 %	0 %	374294657
116	NC_016627	AAATC	2	10	186206	186215	60 %	20 %	0 %	20 %	374294661
117	NC_016627	GAACA	2	10	186245	186254	60 %	0 %	20 %	20 %	374294661
118	NC_016627	TTTTA	2	10	186827	186836	20 %	80 %	0 %	0 %	374294662
119	NC_016627	ATGCA	2	10	187114	187123	40 %	20 %	20 %	20 %	374294662
120	NC_016627	AATTT	2	10	187311	187320	40 %	60 %	0 %	0 %	374294662
121	NC_016627	AAGAC	2	10	187491	187500	60 %	0 %	20 %	20 %	374294662
122	NC_016627	AAGGC	2	10	189919	189928	40 %	0 %	40 %	20 %	374294664
123	NC_016627	ATAAA	2	10	192182	192191	80 %	20 %	0 %	0 %	374294666
124	NC_016627	GAAAT	2	10	194250	194259	60 %	20 %	20 %	0 %	374294667
125	NC_016627	GCATA	2	10	195375	195384	40 %	20 %	20 %	20 %	374294668
126	NC_016627	AAGAA	2	10	197063	197072	80 %	0 %	20 %	0 %	374294669
127	NC_016627	CATTT	2	10	197777	197786	20 %	60 %	0 %	20 %	374294669
128	NC_016627	ATTTT	2	10	200304	200313	20 %	80 %	0 %	0 %	374294671
129	NC_016627	ATGAT	2	10	203694	203703	40 %	40 %	20 %	0 %	374294675
130	NC_016627	GTATA	2	10	204280	204289	40 %	40 %	20 %	0 %	374294675
131	NC_016627	GTATG	2	10	205123	205132	20 %	40 %	40 %	0 %	374294675
132	NC_016627	TTTGT	2	10	205534	205543	0 %	80 %	20 %	0 %	374294675
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134	NC_016627	GTTGA	2	10	205676	205685	20 %	40 %	40 %	0 %	374294675
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