MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 13238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	TAAT	2	8	304	311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016627	TTAA	2	8	432	439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016627	TTAC	2	8	540	547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016627	TACA	2	8	776	783	50 %	25 %	0 %	25 %	374294494
5	NC_016627	ATGC	2	8	1035	1042	25 %	25 %	25 %	25 %	374294494
6	NC_016627	AGAA	2	8	1220	1227	75 %	0 %	25 %	0 %	374294494
7	NC_016627	CAAA	3	12	1270	1281	75 %	0 %	0 %	25 %	374294494
8	NC_016627	AAGA	2	8	2297	2304	75 %	0 %	25 %	0 %	374294495
9	NC_016627	CTTC	2	8	2652	2659	0 %	50 %	0 %	50 %	374294495
10	NC_016627	GAAA	2	8	3575	3582	75 %	0 %	25 %	0 %	374294496
11	NC_016627	CAGG	2	8	3796	3803	25 %	0 %	50 %	25 %	374294497
12	NC_016627	AAAT	2	8	3940	3947	75 %	25 %	0 %	0 %	374294497
13	NC_016627	TAAA	2	8	5270	5277	75 %	25 %	0 %	0 %	374294498
14	NC_016627	TAAA	2	8	5305	5312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016627	ATTT	2	8	5404	5411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016627	GTAA	2	8	5898	5905	50 %	25 %	25 %	0 %	374294499
17	NC_016627	ATTT	2	8	6171	6178	25 %	75 %	0 %	0 %	374294499
18	NC_016627	ACAA	2	8	6452	6459	75 %	0 %	0 %	25 %	374294499
19	NC_016627	ATTT	2	8	7525	7532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016627	ATTA	2	8	7645	7652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016627	GAGT	2	8	7807	7814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016627	CCTG	2	8	7892	7899	0 %	25 %	25 %	50 %	374294500
23	NC_016627	TAAT	2	8	8009	8016	50 %	50 %	0 %	0 %	374294500
24	NC_016627	AGTT	2	8	8315	8322	25 %	50 %	25 %	0 %	374294500
25	NC_016627	CCAA	2	8	8711	8718	50 %	0 %	0 %	50 %	374294501
26	NC_016627	TAAA	3	12	9542	9553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016627	AAAT	2	8	9571	9578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016627	ATGT	2	8	9664	9671	25 %	50 %	25 %	0 %	374294502
29	NC_016627	TAAT	2	8	9690	9697	50 %	50 %	0 %	0 %	374294502
30	NC_016627	TATT	2	8	9715	9722	25 %	75 %	0 %	0 %	374294502
31	NC_016627	ATTA	2	8	9920	9927	50 %	50 %	0 %	0 %	374294502
32	NC_016627	GAAA	2	8	9932	9939	75 %	0 %	25 %	0 %	374294502
33	NC_016627	TGTT	2	8	10199	10206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016627	ATTA	2	8	10219	10226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016627	TAAT	2	8	10264	10271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016627	TCAT	2	8	10388	10395	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016627	TAAA	2	8	10629	10636	75 %	25 %	0 %	0 %	374294503
38	NC_016627	AAAT	2	8	10654	10661	75 %	25 %	0 %	0 %	374294503
39	NC_016627	ATAA	2	8	11278	11285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016627	TGAT	2	8	11468	11475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016627	GATA	2	8	11554	11561	50 %	25 %	25 %	0 %	374294504
42	NC_016627	TAAA	2	8	11838	11845	75 %	25 %	0 %	0 %	374294504
43	NC_016627	GCAG	2	8	12350	12357	25 %	0 %	50 %	25 %	374294504
44	NC_016627	GTAT	2	8	12832	12839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016627	TTTA	2	8	12928	12935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016627	AATT	2	8	13002	13009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016627	AATT	2	8	13501	13508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016627	GCCA	2	8	13829	13836	25 %	0 %	25 %	50 %	374294505
49	NC_016627	CCCT	2	8	14049	14056	0 %	25 %	0 %	75 %	374294505
50	NC_016627	ATTA	2	8	15249	15256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016627	AATT	2	8	15291	15298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016627	TTGT	2	8	15792	15799	0 %	75 %	25 %	0 %	374294506
53	NC_016627	CAGT	2	8	15879	15886	25 %	25 %	25 %	25 %	374294506
54	NC_016627	CATA	2	8	16219	16226	50 %	25 %	0 %	25 %	374294506
55	NC_016627	ATCC	2	8	16374	16381	25 %	25 %	0 %	50 %	374294506
56	NC_016627	ATTC	2	8	16711	16718	25 %	50 %	0 %	25 %	374294506
57	NC_016627	ATCA	2	8	16962	16969	50 %	25 %	0 %	25 %	374294507
58	NC_016627	TTCT	2	8	17075	17082	0 %	75 %	0 %	25 %	374294507
59	NC_016627	GATT	2	8	18868	18875	25 %	50 %	25 %	0 %	374294507
60	NC_016627	TCTG	2	8	19715	19722	0 %	50 %	25 %	25 %	374294507
61	NC_016627	TTCC	2	8	19751	19758	0 %	50 %	0 %	50 %	374294507
62	NC_016627	CCTT	2	8	19927	19934	0 %	50 %	0 %	50 %	374294507
63	NC_016627	GTCT	2	8	20013	20020	0 %	50 %	25 %	25 %	374294507
64	NC_016627	TCTA	2	8	20292	20299	25 %	50 %	0 %	25 %	374294507
65	NC_016627	TATT	2	8	20627	20634	25 %	75 %	0 %	0 %	374294507
66	NC_016627	TTTC	2	8	20890	20897	0 %	75 %	0 %	25 %	374294507
67	NC_016627	TAGG	2	8	21092	21099	25 %	25 %	50 %	0 %	374294507
68	NC_016627	CATA	2	8	21356	21363	50 %	25 %	0 %	25 %	374294507
69	NC_016627	ATTA	2	8	21445	21452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016627	ATTG	2	8	21740	21747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016627	TAAT	2	8	23124	23131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016627	AATT	2	8	23204	23211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016627	CAAA	2	8	23506	23513	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016627	TAAA	2	8	25118	25125	75 %	25 %	0 %	0 %	374294511
75	NC_016627	AATA	2	8	25901	25908	75 %	25 %	0 %	0 %	374294511
76	NC_016627	ATTT	2	8	26039	26046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016627	TTAG	2	8	26105	26112	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016627	TTTG	2	8	27348	27355	0 %	75 %	25 %	0 %	374294513
79	NC_016627	TAAA	2	8	27483	27490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016627	CAAT	2	8	27833	27840	50 %	25 %	0 %	25 %	374294514
81	NC_016627	ATGG	2	8	29780	29787	25 %	25 %	50 %	0 %	374294514
82	NC_016627	TCCG	2	8	29952	29959	0 %	25 %	25 %	50 %	374294514
83	NC_016627	TAAA	2	8	30396	30403	75 %	25 %	0 %	0 %	374294514
84	NC_016627	CCTG	2	8	30419	30426	0 %	25 %	25 %	50 %	374294514
85	NC_016627	GTAT	2	8	30468	30475	25 %	50 %	25 %	0 %	374294514
86	NC_016627	GACA	2	8	30843	30850	50 %	0 %	25 %	25 %	374294514
87	NC_016627	TTAA	2	8	31415	31422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016627	ATTT	2	8	31446	31453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016627	AAAT	2	8	31775	31782	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016627	TTAT	2	8	31904	31911	25 %	75 %	0 %	0 %	374294516
91	NC_016627	ACAA	2	8	32084	32091	75 %	0 %	0 %	25 %	374294516
92	NC_016627	TACT	2	8	32199	32206	25 %	50 %	0 %	25 %	374294516
93	NC_016627	CTTT	2	8	32257	32264	0 %	75 %	0 %	25 %	374294516
94	NC_016627	TTGC	2	8	32384	32391	0 %	50 %	25 %	25 %	374294516
95	NC_016627	TAAT	2	8	32517	32524	50 %	50 %	0 %	0 %	374294516
96	NC_016627	ATTT	2	8	32770	32777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016627	TGAT	2	8	32851	32858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016627	CTTA	2	8	33620	33627	25 %	50 %	0 %	25 %	374294517
99	NC_016627	TAAG	2	8	33931	33938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016627	TAAA	2	8	34332	34339	75 %	25 %	0 %	0 %	374294518
101	NC_016627	ATAA	2	8	34348	34355	75 %	25 %	0 %	0 %	374294518
102	NC_016627	TAAA	2	8	34374	34381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016627	AAAC	2	8	34416	34423	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016627	AAAT	2	8	34472	34479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016627	ATTT	2	8	34716	34723	25 %	75 %	0 %	0 %	374294519
106	NC_016627	AAGG	2	8	34824	34831	50 %	0 %	50 %	0 %	374294519
107	NC_016627	GAAA	2	8	35459	35466	75 %	0 %	25 %	0 %	374294519
108	NC_016627	ATTT	2	8	35557	35564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016627	TATT	2	8	35672	35679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016627	CATA	2	8	35985	35992	50 %	25 %	0 %	25 %	374294520
111	NC_016627	TCAT	2	8	36931	36938	25 %	50 %	0 %	25 %	374294520
112	NC_016627	TGCA	2	8	37047	37054	25 %	25 %	25 %	25 %	374294520
113	NC_016627	AATT	2	8	37642	37649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016627	ATAG	2	8	38499	38506	50 %	25 %	25 %	0 %	374294521
115	NC_016627	GGAT	2	8	38591	38598	25 %	25 %	50 %	0 %	374294521
116	NC_016627	AAAT	2	8	38649	38656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016627	TTTA	2	8	39144	39151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016627	GATT	2	8	39213	39220	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016627	GAAA	2	8	40164	40171	75 %	0 %	25 %	0 %	374294524
120	NC_016627	ATTT	2	8	40701	40708	25 %	75 %	0 %	0 %	374294524
121	NC_016627	AATT	2	8	41226	41233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016627	GAAT	3	12	41637	41648	50 %	25 %	25 %	0 %	374294525
123	NC_016627	GGAA	2	8	41933	41940	50 %	0 %	50 %	0 %	374294525
124	NC_016627	ATAA	2	8	42804	42811	75 %	25 %	0 %	0 %	374294526
125	NC_016627	TAGA	2	8	43424	43431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016627	TAAA	2	8	44076	44083	75 %	25 %	0 %	0 %	374294528
127	NC_016627	AAAT	2	8	44449	44456	75 %	25 %	0 %	0 %	374294528
128	NC_016627	ATTT	2	8	44815	44822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016627	GAAA	2	8	46434	46441	75 %	0 %	25 %	0 %	374294529
130	NC_016627	TTAT	2	8	46525	46532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016627	AAAT	2	8	47336	47343	75 %	25 %	0 %	0 %	374294530
132	NC_016627	TTAA	2	8	47443	47450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016627	TTCT	2	8	47562	47569	0 %	75 %	0 %	25 %	374294531
134	NC_016627	GCTG	2	8	47731	47738	0 %	25 %	50 %	25 %	374294531
135	NC_016627	TATG	2	8	48407	48414	25 %	50 %	25 %	0 %	374294532
136	NC_016627	GAAA	2	8	48462	48469	75 %	0 %	25 %	0 %	374294532
137	NC_016627	GAAA	2	8	49759	49766	75 %	0 %	25 %	0 %	374294532
138	NC_016627	GATA	2	8	51212	51219	50 %	25 %	25 %	0 %	374294534
139	NC_016627	GAAA	2	8	51480	51487	75 %	0 %	25 %	0 %	374294534
140	NC_016627	TTAA	2	8	52779	52786	50 %	50 %	0 %	0 %	374294534
141	NC_016627	AAAG	2	8	54666	54673	75 %	0 %	25 %	0 %	374294535
142	NC_016627	GATT	2	8	54934	54941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016627	CAAG	2	8	54993	55000	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016627	AGCC	2	8	55259	55266	25 %	0 %	25 %	50 %	374294536
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146	NC_016627	ATCA	2	8	55789	55796	50 %	25 %	0 %	25 %	374294536
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