MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium clariflavum DSM 19732 chromosome

Total Repeats: 63686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016627	ATT	2	6	132	137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016627	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016627	CAA	2	6	189	194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016627	TTG	2	6	199	204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016627	ATT	2	6	216	221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016627	TAA	3	9	261	269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016627	ACA	2	6	282	287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016627	TAA	2	6	291	296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016627	ATT	3	9	369	377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016627	TAT	2	6	409	414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016627	ATC	2	6	532	537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016627	GGA	2	6	556	561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016627	ATA	2	6	682	687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294494
14	NC_016627	TGT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294494
15	NC_016627	TGG	2	6	1004	1009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294494
16	NC_016627	TGC	2	6	1057	1062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294494
17	NC_016627	TCA	2	6	1071	1076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294494
18	NC_016627	TCT	2	6	1095	1100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294494
19	NC_016627	TTA	2	6	1120	1125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294494
20	NC_016627	GAA	2	6	1149	1154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
21	NC_016627	GAT	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294494
22	NC_016627	GAA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
23	NC_016627	TTC	2	6	1239	1244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294494
24	NC_016627	GAA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
25	NC_016627	ATT	2	6	1452	1457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294494
26	NC_016627	CAA	2	6	1594	1599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294494
27	NC_016627	AGA	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
28	NC_016627	TAC	2	6	1796	1801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294494
29	NC_016627	GAA	2	6	1830	1835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294494
30	NC_016627	CAA	3	9	1965	1973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016627	CAA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016627	ATT	2	6	2148	2153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016627	TAA	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016627	TTA	2	6	2240	2245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016627	TAT	2	6	2247	2252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016627	TAC	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294495
37	NC_016627	AAG	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
38	NC_016627	TTC	2	6	2569	2574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294495
39	NC_016627	GTA	2	6	2874	2879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294495
40	NC_016627	TAC	2	6	2914	2919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294495
41	NC_016627	GAA	2	6	2928	2933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
42	NC_016627	ATT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294495
43	NC_016627	GAA	2	6	3123	3128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
44	NC_016627	ATT	2	6	3171	3176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294495
45	NC_016627	GGA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294495
46	NC_016627	TAC	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294495
47	NC_016627	GAT	2	6	3291	3296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294495
48	NC_016627	GAA	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294495
49	NC_016627	AAC	2	6	3357	3362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294495
50	NC_016627	TAA	2	6	3524	3529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294496
51	NC_016627	ACA	2	6	3614	3619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294496
52	NC_016627	ATT	2	6	3768	3773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294497
53	NC_016627	AAC	2	6	3849	3854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294497
54	NC_016627	AAG	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
55	NC_016627	AAT	2	6	3905	3910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
56	NC_016627	AGA	3	9	4047	4055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
57	NC_016627	GCA	2	6	4106	4111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294497
58	NC_016627	ATA	2	6	4227	4232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
59	NC_016627	TAA	2	6	4301	4306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
60	NC_016627	ATT	2	6	4324	4329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294497
61	NC_016627	AGA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
62	NC_016627	AAT	2	6	4418	4423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
63	NC_016627	ATA	2	6	4557	4562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
64	NC_016627	AGA	2	6	4565	4570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294497
65	NC_016627	TGA	2	6	4598	4603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294497
66	NC_016627	AAT	2	6	4656	4661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294497
67	NC_016627	TTA	2	6	4672	4677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294497
68	NC_016627	TAT	2	6	4824	4829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016627	TTA	2	6	4856	4861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016627	AGG	2	6	4993	4998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016627	TGG	2	6	5018	5023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294498
72	NC_016627	TGT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294498
73	NC_016627	CTA	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294498
74	NC_016627	GAT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294498
75	NC_016627	TAT	2	6	5168	5173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294498
76	NC_016627	TAA	2	6	5316	5321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016627	TTA	2	6	5362	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016627	AGG	2	6	5422	5427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016627	ATG	2	6	5464	5469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294499
80	NC_016627	TCA	2	6	5541	5546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294499
81	NC_016627	AAT	2	6	5573	5578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294499
82	NC_016627	GGA	2	6	5760	5765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294499
83	NC_016627	ACT	2	6	5946	5951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294499
84	NC_016627	GAA	2	6	6075	6080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
85	NC_016627	ATT	2	6	6114	6119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294499
86	NC_016627	AAG	2	6	6148	6153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
87	NC_016627	ACA	2	6	6262	6267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294499
88	NC_016627	ATT	2	6	6352	6357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294499
89	NC_016627	CTG	2	6	6409	6414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294499
90	NC_016627	TAA	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294499
91	NC_016627	AAG	2	6	6485	6490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
92	NC_016627	AGA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
93	NC_016627	CAG	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294499
94	NC_016627	AGC	2	6	6599	6604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294499
95	NC_016627	AAG	2	6	6626	6631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
96	NC_016627	ACA	2	6	6651	6656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294499
97	NC_016627	GGA	2	6	6735	6740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294499
98	NC_016627	AGA	2	6	6762	6767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
99	NC_016627	ATT	2	6	6927	6932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294499
100	NC_016627	AGA	2	6	7070	7075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294499
101	NC_016627	AGC	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294499
102	NC_016627	AAT	2	6	7827	7832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294500
103	NC_016627	ACT	2	6	7870	7875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294500
104	NC_016627	CTT	2	6	7921	7926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294500
105	NC_016627	ATG	2	6	8000	8005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294500
106	NC_016627	ATA	2	6	8156	8161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294500
107	NC_016627	TAT	3	9	8181	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294500
108	NC_016627	CCA	2	6	8197	8202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294500
109	NC_016627	CAG	2	6	8234	8239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294500
110	NC_016627	AGT	2	6	8358	8363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294500
111	NC_016627	AGA	2	6	8409	8414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294500
112	NC_016627	GAG	2	6	8578	8583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294500
113	NC_016627	GAA	2	6	8649	8654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294501
114	NC_016627	TGG	2	6	8663	8668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294501
115	NC_016627	GAA	2	6	8720	8725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294501
116	NC_016627	TGA	3	9	8729	8737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294501
117	NC_016627	AGA	2	6	8804	8809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294501
118	NC_016627	TTG	2	6	8824	8829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294501
119	NC_016627	AGA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294501
120	NC_016627	AGC	2	6	8849	8854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294501
121	NC_016627	AGA	2	6	8948	8953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294501
122	NC_016627	AGA	2	6	8966	8971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294501
123	NC_016627	AAG	2	6	9016	9021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374294501
124	NC_016627	CAA	2	6	9052	9057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374294501
125	NC_016627	ATA	2	6	9066	9071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294501
126	NC_016627	AGC	2	6	9126	9131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294501
127	NC_016627	GAT	2	6	9159	9164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294501
128	NC_016627	ATT	2	6	9195	9200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294501
129	NC_016627	GAT	2	6	9312	9317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294501
130	NC_016627	AAT	2	6	9374	9379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294501
131	NC_016627	ATT	2	6	9388	9393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294501
132	NC_016627	ATT	2	6	9422	9427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294501
133	NC_016627	AAC	2	6	9515	9520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016627	TAA	2	6	9592	9597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_016627	TTC	2	6	18060	18065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294507
264	NC_016627	TAA	2	6	18072	18077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294507
265	NC_016627	TGC	2	6	18078	18083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294507
266	NC_016627	ACG	2	6	18127	18132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294507
267	NC_016627	CTT	2	6	18139	18144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294507
268	NC_016627	GTT	2	6	18147	18152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374294507
269	NC_016627	ACC	2	6	18240	18245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294507
270	NC_016627	ATG	2	6	18411	18416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294507
271	NC_016627	AGG	2	6	18417	18422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294507
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273	NC_016627	GCC	2	6	18687	18692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294507
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275	NC_016627	TTA	2	6	18878	18883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294507
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279	NC_016627	TCA	2	6	19078	19083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294507
280	NC_016627	TCC	2	6	19092	19097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374294507
281	NC_016627	AAT	2	6	19247	19252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374294507
282	NC_016627	AGC	2	6	19257	19262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294507
283	NC_016627	ATG	2	6	19374	19379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294507
284	NC_016627	GGT	2	6	19445	19450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374294507
285	NC_016627	TGC	2	6	19485	19490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294507
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287	NC_016627	CTT	2	6	19649	19654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294507
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291	NC_016627	GTA	2	6	19969	19974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294507
292	NC_016627	TCA	2	6	20119	20124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294507
293	NC_016627	TTC	2	6	20135	20140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294507
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299	NC_016627	ATC	3	9	20437	20445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294507
300	NC_016627	TAT	2	6	20532	20537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374294507
301	NC_016627	TCT	2	6	20557	20562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374294507
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343	NC_016627	ATA	2	6	23267	23272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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