MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016626	GTGAGT	2	12	7743	7754	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016626	TGGGCG	2	12	32628	32639	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016626	ACGGCA	2	12	133290	133301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016626	CGTTCG	2	12	133498	133509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016626	TCACGC	2	12	186899	186910	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016626	ATCGAG	2	12	218222	218233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016626	CGATCC	2	12	234273	234284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016626	TCGGCA	2	12	325773	325784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016626	ACCGGC	2	12	326024	326035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016626	AGCGCG	2	12	378121	378132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016626	ACCGGA	2	12	381017	381028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016626	GTGTTT	2	12	404415	404426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016626	GCGGCA	2	12	413059	413070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016626	CGGCAT	2	12	475558	475569	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016626	TGGCGC	2	12	501604	501615	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016626	TGCGGC	2	12	536244	536255	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016626	TCGTTG	2	12	543655	543666	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016626	GTTGAA	2	12	556894	556905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016626	CTCAGT	2	12	568127	568138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016626	GGGACA	2	12	570260	570271	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016626	CTTGCG	2	12	725134	725145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016626	GCGCGA	2	12	748183	748194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016626	TGCGTG	2	12	754093	754104	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016626	GCACAA	2	12	897018	897029	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016626	ACGCGC	2	12	917779	917790	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016626	GCGTGC	2	12	918625	918636	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016626	GTGGAG	2	12	970012	970023	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016626	CCTGCG	2	12	970314	970325	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016626	GCGGTC	2	12	1010876	1010887	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016626	CCTGAT	2	12	1046941	1046952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016626	GTTTTT	2	12	1059690	1059701	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016626	CGGCTG	2	12	1082865	1082876	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016626	TCACTT	2	12	1091616	1091627	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016626	CATGAC	2	12	1093370	1093381	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016626	TCAAGG	2	12	1095903	1095914	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016626	TGCCGA	2	12	1096426	1096437	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016626	GAGCAA	2	12	1103086	1103097	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016626	CGAAAC	2	12	1152762	1152773	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016626	GCGAAC	2	12	1180190	1180201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016626	CTTCGT	2	12	1206041	1206052	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016626	CCCGCG	2	12	1279507	1279518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_016626	GAAACC	2	12	1315372	1315383	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016626	GCTTGC	2	12	1356508	1356519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016626	GGCGTA	9	54	1386473	1386526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016626	GGCGTT	2	12	1386527	1386538	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016626	GGAGTC	4	24	1386539	1386562	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016626	GGCACA	2	12	1386587	1386598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016626	TGCGCG	2	12	1435973	1435984	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016626	TGAGCC	2	12	1438599	1438610	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016626	CGGCGT	2	12	1503645	1503656	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016626	ACTCAC	2	12	1516139	1516150	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016626	AATAAA	2	12	1523612	1523623	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016626	CCGCGG	2	12	1527805	1527816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016626	TGCCGG	2	12	1540405	1540416	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016626	CGAACC	2	12	1569766	1569777	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016626	GCGGTT	2	12	1573957	1573968	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016626	GGTCGA	2	12	1574216	1574227	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016626	TGCCGC	2	12	1591280	1591291	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016626	TGCGCT	2	12	1659145	1659156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016626	CGTGCG	2	12	1662016	1662027	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016626	AGCTTG	2	12	1668884	1668895	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016626	TCCATC	2	12	1672194	1672205	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016626	AGACGC	2	12	1682764	1682775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016626	GCATGC	2	12	1691087	1691098	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016626	TCCAGG	2	12	1698888	1698899	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016626	TCGAGT	2	12	1699708	1699719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016626	CCTGCA	2	12	1720539	1720550	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016626	GCACCT	2	12	1735976	1735987	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016626	TGATAC	2	12	1736140	1736151	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016626	GCCGTC	2	12	1744196	1744207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016626	GATTCA	2	12	1757203	1757214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016626	GGTGGG	2	12	1765735	1765746	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016626	CGACCC	2	12	1767728	1767739	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016626	GTCGCG	2	12	1767783	1767794	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016626	CTTCCG	2	12	1790203	1790214	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016626	AGGTGA	2	12	1797428	1797439	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016626	CCGGGA	2	12	1811052	1811063	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016626	GTGAGT	2	12	1814858	1814869	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016626	ATGTCG	2	12	1816156	1816167	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016626	CGTGTG	2	12	1818174	1818185	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016626	CAGTGG	2	12	1825587	1825598	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016626	TAGGTC	2	12	1858566	1858577	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016626	AGTCGA	2	12	1872360	1872371	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016626	TATAGC	2	12	1893111	1893122	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016626	GCTTCC	2	12	1919718	1919729	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016626	TTCGGT	2	12	1927791	1927802	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016626	GCGGCA	2	12	1933861	1933872	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016626	CAGACG	2	12	1937374	1937385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016626	CACTTT	2	12	1947011	1947022	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016626	TCGCCG	2	12	1950066	1950077	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.