MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p

Total Repeats: 268

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016626	TGACG	2	10	91	100	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016626	GTCCG	2	10	187	196	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016626	ATTGA	2	10	2157	2166	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016626	GCGTT	2	10	24597	24606	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016626	CGTCT	2	10	25565	25574	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016626	GCATC	2	10	25596	25605	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016626	CGAAG	2	10	25769	25778	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016626	GAGCA	2	10	32861	32870	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016626	CCGGC	2	10	54724	54733	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016626	CGTTT	2	10	95454	95463	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016626	GGCCT	2	10	102545	102554	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016626	CGAGA	2	10	105780	105789	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016626	GCGTC	2	10	116476	116485	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016626	TGCTT	2	10	122798	122807	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016626	GCCGC	2	10	133867	133876	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_016626	CGTTC	2	10	133911	133920	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016626	GGCGC	2	10	146437	146446	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016626	GGCAT	2	10	194549	194558	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016626	TCGCG	2	10	194885	194894	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016626	AACAC	2	10	195287	195296	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016626	GCTTC	2	10	196427	196436	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016626	AAGAC	2	10	200648	200657	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016626	GGCGC	2	10	217925	217934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016626	AGCCC	2	10	222532	222541	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_016626	GGGCA	2	10	232338	232347	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016626	GAAGA	2	10	232359	232368	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016626	CGAAT	2	10	235239	235248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016626	ATCAG	2	10	280557	280566	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016626	GCCAT	2	10	283138	283147	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016626	GCGTA	2	10	283156	283165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016626	GCGCG	2	10	283207	283216	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016626	CGACC	2	10	294984	294993	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
33	NC_016626	CGGCA	2	10	297445	297454	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016626	AGGCG	2	10	358866	358875	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016626	TCCGG	2	10	361652	361661	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016626	AGGCG	2	10	380732	380741	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016626	CGACC	2	10	382356	382365	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
38	NC_016626	GCGAG	2	10	390432	390441	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016626	AGCGG	2	10	404451	404460	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016626	GGGCC	2	10	404829	404838	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016626	TGAAA	2	10	407541	407550	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016626	CTTTG	2	10	407563	407572	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016626	AAAAC	2	10	419945	419954	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016626	TTTGT	2	10	438200	438209	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016626	GCGGG	2	10	444669	444678	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016626	ATTCA	2	10	485865	485874	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016626	CGGCG	2	10	501665	501674	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016626	GAGCA	2	10	504449	504458	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016626	TGCAG	2	10	507405	507414	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016626	GCGCG	2	10	536201	536210	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016626	TCGTG	2	10	536448	536457	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016626	CCCGG	2	10	543681	543690	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016626	ATGCG	2	10	553269	553278	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016626	CCATT	2	10	564351	564360	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016626	GTCGC	2	10	570108	570117	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016626	ATCGC	2	10	580927	580936	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016626	TCACA	2	10	611020	611029	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016626	AGCCC	2	10	612301	612310	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_016626	GTTGA	2	10	620562	620571	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016626	ATCCG	2	10	639372	639381	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016626	CGCGT	2	10	640020	640029	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016626	GCAAC	2	10	649496	649505	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016626	GCATC	2	10	659201	659210	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016626	TCAAA	2	10	664541	664550	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016626	GCGCC	2	10	672655	672664	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_016626	ACGCC	2	10	685908	685917	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_016626	AGAGG	2	10	688194	688203	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016626	TCAAC	2	10	690553	690562	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016626	GTCTC	2	10	696735	696744	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016626	GATTT	2	10	716586	716595	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016626	GCGCG	2	10	717470	717479	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016626	GTCAA	2	10	744220	744229	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016626	AAGCG	2	10	747955	747964	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016626	ATTTT	2	10	761316	761325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016626	CGTGT	2	10	774399	774408	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016626	GCGCC	2	10	774625	774634	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_016626	GAGAA	2	10	792021	792030	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016626	TGCCC	2	10	801733	801742	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_016626	GTCTC	2	10	803377	803386	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016626	CGGTC	2	10	810059	810068	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016626	GGCGC	2	10	810345	810354	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016626	CCTTC	2	10	810481	810490	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
83	NC_016626	AGACG	2	10	815476	815485	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016626	GCCAT	2	10	817508	817517	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_016626	GCGCG	2	10	827314	827323	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
86	NC_016626	ACGCA	2	10	827367	827376	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016626	CGTTT	2	10	856841	856850	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016626	TCAGG	2	10	860546	860555	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016626	CCGCT	2	10	883004	883013	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_016626	ACCTG	2	10	917557	917566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016626	ATTGC	2	10	923172	923181	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016626	GGCGC	2	10	937285	937294	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016626	CGGTT	2	10	940688	940697	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016626	ACGTC	2	10	944801	944810	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016626	CCGCG	2	10	949502	949511	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_016626	CGGGG	2	10	951305	951314	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_016626	CGGGG	2	10	951783	951792	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016626	CCCCG	2	10	952294	952303	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
99	NC_016626	CGGTG	2	10	970375	970384	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016626	AGAGG	2	10	974002	974011	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016626	TCTCC	2	10	975625	975634	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
102	NC_016626	ACTCG	2	10	985745	985754	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_016626	GCCCT	2	10	988115	988124	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_016626	CGGCG	2	10	1010700	1010709	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016626	TTTTG	2	10	1019441	1019450	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016626	CGGGG	2	10	1019510	1019519	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016626	CCCCG	2	10	1020022	1020031	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
108	NC_016626	GCGAT	2	10	1037114	1037123	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016626	TCCAT	2	10	1039796	1039805	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_016626	TTCGT	2	10	1051155	1051164	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016626	CGGGG	2	10	1059746	1059755	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016626	CGCCT	2	10	1092409	1092418	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_016626	CCGAT	2	10	1093506	1093515	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016626	GTCTT	2	10	1095832	1095841	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016626	CACGT	2	10	1100143	1100152	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016626	TCACG	2	10	1100157	1100166	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016626	GGCCG	2	10	1103999	1104008	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
118	NC_016626	TGCTT	2	10	1120145	1120154	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016626	TTGCT	2	10	1120159	1120168	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016626	CTTTG	3	15	1120172	1120186	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016626	CGGGG	2	10	1120239	1120248	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016626	CCCCG	2	10	1120715	1120724	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
123	NC_016626	GCCGC	2	10	1135416	1135425	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_016626	TTGCT	2	10	1138485	1138494	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016626	CCCCG	2	10	1152710	1152719	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
126	NC_016626	GCGTC	2	10	1157856	1157865	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016626	ATCGC	2	10	1169491	1169500	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016626	AAACG	2	10	1173262	1173271	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016626	ACGCG	2	10	1173327	1173336	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
130	NC_016626	GATGT	2	10	1185717	1185726	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016626	TCGAT	2	10	1216241	1216250	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016626	CGAAG	2	10	1216723	1216732	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016626	TTCGC	2	10	1222934	1222943	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_016626	CTCTT	2	10	1251561	1251570	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016626	GAAGT	2	10	1268248	1268257	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016626	CGGGG	2	10	1275637	1275646	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016626	CCCCG	2	10	1276141	1276150	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
138	NC_016626	AAAAG	2	10	1297485	1297494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016626	CGCAG	2	10	1339597	1339606	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
140	NC_016626	CCGCG	2	10	1342267	1342276	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_016626	GATCG	2	10	1357444	1357453	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016626	CTGCA	2	10	1362938	1362947	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_016626	GCATC	2	10	1365732	1365741	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_016626	TCACG	2	10	1374394	1374403	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_016626	GATCA	2	10	1375884	1375893	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016626	ATTCG	2	10	1376641	1376650	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016626	GAACG	2	10	1380272	1380281	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_016626	TCGAA	2	10	1398527	1398536	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_016626	TAGAC	2	10	1403218	1403227	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_016626	ACGCG	2	10	1407389	1407398	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
151	NC_016626	CTTCA	2	10	1409353	1409362	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_016626	GCGCG	2	10	1417048	1417057	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
153	NC_016626	CGCGC	2	10	1417179	1417188	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
154	NC_016626	CAGGA	2	10	1432302	1432311	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_016626	GATTC	2	10	1444352	1444361	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_016626	CGCGC	2	10	1444476	1444485	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
157	NC_016626	GCGCC	2	10	1445277	1445286	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
158	NC_016626	GCGCC	2	10	1450592	1450601	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
159	NC_016626	GGCGC	2	10	1456059	1456068	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
160	NC_016626	CGAAA	2	10	1461294	1461303	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_016626	CTGCA	2	10	1480441	1480450	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
162	NC_016626	TCGTT	2	10	1495370	1495379	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
163	NC_016626	TGCGC	3	15	1503398	1503412	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
164	NC_016626	AACGA	2	10	1510725	1510734	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
165	NC_016626	TTCAA	2	10	1521340	1521349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_016626	CGGAC	2	10	1523311	1523320	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
167	NC_016626	CGTCA	2	10	1523407	1523416	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
168	NC_016626	TTGCG	2	10	1525545	1525554	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
169	NC_016626	TTCGT	2	10	1532826	1532835	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
170	NC_016626	CCGTC	2	10	1533688	1533697	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
171	NC_016626	GTGCA	2	10	1540522	1540531	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_016626	CAAAG	2	10	1542175	1542184	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_016626	CAAGA	2	10	1542854	1542863	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
174	NC_016626	GCGCC	2	10	1547516	1547525	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
175	NC_016626	CGCGG	2	10	1549526	1549535	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
176	NC_016626	CTTGA	2	10	1571075	1571084	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_016626	TGCGC	2	10	1572600	1572609	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
178	NC_016626	CGATG	2	10	1573144	1573153	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
179	NC_016626	AACAT	2	10	1575204	1575213	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
180	NC_016626	CATTC	2	10	1578859	1578868	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
181	NC_016626	TGATC	2	10	1583889	1583898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
182	NC_016626	GGCTG	2	10	1591613	1591622	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
183	NC_016626	TGCGT	2	10	1602340	1602349	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
184	NC_016626	ATGAC	2	10	1602891	1602900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_016626	CCGGC	2	10	1602980	1602989	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
186	NC_016626	CGCCC	2	10	1625525	1625534	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
187	NC_016626	AGCAC	2	10	1626065	1626074	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_016626	TTCAT	2	10	1627272	1627281	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_016626	AACTC	2	10	1645835	1645844	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_016626	CAGCG	2	10	1656131	1656140	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
192	NC_016626	ATCGA	2	10	1656654	1656663	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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194	NC_016626	GCGCG	2	10	1658881	1658890	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
195	NC_016626	CGCTA	2	10	1661684	1661693	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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199	NC_016626	CCTCG	2	10	1682233	1682242	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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245	NC_016626	AACTG	2	10	1870570	1870579	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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248	NC_016626	CAGCG	2	10	1883439	1883448	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
249	NC_016626	CCGCT	2	10	1889316	1889325	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
250	NC_016626	CGGGC	2	10	1891780	1891789	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
251	NC_016626	CGAAA	2	10	1894369	1894378	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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253	NC_016626	GCTCC	2	10	1912194	1912203	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
254	NC_016626	AGTGA	2	10	1919069	1919078	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
255	NC_016626	CGATG	2	10	1921204	1921213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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262	NC_016626	AACGA	2	10	1936746	1936755	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_016626	TTCGT	2	10	1941588	1941597	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
264	NC_016626	CCGTC	2	10	1942450	1942459	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
265	NC_016626	TGTCA	2	10	1947297	1947306	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
266	NC_016626	CGGGC	2	10	1949678	1949687	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
267	NC_016626	GCAAA	2	10	1950697	1950706	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
268	NC_016626	CATCG	2	10	1950945	1950954	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.